摘要:
研究了与糖基转移酶GnT-V作用有关的两个(1→6)连接的二糖的构象柔韧性和动力学。分析中使用了NMR NOE和T-ROE光谱实验,依赖构象的耦合常数和分子动力学(MD)模拟。为了促进这些研究中,所述化合物合成为α- D- [6- 13 C] -Man p -OMe衍生物,其降低了1 1 H NMR光谱重叠,并促进两个和三个键的确定1 H,1 H,1 H,13 C和13 C,13C耦合常数。对于糖苷的人口分布ω在α-扭转角D-曼p - (1→6)-α- D-曼p -OMe为GT / GG / TG等于45:50:5,而在α- d‐ man p‐ OMe被确定为56:36:8。这是对于β-产生的动态模型D- GLC p NAc-(1→6)-α- D-曼p通过分子动力学模拟采用基于CHARMM-PARM22 / SU01力场是在与实验观察非常好的一致性-OMe 。β‐ d‐ Glc p NAc‐(1→6)‐α‐D-曼p