N-α-(aminocaproly)-N-(2,2,5,7,8-pentamethylchroman-6-sulfonyl)arginine methyl ester | 221665-16-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-α-(aminocaproly)-N-(2,2,5,7,8-pentamethylchroman-6-sulfonyl)arginine methyl ester
• 英文别名: NH2-(CH2)5COArg(Pmc)OMe
• CAS: 221665-16-3
• 化学式: C₂₇H₄₅N₅O₆S
• 分子量: 567.75
• InChiKey: YUQOIGQDTACOPN-NRFANRHFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.48
• 重原子数：
  39.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  172.7
• 氢给体数：
  5.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-α-(aminocaproly)-N-(2,2,5,7,8-pentamethylchroman-6-sulfonyl)arginine methyl ester 、 3,8-Diamino-6-(3-carboxy-phenyl)-5-methyl-phenanthridinium; chloride 在 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 18.0h， 以78%的产率得到9-[3-[[[N-(2,2,5,7,8-pentamethylchroman-6-sulfonyl)arginine methyl ester]-aminocaproyl]keto]phenyl]-2,7-diamino-10-methylphenanthridine chloride
  参考文献：
  名称：

  乙丙氨酸精氨酸结合物的合成及其抗HIV-1 TAR RNA的活性。

  摘要：

  调节蛋白Tat对于1型人类免疫缺陷病毒（HIV-1）的病毒基因表达和复制至关重要。Tat通过结合HIV-1长末端重复序列（LTR）与反式激活反应元件（TAR）而激活，并增加了病毒转录。研究表明，精氨酸和精氨酸衍生物的结合在Tat结合位点诱导TAR RNA的构象变化。未配对的A17残基界定了一个小空腔，该空腔构成了小分子（尤其是溴化乙锭）的受体位点。这些结合特性促使我们设计了一系列能够与TAR RNA相互作用的乙氨酸-精氨酸结合物。在这里，我们报告配备精氨酸侧链的六个乙锭衍生物的合成。对这些分子进行了生物学评估，和两种化合物（17和20）在微摩尔浓度下显示出抗HIV-1的体外活性，没有毒性（最高100 microM浓度）。熔融温度研究表明，活性最高的分子（20）在体外与TAR牢固结合。RNase保护实验与分子模型研究一致，该分子模型研究表明20的乙啶部分插入A17残基旁边，而精氨酸侧链占据了嘧啶凸起。

  DOI：

  10.1021/jm980728e
• 作为产物：
  描述：

  N-α-[N-(benzyloxycarbonyl)aminocaproyl]-N-(2,2,5,7,8-pentamethylchroman-6-sulfonyl)arginine 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 caesium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 15.0h， 生成 N-α-(aminocaproly)-N-(2,2,5,7,8-pentamethylchroman-6-sulfonyl)arginine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  乙丙氨酸精氨酸结合物的合成及其抗HIV-1 TAR RNA的活性。

  摘要：

  调节蛋白Tat对于1型人类免疫缺陷病毒（HIV-1）的病毒基因表达和复制至关重要。Tat通过结合HIV-1长末端重复序列（LTR）与反式激活反应元件（TAR）而激活，并增加了病毒转录。研究表明，精氨酸和精氨酸衍生物的结合在Tat结合位点诱导TAR RNA的构象变化。未配对的A17残基界定了一个小空腔，该空腔构成了小分子（尤其是溴化乙锭）的受体位点。这些结合特性促使我们设计了一系列能够与TAR RNA相互作用的乙氨酸-精氨酸结合物。在这里，我们报告配备精氨酸侧链的六个乙锭衍生物的合成。对这些分子进行了生物学评估，和两种化合物（17和20）在微摩尔浓度下显示出抗HIV-1的体外活性，没有毒性（最高100 microM浓度）。熔融温度研究表明，活性最高的分子（20）在体外与TAR牢固结合。RNase保护实验与分子模型研究一致，该分子模型研究表明20的乙啶部分插入A17残基旁边，而精氨酸侧链占据了嘧啶凸起。

  DOI：

  10.1021/jm980728e

文献信息

• Di Giorgio, Audrey Farese; Pairot, Sandrine; Patino, Nadia, Nucleosides and Nucleotides, 1999, vol. 18, # 2, p. 263 - 275
  作者：Di Giorgio, Audrey Farese、Pairot, Sandrine、Patino, Nadia、Condom, Roger、Di Giorgio, Christophe、Aumelas, Andre、Aubertin, Anne-Marie、Guedj, Roger

  DOI：——

  日期：——
• Liquid-phase combinatorial synthesis of diPNA-arginine conjugates
  作者：Mary-Lorène Leroux、Christophe Di Giorgio、Nadia Patino、Roger Condom

  DOI：10.1016/s0040-4039(02)00067-9

  日期：2002.2

  Considering the promising anti HIV activity displayed by some diPNA-arginine conjugates, a library has been generated to determine the target(s) and mode(s) of action of these presumed multi targets drugs and to optimize the antiviral properties of lead compounds. This library has been prepared using a combinatorial liquid-phase strategy, involving easily available N-protected PNA dimeric backbones as building blocks. (C) 2002 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.