人类
DNA拓扑异构酶II是抗癌治疗的主要靶标之一,但是该靶标的
ATP竞争性
抑制剂尚未发挥其全部潜力。人类
DNA拓扑异构酶II的
ATPase域属于GHKL
ATPase超家族,与包括细菌拓扑异构酶在内的其他超家族成员具有非常高的3D结构相似性。在这项工作中,我们报告了通过筛选细菌DNA促旋酶和拓扑异构酶IV的
ATP竞争性
抑制剂的内部文库而发现的人类
DNA拓扑异构酶IIα的
ATP竞争性
抑制剂的新
化学型。系统筛选该文库为我们提供了20种热门化合物。选择了1,2,4-取代的N-苯基
吡咯酰胺进行进一步的研究,结果得到了13种新的类似物,包括52在松弛试验(IC 50 = 3.2 µM)和
ATPase分析(IC 50 = 0.43 µM)中具有强活性。在MCF-7癌
细胞系中测定了所有命中的细胞毒活性,最有效的化合物16和20的IC 50值分别为8.7和8.2 µM。