(2S,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-[(2S,3R,4S,5S,6R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6R)-6-[[3,4-bis[bis(carboxymethyl)amino]benzoyl]amino]-4,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-4-hydroxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]oxane-2-carboxylic acid | 1374980-50-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (2S,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-[(2S,3R,4S,5S,6R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6R)-6-[[3,4-bis[bis(carboxymethyl)amino]benzoyl]amino]-4,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-4-hydroxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]oxane-2-carboxylic acid
• CAS: 1374980-50-3
• 化学式: C₃₈H₅₄N₄O₂₇
• 分子量: 998.857
• InChiKey: YKBPPZUUKUCRKW-MPWCXAPOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.9
• 重原子数：
  69
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.66
• 拓扑面积：
  500
• 氢给体数：
  17
• 氢受体数：
  29

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  C₆₇H₉₂N₄O₃₇ 在 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 以83%的产率得到(2S,4S,5R,6R)-5-acetamido-2-[(2S,3R,4S,5S,6R)-2-[(2R,3S,4R,5R,6R)-6-[[3,4-bis[bis(carboxymethyl)amino]benzoyl]amino]-4,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-4-hydroxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]oxane-2-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  Lanthanide-assisted NMR evaluation of a dynamic ensemble of oligosaccharide conformations

  摘要：

  本文提出了一种新的方法，通过镧系元素辅助核磁共振光谱与分子动力学（MD）模拟相结合来评估寡糖构象的动态组合。利用 GM3 三糖获得的结果表明，假接触位移测量为验证高柔性生物大分子的 MD 模拟提供了一种宝贵的实验工具。

  DOI：

  10.1039/c2cc30353a