4-({4-[(2-tert-butoxycarbonylaminothiazole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carboxylic acid methyl ester | 292068-89-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 唑类
• 英文名称: 4-({4-[(2-tert-butoxycarbonylaminothiazole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carboxylic acid methyl ester
• CAS: 292068-89-4
• 化学式: C₂₂H₂₆N₆O₆S
• 分子量: 502.551
• InChiKey: PPRYFVRYMUCVDR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.46
• 重原子数：
  35.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  145.58
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-({4-[(2-tert-butoxycarbonylaminothiazole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carboxylic acid methyl ester 在 盐酸 作用下， 以 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 4-({4-[(2-amino-thiazole-4-carbonyl)-amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}-amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carboxylic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Distamycin A 和 2640 类似物的全合成：一种用于发现新的生物活性 DNA 结合剂和开发用于确定相对 DNA 结合亲和力或 DNA 结合序列选择性的快速、高通量筛选的液相组合方法

  摘要：

  描述了远霉素 A 的液相合成的发展及其对 2640 类似物制备的扩展。因此，采用酸/碱液-液萃取进行反应后处理和纯化的液相合成技术用于多步制备偏霉素 A（8 步，40% 总产率）和 2640 类似物的原型库，提供中间体和最终产品在常规反应规模上纯度≥95%。公开了一种简单、快速和高通量的 DNA 结合亲和力筛选的补充开发，该筛选基于来自预结合溴化乙锭置换的荧光损失，适用于评估对 DNA 均聚物或特定序列的相对或绝对结合亲和力。发夹寡核苷酸）。使用发夹寡核苷酸，

  DOI：

  10.1021/ja994192d
• 作为产物：
  描述：

  4-(Boc-氨基)-1-甲基吡咯-2-羧酸 在 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 36.0h， 生成 4-({4-[(2-tert-butoxycarbonylaminothiazole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carboxylic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Distamycin A 和 2640 类似物的全合成：一种用于发现新的生物活性 DNA 结合剂和开发用于确定相对 DNA 结合亲和力或 DNA 结合序列选择性的快速、高通量筛选的液相组合方法

  摘要：

  描述了远霉素 A 的液相合成的发展及其对 2640 类似物制备的扩展。因此，采用酸/碱液-液萃取进行反应后处理和纯化的液相合成技术用于多步制备偏霉素 A（8 步，40% 总产率）和 2640 类似物的原型库，提供中间体和最终产品在常规反应规模上纯度≥95%。公开了一种简单、快速和高通量的 DNA 结合亲和力筛选的补充开发，该筛选基于来自预结合溴化乙锭置换的荧光损失，适用于评估对 DNA 均聚物或特定序列的相对或绝对结合亲和力。发夹寡核苷酸）。使用发夹寡核苷酸，

  DOI：

  10.1021/ja994192d

文献信息

• An Extended Pyrrolobenzodiazepine–Polyamide Conjugate with Selectivity for a DNA Sequence Containing the ICB2 Transcription Factor Binding Site
  作者：Federico Brucoli、Rachel M. Hawkins、Colin H. James、Paul J. M. Jackson、Geoff Wells、Terence C. Jenkins、Tom Ellis、Minal Kotecha、Daniel Hochhauser、John A. Hartley、Philip W. Howard、David E. Thurston

  DOI：10.1021/jm4001852

  日期：2013.8.22

  The binding of nuclear factor Y (NF-Y) to inverted CCAAT boxes (ICBs) within the promoter region of DNA topoisomerase II alpha results in control of cell differentiation and cell cycle progression. Thus, NF-Y inhibitory small molecules could be employed to inhibit the replication of cancer cells. A library of pyrrolobenzodiazepine (PBD) C8-conjugates consisting of one PBD unit attached to tri-heterocyclic polyamide fragments was designed and synthesized. The DNA-binding affinity and sequence selectivity of each compound were evaluated in DNA thermal denaturation and DNase I footprinting assays, and the ability to inhibit binding of NF-Y to ICB1 and ICB2 was studied using an electrophoretic mobility shift assay (EMSA). 3a was found to be a potent inhibitor of NF-Y binding, exhibiting a 10-fold selectivity for an ICB2 site compared to an ICB1-containing sequence, and showing low nanomolar cytotoxicity toward human tumor cell lines. Molecular modeling and computational studies have provided details of the covalent attachment process that leads to formation of the PBD-DNA adduct, and have allowed the preference of 3a for ICB2 to be rationalized.