1-(6-Carboxypentyl)-2,3,3-trimethylindoleninium 5-sulfonamide | 366451-26-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 1-(6-Carboxypentyl)-2,3,3-trimethylindoleninium 5-sulfonamide
• 英文别名: 6-(2,3,3-Trimethyl-5-sulfamoylindol-1-ium-1-yl)hexanoic acid；6-(2,3,3-trimethyl-5-sulfamoylindol-1-ium-1-yl)hexanoic acid
• CAS: 366451-26-5
• 化学式: C₁₇H₂₅N₂O₄S
• 分子量: 353.462
• InChiKey: JQAOHIWYKIHZIZ-UHFFFAOYSA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  109
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(6-Carboxypentyl)-2,3,3-trimethylindoleninium 5-sulfonamide 、 2,3,3-三甲基-3H-吲哚-5-磺酸 在 硫酸 、 O-(N-succinimidyl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 生成
  参考文献：
  名称：

  遗传性靶向比率和活化的pH指示剂配合物（TRApHIC），用于受体运输。

  摘要：

  基于荧光蛋白的pH传感器是用于通过与胞吞作用和胞吐作用相关的pH改变来测量蛋白质运输的有用工具。但是，常用的pH敏感探针会随其感兴趣的蛋白质在整个细胞中普遍表达，这阻碍了我们专注于特定的蛋白质运输库的能力。我们开发了一系列激发比率式，可激活的pH响应串联染料，该染料由与荧光孔雀石绿受体相连的pH敏感Cy3供体组成。这些细胞排除的染料在与遗传表达的氟激活蛋白结合后被靶向并被激活，适用于使用共聚焦和超分辨率显微镜对表面蛋白进行选择性标记，以分析内吞作用并在活细胞中回收。

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.7b01135

文献信息

• Targeted probes of cellular physiology
  申请人：Waggoner Alan

  公开号：US09995679B2

  公开（公告）日：2018-06-12

  Biosensor comprising an activatable acceptor fluorogen linked via a linker to a donor which transfers energy to the fluorogen on detecting an analyte wherein the fluorogen component reacts and a 100 fold increase in intensity results when the fluorogen interacts non-covalently with an activator e.g. fluorogen activator peptide.

  生物传感器，包含一个可激活的受体荧光团，通过一个连接体与供体相连，该供体在检测到分析物时将能量转移给荧光团，其中荧光团组分在非共价地与激活剂如荧光团激活肽相互作用时发生反应，并导致强度增加100倍。
• TARGETED PROBES OF CELLULAR PHYSIOLOGY
  申请人：Waggoner Alan

  公开号：US20130244891A1

  公开（公告）日：2013-09-19

  Biosensor comprising an activatable acceptor fluorogen linked via a linker to a donor which transfers energy to the fluorogen on detecting an analyte wherein the fluorogen component reacts and a 100 fold increase in intensity results when the fluorogen interacts non-covalently with an activator e.g. fluorogen activator peptide.

  生物传感器包括一个可激活的受体荧光原料，通过连接到一个供体的链段，该供体在检测到分析物时向荧光原料转移能量，其中荧光原料组分反应，并且当荧光原料与激活剂（如荧光原料激活肽）非共价地相互作用时，强度增加100倍。
• POLYMETHINE COMPOUNDS AND THEIR USE AS FLUORESCENT LABELS
  申请人：Illumina Cambridge Limited

  公开号：US20160177388A1

  公开（公告）日：2016-06-23

  The present disclosure relates to new compounds and their use as fluorescent labels. The compounds may be used as fluorescent labels for nucleotides in nucleic acid sequencing applications.
• Genetically Targeted Ratiometric and Activated pH Indicator Complexes (TRApHIC) for Receptor Trafficking
  作者：Lydia A. Perkins、Qi Yan、Brigitte F. Schmidt、Dmytro Kolodieznyi、Saumya Saurabh、Mads Breum Larsen、Simon C. Watkins、Laura Kremer、Marcel P. Bruchez

  DOI：10.1021/acs.biochem.7b01135

  日期：2018.2.6

  protein-based pH sensors are useful tools for measuring protein trafficking through pH changes associated with endo- and exocytosis. However, commonly used pH-sensing probes are ubiquitously expressed with their protein of interest throughout the cell, hindering our ability to focus on specific trafficking pools of proteins. We developed a family of excitation ratiometric, activatable pH responsive tandem

  基于荧光蛋白的pH传感器是用于通过与胞吞作用和胞吐作用相关的pH改变来测量蛋白质运输的有用工具。但是，常用的pH敏感探针会随其感兴趣的蛋白质在整个细胞中普遍表达，这阻碍了我们专注于特定的蛋白质运输库的能力。我们开发了一系列激发比率式，可激活的pH响应串联染料，该染料由与荧光孔雀石绿受体相连的pH敏感Cy3供体组成。这些细胞排除的染料在与遗传表达的氟激活蛋白结合后被靶向并被激活，适用于使用共聚焦和超分辨率显微镜对表面蛋白进行选择性标记，以分析内吞作用并在活细胞中回收。