3-(2-(5-(1-(2-carboxyethyl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dien-1-ylidene)-3,3-dimethylindolin-1-yl)propanoate | 158829-52-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 3-(2-(5-(1-(2-carboxyethyl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dien-1-ylidene)-3,3-dimethylindolin-1-yl)propanoate
• 英文别名: 3-[2-[(1E,3E,5E)-5-[1-(2-carboxyethyl)-3,3-dimethylindol-2-ylidene]penta-1,3-dienyl]-3,3-dimethylindol-1-ium-1-yl]propanoate
• CAS: 158829-52-8
• 化学式: C₃₁H₃₄N₂O₄
• 分子量: 498.622
• InChiKey: PAKOTSWXHOGBNY-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.47
• 重原子数：
  37.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  83.68
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(6-aminohexylamino)-2-cyanobenzothiazole 、 3-(2-(5-(1-(2-carboxyethyl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dien-1-ylidene)-3,3-dimethylindolin-1-yl)propanoate 在 N-羟基丁二酰亚胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 7.0h， 以27%的产率得到3-[2-[(1E,3E,5E)-5-[1-[3-[6-[(2-cyano-1,3-benzothiazol-6-yl)amino]hexylamino]-3-oxopropyl]-3,3-dimethylindol-2-ylidene]penta-1,3-dienyl]-3,3-dimethylindol-1-ium-1-yl]propanoate
  参考文献：
  名称：

  氨基荧光素作为萤火虫荧光素酶的功能性生物发光底物

  摘要：

  萤火虫荧光素酶因其极高的信噪比而被广泛用作研究基因表达，基因传递等方面的检测基因。一系列生物发光底物的可用性将大大扩展萤光素-萤光素酶系统的适用性。本文中，我们描述了基于氨基荧光素（AL）支架的功能性生物发光底物的设计概念，以及用于合成N烷基化AL的便捷，高产率的方法。我们通过合成三种探针证实了ALs作为生物发光底物的有用性。首先是AL与谷氨酸Glu–AL的结合物。当将Glu–AL（荧光素酶的第一个膜不可渗透的生物发光底物）应用于荧光素酶转染的细胞时，未观察到发光。也就是说，通过使用Glu–AL，我们可以区分细胞内事件和细胞外事件。第二种是Cy5-AL，由近红外（NIR）花青荧光染料Cy5和AL组成，并发出NIR光。当Cy5–AL与萤光素酶反应时，由于从AL到Cy5的生物发光共振能量转移（BRET），观察到了来自Cy5的发光。NIR发射波长将允许在生物发光体内成像中从更深的组织观察到信号。

  DOI：

  10.1002/asia.201000873