DEF-(CEL)-ADE | 1360788-58-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: DEF-(CEL)-ADE
• CAS: 1360788-58-4
• 化学式: C₃₉H₅₆N₈O₁₈
• 分子量: 924.916
• InChiKey: BGEMDPSCRMVONY-LRCHMYBESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.52
• 重原子数：
  65.0
• 可旋转键数：
  32.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  436.45
• 氢给体数：
  14.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  DEF-(CEL)-ADE 在 C-terminal domain of wild type MnmC 、 水 、 氧气 、 腺嘌呤黄素 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 DEF-K-ADE
  参考文献：
  名称：

  先进的糖基化终产物修饰的生物催化逆转。

  摘要：

  高级糖基化终产物（AGEs）是通过梅拉德反应从糖和蛋白质的缩合中出现的一种异质分子。尽管大量研究表明AGEs与衰老相关疾病的病理之间有很强的联系，但由于缺乏在分子水平上逆转AGE修饰的工具，将AGEs确立为病因一直是一个挑战。在这里，我们显示MnmC，一种参与细菌tRNA修饰途径的酶，能够将AGEs羧乙基赖氨酸（CEL）和羧甲基赖氨酸（CML）还原回其天然赖氨酸结构。结合结构同源性分析，定点诱变和蛋白质结构域解剖研究，我们产生了一种MnmC变体，其游离氨基酸形式对CEL具有改进的催化性能。我们表明，这种酶变异体对CEL修饰的拟肽和已建立为AGEs（RAGE）受体的真正配体的含AGE肽也具有活性。我们的数据表明，MnmC变体是有望发展AGE逆转工具和更好地了解AGE生物学的主要催化剂。

  DOI：

  10.1002/cbic.201900158
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-L-丙氨酸 、 2-chlorotrityl 3-bromopropanoate 、 Fmoc-L-苯丙氨酸 、 Fmoc-L-天冬氨酸 beta-叔丁酯 、 Fmoc-O-叔丁基-L-谷氨酸 、 Fmoc-N'-甲基三苯甲基-L-赖氨酸 在 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 、 哌啶 作用下， 反应 1.17h， 生成 DEF-(CEL)-ADE
  参考文献：
  名称：

  Advanced Glycation End Product Recognition by the Receptor for AGEs

  摘要：

  Nonenzymatic protein glycation results in the formation of advanced glycation end products (AGEs) that are implicated in the pathology of diabetes, chronic inflammation, Alzheimer's disease, and cancer. AGEs mediate their effects primarily through a receptor-dependent pathway in which AGEs bind to a specific cell surface associated receptor, the Receptor for AGEs (RAGE). NE-carboxy-methyllysine (CML) and N-epsilon-carboxy-ethyl-lysine (CEL), constitute two of the major AGE structures found in tissue and blood plasma, and are physiological ligands of RAGE. The solution structure of a CEL-containing peptide-RAGE V domain complex reveals that the carboxyethyl moiety fits inside a positively charged cavity of the V domain. Peptide backbone atoms make specific contacts with the V domain. The geometry of the bound CEL peptide is compatible with many CML (CEL)-modified sites found in plasma proteins. The structure explains how such patterned ligands as CML (CEL)-proteins bind to RAGE and contribute to RAGE signaling.

  DOI：

  10.1016/j.str.2011.02.013