| 1350625-95-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• CAS: 1350625-95-4
• 化学式: C₂₇H₂₆N₂O₆
• 分子量: 474.513
• InChiKey: YIGIUSXNOFSXFY-JEACLXLTSA-N

物化性质

• 沸点：
  776.2±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.327±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.22
• 重原子数：
  35.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  124.96
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  在 sodium acetate 、 乙酸酐 作用下， 生成
  参考文献：
  名称：

  Rationale-Based, De Novo Design of Dehydrophenylalanine-Containing Antibiotic Peptides and Systematic Modification in Sequence for Enhanced Potency

  摘要：

  摘要 微生物耐药性的增加催生了全球对新型抗感染药物的需求。作为开发新型低分子质量多肽抗生素努力的一部分，我们采用基于理性的极简方法设计出了短小、不溶血、强效、广谱且血清稳定性更高的抗生素多肽。这些多肽被设计成螺旋构象的两性结构。以 VS1 为先导化合物，将其特性与通过以下方法获得的三个系列衍生物进行了比较：(i) N 端氨基酸添加；(ii) 系统性 Trp 取代；(iii) 肽树枝化。Trp 取代方法强调了 VS2 在效力、更快的膜渗透性和成本效益方面的优化序列。研究发现，VS2（VS1 的变体，有两个 Trp 取代）对革兰氏阴性的 大肠杆菌 和革兰氏阳性细菌 金黄色葡萄球菌 .研究还发现它具有非细胞溶解活性以及渗透和去极化细菌膜的能力。透射电子显微镜证实了该肽对细菌细胞壁和内膜的裂解作用。小尺寸、非天然氨基酸的存在、高抗菌活性、微量溶血和抗蛋白水解等特性为 从头 为从头设计一种可用于治疗传染病的抗菌肽提供了基本信息。

  DOI：

  10.1128/aac.01493-10
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-L-丙氨酸 在 N-甲基吗啉 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 0.17h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Rationale-Based, De Novo Design of Dehydrophenylalanine-Containing Antibiotic Peptides and Systematic Modification in Sequence for Enhanced Potency

  摘要：

  摘要 微生物耐药性的增加催生了全球对新型抗感染药物的需求。作为开发新型低分子质量多肽抗生素努力的一部分，我们采用基于理性的极简方法设计出了短小、不溶血、强效、广谱且血清稳定性更高的抗生素多肽。这些多肽被设计成螺旋构象的两性结构。以 VS1 为先导化合物，将其特性与通过以下方法获得的三个系列衍生物进行了比较：(i) N 端氨基酸添加；(ii) 系统性 Trp 取代；(iii) 肽树枝化。Trp 取代方法强调了 VS2 在效力、更快的膜渗透性和成本效益方面的优化序列。研究发现，VS2（VS1 的变体，有两个 Trp 取代）对革兰氏阴性的 大肠杆菌 和革兰氏阳性细菌 金黄色葡萄球菌 .研究还发现它具有非细胞溶解活性以及渗透和去极化细菌膜的能力。透射电子显微镜证实了该肽对细菌细胞壁和内膜的裂解作用。小尺寸、非天然氨基酸的存在、高抗菌活性、微量溶血和抗蛋白水解等特性为 从头 为从头设计一种可用于治疗传染病的抗菌肽提供了基本信息。

  DOI：

  10.1128/aac.01493-10

文献信息

• Reverse Engineering Truncations of an Antimicrobial Peptide Dimer to Identify the Origins of Potency and Broad Spectrum of Action
  作者：Aparna Anantharaman、Dinkar Sahal

  DOI：10.1021/jm100483y

  日期：2010.8.26

  Antimicrobial peptides hold promise against antibiotic resistant pathogens. Here, to find the physicochemical origins of potency and broad spectrum antimicrobial action, we report the structure activity relationships of synthetic intermediates (peptides A D) of a potent lysine branched dimeric antibacterial peptide Delta Fd. Our studies show that a tetracationic character in a weak helical fold (peptide C) elicits potent but narrow spectrum antimicrobial activity [Minimum inhibitory concentrations (MICs) E. coli 10 mu M, S. aureus > 100 mu M]. In contrast, a hexacationic character in a strong, amphipathic helix (Delta Fd) confers potent and broad spectrum action [MICs E. coli 2.5 mu M, S. aureus. 5 mu M]. While Delta Fd caused rapid and potent permeabilization of the E. coli membranes, the less helical intermediates (peptides A D) showed slow and weak to no responses. Two seminal findings that may aid future drug design are (a) at identical helicity, increasing charge enhanced outer membrane permeabilization, and (b) at identical charge, increasing helicity stimulated rate of outer membrane permeabilization and kill kinetics besides enhancing potency leading to broad spectrum action.