N-[2-(2-O-tert-butyldimethylsilylethoxy)ethyl]-N'-2-(2-hydroxyethoxy)ethyl-3,4,9,10-perylenetetracarboxylic diimide | 215297-19-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 菲及其衍生物
• 英文名称: N-[2-(2-O-tert-butyldimethylsilylethoxy)ethyl]-N'-2-(2-hydroxyethoxy)ethyl-3,4,9,10-perylenetetracarboxylic diimide
• CAS: 215297-19-1
• 化学式: C₃₈H₄₀N₂O₈Si
• 分子量: 680.83
• InChiKey: ACOSTVBTELOTGQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.98
• 重原子数：
  49.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  122.68
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[2-(2-O-tert-butyldimethylsilylethoxy)ethyl]-N'-2-(2-hydroxyethoxy)ethyl-3,4,9,10-perylenetetracarboxylic diimide 在 吡啶 、 氢氟酸 作用下， 反应 3.0h， 生成 N-2-[(2-O-4,4′-dimethoxytritylethoxy)ethyl]-N′-2-(2-hydroxyethoxy)ethyl-3,4,9,10-perylenetetracarboxylic diimide
  参考文献：
  名称：

  用于稳定发夹三链体的萘基和苝基接头

  摘要：

  平面苝和萘基二亚胺接头可用于连接 DNA 三链体的 Watson-Crick 和 Hoogsteen 链，从而提供能够靶向单链核酸并形成发夹三链体的偶联物。平面接头旨在桥接三链复合物的末端碱基三联体，并提供与所有三个残基的碱基堆叠相互作用。已制备了 16 种复合物，每个接头 8 种，一半带有 RNA (R) 靶标，一半带有 DNA (D) 靶标。缀合物序列由两条 DNA 链、两条 2'-O-甲基 RNA (M) 或各条链组成。与用六（乙二醇）接头形成的类似复合物相比，平面接头将复合物的 TM 值提高了 28 °C，ΔG 值表示高达 12。3 kcal/mol 的稳定性相对于简单的乙二醇接头。所有 16 种复合物都通过 TM 测量和 ΔG 测定进行了表征。那个π-堆叠交互...

  DOI：

  10.1021/ja0001714
• 作为产物：
  描述：

  N,N'-bis-[2-(2-O-tert-butyldimethylsilylethoxy)ethyl]-3,4,9,10-perylenetetracarboxylic diimide 在 吡啶 、 氢氟酸 作用下， 以24%的产率得到N-[2-(2-O-tert-butyldimethylsilylethoxy)ethyl]-N'-2-(2-hydroxyethoxy)ethyl-3,4,9,10-perylenetetracarboxylic diimide
  参考文献：
  名称：

  用于稳定发夹三链体的萘基和苝基接头

  摘要：

  平面苝和萘基二亚胺接头可用于连接 DNA 三链体的 Watson-Crick 和 Hoogsteen 链，从而提供能够靶向单链核酸并形成发夹三链体的偶联物。平面接头旨在桥接三链复合物的末端碱基三联体，并提供与所有三个残基的碱基堆叠相互作用。已制备了 16 种复合物，每个接头 8 种，一半带有 RNA (R) 靶标，一半带有 DNA (D) 靶标。缀合物序列由两条 DNA 链、两条 2'-O-甲基 RNA (M) 或各条链组成。与用六（乙二醇）接头形成的类似复合物相比，平面接头将复合物的 TM 值提高了 28 °C，ΔG 值表示高达 12。3 kcal/mol 的稳定性相对于简单的乙二醇接头。所有 16 种复合物都通过 TM 测量和 ΔG 测定进行了表征。那个π-堆叠交互...

  DOI：

  10.1021/ja0001714