(2R)-N-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethyl]-2,4-dihydroxy-3,3-dimethylbutanamide | 912849-63-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: (2R)-N-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethyl]-2,4-dihydroxy-3,3-dimethylbutanamide
• CAS: 912849-63-9
• 化学式: C₁₂H₂₆N₂O₅
• 分子量: 278.349
• InChiKey: UHSNPFFEAXMLQO-JTQLQIEISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.8
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.92
• 拓扑面积：
  114
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  succinimidyl 3-azidopropanoate 、 (2R)-N-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethyl]-2,4-dihydroxy-3,3-dimethylbutanamide 在 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 以30%的产率得到(2R)-N-[2-[2-[2-(3-azidopropanoylamino)ethoxy]ethoxy]ethyl]-2,4-dihydroxy-3,3-dimethylbutanamide
  参考文献：
  名称：

  用于体内蛋白质修饰的生物正交泛酰巯基乙胺类似物的合成和评价

  摘要：

  体内载体蛋白标记最近已成为融合系统的位点特异性修饰和天然产物蛋白质组学新方法的一个有吸引力的目标。对泛酰巯基乙胺类似物进行了详细研究，以确定活细胞内共价蛋白标记的合适伙伴。开发了泛酰胺类似物的快速合成，并用于生产用于体外和体内蛋白质标记评估的面板。动力学比较允许构建结构-活性关系，以查明载体蛋白标记选择的接头、染料和生物正交报告基因。最后，生物正交泛酰巯基乙胺类似物在体内以高特异性靶向载体蛋白，并在粗细胞裂解物中与报告分子进行化学选择性连接。

  DOI：

  10.1021/ja063217n
• 作为产物：
  描述：

  D-(-)-泛酰内酯 在 四(三苯基膦)钯 5,5-二甲基-1,3-环己二酮 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 (2R)-N-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethyl]-2,4-dihydroxy-3,3-dimethylbutanamide
  参考文献：
  名称：

  用于体内蛋白质修饰的生物正交泛酰巯基乙胺类似物的合成和评价

  摘要：

  体内载体蛋白标记最近已成为融合系统的位点特异性修饰和天然产物蛋白质组学新方法的一个有吸引力的目标。对泛酰巯基乙胺类似物进行了详细研究，以确定活细胞内共价蛋白标记的合适伙伴。开发了泛酰胺类似物的快速合成，并用于生产用于体外和体内蛋白质标记评估的面板。动力学比较允许构建结构-活性关系，以查明载体蛋白标记选择的接头、染料和生物正交报告基因。最后，生物正交泛酰巯基乙胺类似物在体内以高特异性靶向载体蛋白，并在粗细胞裂解物中与报告分子进行化学选择性连接。

  DOI：

  10.1021/ja063217n

文献信息

• Metabolic delivery of coenzyme A analogs
  申请人：Burkart D. Michael

  公开号：US20070128683A1

  公开（公告）日：2007-06-07

  Methods to generate analogs of coenzyme A in vitro and in vivo are disclosed. The methods comprise reacting pantetheine or a derivative thereof with a reporter to form labeled pantetheine or a derivative thereof, phosphorylating the labeled pantetheine or derivative thereof to form phosphopantetheine or a derivative thereof, adenylating the labeled phosphopantetheine or derivative thereof to form a labeled dephosphoCoenzyme A or derivative thereof, and phosphorylating the 3′-hydrozyl of the labeled dephosphoCoenzume A or derivative thereof to form a labeled coenzyme A analog or derivative thereof.

  本发明公开了在体内外生成辅酶A类似物的方法。该方法包括将泛酰胺或其衍生物与报告物反应以形成标记的泛酰胺或其衍生物，将标记的泛酰胺或其衍生物磷酸化以形成磷酸泛酰胺或其衍生物，将标记的磷酸泛酰胺或其衍生物腺苷化以形成标记的脱磷酸辅酶A或其衍生物，以及将标记的脱磷酸辅酶A或其衍生物的3'-羟基磷酸化以形成标记的辅酶A类似物或其衍生物。
• Methods for Generating Analogs of Coenzyme A
  申请人：Burkart Michael D.

  公开号：US20100304430A1

  公开（公告）日：2010-12-02

  Methods to generate analogs of coenzyme A in vivo are disclosed. The methods to generate analogs of coenzyme A in a cell comprise reacting pantetheine or a derivative thereof with a reporter to form labeled pantetheine or a derivative thereof, contacting the cell with the labeled pantetheine or derivative thereof such that the labeled pantetheine or derivative thereof enters the cell, phosphorylating the labeled pantetheine or derivative thereof to form phosphopantetheine or a derivative thereof, adenylating the labeled phosphopantetheine or derivative thereof to form a labeled dephosphoCoenzyme A or derivative thereof, and phosphorylating the 3′-hydroxyl of the labeled dephosphoCoenzyme A or derivative thereof to form a labeled coenzyme A analog or derivative thereof.

  本文公开了一种在体内生成辅酶A类似物的方法。在细胞内生成辅酶A类似物的方法包括将泛酰胺或其衍生物与报告物质反应以形成标记的泛酰胺或其衍生物，将标记的泛酰胺或其衍生物与细胞接触，使标记的泛酰胺或其衍生物进入细胞，磷酸化标记的泛酰胺或其衍生物以形成磷酸泛酰胺或其衍生物，腺苷酸化标记的磷酸泛酰胺或其衍生物以形成标记的去磷酸辅酶A或其衍生物，然后磷酸化标记的去磷酸辅酶A或其衍生物的3'-羟基，以形成标记的辅酶A类似物或其衍生物。
• US7727738B2
  申请人：——

  公开号：US7727738B2

  公开（公告）日：2010-06-01
• US8119364B2
  申请人：——

  公开号：US8119364B2

  公开（公告）日：2012-02-21
• Synthesis and Evaluation of Bioorthogonal Pantetheine Analogues for in Vivo Protein Modification
  作者：Jordan L. Meier、Andrew C. Mercer、Heriberto Rivera、Michael D. Burkart

  DOI：10.1021/ja063217n

  日期：2006.9.1

  target for the site-specific modification of fusion systems and new approaches to natural product proteomics. A detailed study of pantetheine analogues was performed in order to identify suitable partners for covalent protein labeling inside living cells. A rapid synthesis of pantothenamide analogues was developed and used to produce a panel which was evaluated for in vitro and in vivo protein labeling

  体内载体蛋白标记最近已成为融合系统的位点特异性修饰和天然产物蛋白质组学新方法的一个有吸引力的目标。对泛酰巯基乙胺类似物进行了详细研究，以确定活细胞内共价蛋白标记的合适伙伴。开发了泛酰胺类似物的快速合成，并用于生产用于体外和体内蛋白质标记评估的面板。动力学比较允许构建结构-活性关系，以查明载体蛋白标记选择的接头、染料和生物正交报告基因。最后，生物正交泛酰巯基乙胺类似物在体内以高特异性靶向载体蛋白，并在粗细胞裂解物中与报告分子进行化学选择性连接。