近几十年来,人们对高度敏感的序列特异性 DNA 结合剂的设计产生了极大的兴趣。结合剂的合格性取决于结合时荧光增加的幅度,与其光物理学有关,以及其亲和力和特异性,而后者又由结合过程的动力学决定。因此,DNA 结合剂设计的进展需要彻底的光物理研究和所涉及的结合和解离速率常数的精确测定。我们研究了两种双
苯甲脒 (
BBA) 衍
生物,它们由不同长度的接头标记,并带有
染料俄勒冈绿 (OG)。这些荧光结合剂在与双链 (ds) DNA 的小沟结合后显示出显着的荧光增强,以及与亲本
BBA 相比,它们的序列特异性显着提高,尽管亲和力常数降低。详细的光物理分析表明,将
BBA 插入 DNA 小沟后,
BBA 通过光诱导电子转移对 OG 荧光的静态和动态猝灭受到抑制。荧光相关光谱产生精确的动态速率常数,证明这些荧光结合剂与 dsDNA 的结合过程与单独的
BBA 的结合过程非常相似,并且它们的亲和力较低主要是由于