2-[5-(1,3,3-trimethyl-2,3-dihydroindol-2-ylidene)-1,3-pentadienyl]-3,3-dimethyl-1-[5-(trans-4-hydroxycyclohexylaminocarbonyl)pentyl]-3H-indolium hexafluorophosphate | 1032678-20-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 2-[5-(1,3,3-trimethyl-2,3-dihydroindol-2-ylidene)-1,3-pentadienyl]-3,3-dimethyl-1-[5-(trans-4-hydroxycyclohexylaminocarbonyl)pentyl]-3H-indolium hexafluorophosphate
• CAS: 1032678-20-8
• 化学式: C₃₈H₅₀N₃O₂*F₆P
• 分子量: 725.798
• InChiKey: ITEGVIFLJFCLGW-LMCBUODESA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.85
• 重原子数：
  50.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  55.58
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  3.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-[5-(1,3,3-trimethyl-2,3-dihydroindol-2-ylidene)-1,3-pentadienyl]-3,3-dimethyl-1-[5-(trans-4-hydroxycyclohexylaminocarbonyl)pentyl]-3H-indolium hexafluorophosphate 、 双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 在 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 以93%的产率得到2-[5-(1,3,3-trimethyl-2,3-dihydro-1H-indol-2-ylidene)-1,3-pentadienyl]-3,3-dimethyl-1-{5-[trans-4-(diisopropylamino-2-cyanoethoxyphosphanyloxy)cyclohexylaminocarbonyl]pentyl}-3H-indolium hexafluorophosphate
  参考文献：
  名称：

  一种简便的花青染料合成方法：用于标记生物分子的试剂

  摘要：

  已经使用改进的一锅法制备了四种四甲基吲哚（二）羰花青衍生的羧酸，用于染料组装。这些酸被转化为氧琥珀酰亚胺酯和亚磷酰胺试剂。已经证明了试剂在标记寡核苷酸和蛋白质中的效率。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2008)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200701190
• 作为产物：
  描述：

  2-[5-(1,3,3-trimethyl-2,3-dihydro-1H-indol-2-ylidene)-1,3-pentadienyl]-3,3-dimethyl-1-(5-carboxypentyl)-3H-indolium chloride 、 trans-4-aminocyclohexanol hydrochloride 在 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.08h， 以76%的产率得到2-[5-(1,3,3-trimethyl-2,3-dihydroindol-2-ylidene)-1,3-pentadienyl]-3,3-dimethyl-1-[5-(trans-4-hydroxycyclohexylaminocarbonyl)pentyl]-3H-indolium hexafluorophosphate
  参考文献：
  名称：

  一种简便的花青染料合成方法：用于标记生物分子的试剂

  摘要：

  已经使用改进的一锅法制备了四种四甲基吲哚（二）羰花青衍生的羧酸，用于染料组装。这些酸被转化为氧琥珀酰亚胺酯和亚磷酰胺试剂。已经证明了试剂在标记寡核苷酸和蛋白质中的效率。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2008)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200701190