N-tert-butyl-2-[N-(4-tert-butylphenyl)-1-(furan-2-yl)formamido]-2-(pyrazin-2-yl)acetamide | 1417700-04-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: N-tert-butyl-2-[N-(4-tert-butylphenyl)-1-(furan-2-yl)formamido]-2-(pyrazin-2-yl)acetamide
• 英文别名: N-[2-(tert-butylamino)-2-oxo-1-pyrazin-2-ylethyl]-N-(4-tert-butylphenyl)furan-2-carboxamide
• CAS: 1417700-04-9
• 化学式: C₂₅H₃₀N₄O₃
• 分子量: 434.538
• InChiKey: WLZURSBQLFFPCE-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  632.5±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.165±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  88.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  糠酸（呋喃甲酸） 、 异氰酸叔丁酯 、 4-叔丁基苯胺 、 2-吡嗪甲醛 以 甲醇 为溶剂， 反应 0.5h， 以86%的产率得到N-tert-butyl-2-[N-(4-tert-butylphenyl)-1-(furan-2-yl)formamido]-2-(pyrazin-2-yl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  加快合理设计非共价 SARS-CoV-2 主要蛋白酶抑制剂的方法

  摘要：

  SARS-CoV-2 的主要蛋白酶 (M pro ) 是经过验证的抗病毒药物靶点。据报道，几种 M pro抑制剂具有有效的酶抑制和细胞抗病毒活性，包括GC376 、 boceprevir 、钙蛋白酶抑制剂 II和XII ，每种抑制剂都含有共价修饰催化 Cys145 的反应弹头。将基于结构的药物设计与一锅 Ugi 四组分反应相结合，我们发现了最有效的非共价抑制剂之一23R ( Jun8-76-3A )，其结构与典型的 M pro抑制剂GC376不同。值得注意的是，与GC376等共价抑制剂相比， 23R具有高度选择性，尤其是针对宿主蛋白酶。 SARS-CoV-2 M pro与23R的共晶结构揭示了位于 S2 和 S4 口袋之间的先前未探索的结合位点。总体而言，这项研究发现了23R ，这是迄今为止报道的最有效和选择性最强的非共价 SARS-CoV-2 M pro抑制剂之一，以及 M pro中的一个新的结合口袋，可用于抑制剂设计。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.1c00509

文献信息

• Discovery, Synthesis, And Structure-Based Optimization of a Series of <i>N</i>-(<i>tert</i>-Butyl)-2-(<i>N</i>-arylamido)-2-(pyridin-3-yl) Acetamides (ML188) as Potent Noncovalent Small Molecule Inhibitors of the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus (SARS-CoV) 3CL Protease
  作者：Jon Jacobs、Valerie Grum-Tokars、Ya Zhou、Mark Turlington、S. Adrian Saldanha、Peter Chase、Aimee Eggler、Eric S. Dawson、Yahira M. Baez-Santos、Sakshi Tomar、Anna M. Mielech、Susan C. Baker、Craig W. Lindsley、Peter Hodder、Andrew Mesecar、Shaun R. Stauffer

  DOI：10.1021/jm301580n

  日期：2013.1.24

  A high-throughput screen of the NIH molecular libraries sample collection and subsequent optimization of a lead dipeptide-like series of severe acute respiratory syndrome (SARS) main protease (3CLpro) inhibitors led to the identification of probe compound ML188 (16-(R), (R)-N-(4-(tert-butyl)phenyl)-N-(2-(tert-butylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl)furan-2-carboxamide, Pubchem CID: 46897844). Unlike the majority of reported coronavirus 3CLpro inhibitors that act via covalent modification of the enzyme, 16-(R) is a noncovalent SARS-CoV 3CLpro inhibitor with moderate MW and good enzyme and antiviral inhibitory activity. A multicomponent Ugi reaction was utilized to rapidly explore structure-activity relationships within S-1, S-1, and S-2 enzyme binding pockets. The X-ray structure of SARS-CoV 3CLpro bound with 16-(R) was instrumental in guiding subsequent rounds of chemistry optimization. 16-(R) provides an excellent starting point for the further design and refinement of 3CLpro inhibitors that act by a noncovalent mechanism of action.
• Expedited Approach toward the Rational Design of Noncovalent SARS-CoV-2 Main Protease Inhibitors
  作者：Naoya Kitamura、Michael Dominic Sacco、Chunlong Ma、Yanmei Hu、Julia Alma Townsend、Xiangzhi Meng、Fushun Zhang、Xiujun Zhang、Mandy Ba、Tommy Szeto、Adis Kukuljac、Michael Thomas Marty、David Schultz、Sara Cherry、Yan Xiang、Yu Chen、Jun Wang

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c00509

  日期：2022.2.24

  Mpro inhibitor GC376. Significantly, 23R is highly selective compared with covalent inhibitors such as GC376, especially toward host proteases. The cocrystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with 23R revealed a previously unexplored binding site located in between the S2 and S4 pockets. Overall, this study discovered 23R, one of the most potent and selective noncovalent SARS-CoV-2 Mpro inhibitors reported

  SARS-CoV-2 的主要蛋白酶 (M pro ) 是经过验证的抗病毒药物靶点。据报道，几种 M pro抑制剂具有有效的酶抑制和细胞抗病毒活性，包括GC376 、 boceprevir 、钙蛋白酶抑制剂 II和XII ，每种抑制剂都含有共价修饰催化 Cys145 的反应弹头。将基于结构的药物设计与一锅 Ugi 四组分反应相结合，我们发现了最有效的非共价抑制剂之一23R ( Jun8-76-3A )，其结构与典型的 M pro抑制剂GC376不同。值得注意的是，与GC376等共价抑制剂相比， 23R具有高度选择性，尤其是针对宿主蛋白酶。 SARS-CoV-2 M pro与23R的共晶结构揭示了位于 S2 和 S4 口袋之间的先前未探索的结合位点。总体而言，这项研究发现了23R ，这是迄今为止报道的最有效和选择性最强的非共价 SARS-CoV-2 M pro抑制剂之一，以及 M pro中的一个新的结合口袋，可用于抑制剂设计。