(2R,3R,4R,5R,6R)-5-azido-2-(azidomethyl)-6-(((1R,2S,3S,4R,6S)-4,6-diazido-2-hydroxy-3-(((1aS,2S,3aR,6R,7aR,7bS)-6-phenylhexahydrooxireno[2',3':4,5]pyrano[3,2-d][1,3]dioxin-2-yl)oxy)cyclohexyl)oxy)tetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate | 1241744-82-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (2R,3R,4R,5R,6R)-5-azido-2-(azidomethyl)-6-(((1R,2S,3S,4R,6S)-4,6-diazido-2-hydroxy-3-(((1aS,2S,3aR,6R,7aR,7bS)-6-phenylhexahydrooxireno[2',3':4,5]pyrano[3,2-d][1,3]dioxin-2-yl)oxy)cyclohexyl)oxy)tetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate
• CAS: 1241744-82-0
• 化学式: C₂₉H₃₄N₁₂O₁₂
• 分子量: 742.662
• InChiKey: SAJFZGHHPJBAEV-GFCQSYLBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.06
• 重原子数：
  53.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.72
• 拓扑面积：
  335.78
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  16.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3R,4R,5R,6R)-5-azido-2-(azidomethyl)-6-(((1R,2S,3S,4R,6S)-4,6-diazido-2-hydroxy-3-(((1aS,2S,3aR,6R,7aR,7bS)-6-phenylhexahydrooxireno[2',3':4,5]pyrano[3,2-d][1,3]dioxin-2-yl)oxy)cyclohexyl)oxy)tetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate 在 氨 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 为溶剂， 反应 12.0h， 以12%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  芳香环在氨基糖苷类抗生素分子识别中的作用：对药物设计的影响

  摘要：

  氨基糖苷类抗生素参与涉及 RNA 和蛋白质的多种结合过程。近年来，对几种临床相关的氨基糖苷类/受体复合物的描述极大地刺激了新的生物活性衍生物的基于结构的设计。不幸的是，设计工作经常取得有限的成功，这反映了我们对抗生素识别的分子决定因素的不完全理解。有趣的是，蛋白质/RNA 受体的芳环似乎是这个过程中的关键参与者。事实上，仔细检查可用的结构信息表明它们经常参与 CH/pi 与抗生素的糖/氨基环醇环的堆积相互作用。虽然在过去十年中已经详细研究了中性碳水化合物和芳环之间的相互作用，但当它们涉及带高电荷的糖苷时，对这些接触知之甚少。在此，我们报告了对 CH/pi 堆积相互作用在氨基糖苷类分子识别中所起作用的详细实验和理论分析。我们的研究旨在确定抗生素聚阳离子特性对这些特定接触的稳定性、首选几何形状和动力学的影响。为此，选择了不同的氨基糖苷类/芳香族复合物作为模型系统。它们从简单的双分子相互作用到设计衍生物中存在的更稳定的分子内

  DOI：

  10.1021/ja1046439
• 作为产物：
  描述：

  (1aS,2S,3aR,6R,7aR,7bS)-6-phenyl-2-(phenylthio)hexahydrooxireno[2',3':4,5]pyrano[3,2-d][1,3]dioxine 、 1,3,2',6'-tetraazido-3',4'-di-O-acetylneamine 在 N-碘代丁二酰亚胺 、 silver trifluoromethanesulfonate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 以43%的产率得到(2R,3R,4R,5R,6R)-5-azido-2-(azidomethyl)-6-(((1R,2S,3S,4R,6S)-4,6-diazido-2-hydroxy-3-(((1aS,2S,3aR,6R,7aR,7bS)-6-phenylhexahydrooxireno[2',3':4,5]pyrano[3,2-d][1,3]dioxin-2-yl)oxy)cyclohexyl)oxy)tetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate
  参考文献：
  名称：

  芳香环在氨基糖苷类抗生素分子识别中的作用：对药物设计的影响

  摘要：

  氨基糖苷类抗生素参与涉及 RNA 和蛋白质的多种结合过程。近年来，对几种临床相关的氨基糖苷类/受体复合物的描述极大地刺激了新的生物活性衍生物的基于结构的设计。不幸的是，设计工作经常取得有限的成功，这反映了我们对抗生素识别的分子决定因素的不完全理解。有趣的是，蛋白质/RNA 受体的芳环似乎是这个过程中的关键参与者。事实上，仔细检查可用的结构信息表明它们经常参与 CH/pi 与抗生素的糖/氨基环醇环的堆积相互作用。虽然在过去十年中已经详细研究了中性碳水化合物和芳环之间的相互作用，但当它们涉及带高电荷的糖苷时，对这些接触知之甚少。在此，我们报告了对 CH/pi 堆积相互作用在氨基糖苷类分子识别中所起作用的详细实验和理论分析。我们的研究旨在确定抗生素聚阳离子特性对这些特定接触的稳定性、首选几何形状和动力学的影响。为此，选择了不同的氨基糖苷类/芳香族复合物作为模型系统。它们从简单的双分子相互作用到设计衍生物中存在的更稳定的分子内

  DOI：

  10.1021/ja1046439