[(2S,5S,8S,11S,17S)-5-(4-Acetylamino-butyl)-8-((R)-1-benzyloxy-ethyl)-17-benzyloxymethyl-11-((S)-sec-butyl)-3,6,9,12,15,18-hexaoxo-1,4,7,10,13,16-hexaaza-cyclooctadec-2-yl]-acetic acid benzyl ester | 685893-83-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: [(2S,5S,8S,11S,17S)-5-(4-Acetylamino-butyl)-8-((R)-1-benzyloxy-ethyl)-17-benzyloxymethyl-11-((S)-sec-butyl)-3,6,9,12,15,18-hexaoxo-1,4,7,10,13,16-hexaaza-cyclooctadec-2-yl]-acetic acid benzyl ester
• CAS: 685893-83-8
• 化学式: C₄₈H₆₃N₇O₁₁
• 分子量: 914.069
• InChiKey: NRZRIMFEJKQKSB-UDDLVFFESA-N

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2S,5S,8S,11S,17S)-5-(4-Acetylamino-butyl)-8-((R)-1-benzyloxy-ethyl)-17-benzyloxymethyl-11-((S)-sec-butyl)-3,6,9,12,15,18-hexaoxo-1,4,7,10,13,16-hexaaza-cyclooctadec-2-yl]-acetic acid benzyl ester 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 溶剂黄146 作用下， 生成 [(2S,5S,8S,11S,17S)-5-(4-Acetylamino-butyl)-11-((S)-sec-butyl)-8-((R)-1-hydroxy-ethyl)-17-hydroxymethyl-3,6,9,12,15,18-hexaoxo-1,4,7,10,13,16-hexaaza-cyclooctadec-2-yl]-acetic acid
  参考文献：
  名称：

  对HDAC6抑制剂的研究：从α-微管蛋白序列设计的环六肽异羟肟酸的合成和构象分析。

  摘要：

  基于α-微管蛋白是HDAC6的底物以及环状四肽异羟肟酸（CHAP）对HDAC的优异抑制作用，设计并合成了用于HDAC6的环状六肽异羟肟酸抑制剂。出乎意料的是，环六肽异羟肟酸显示出非常低的HDAC抑制活性。为了解释低活性，我们进行了构象分析，并将其与α-微管蛋白的晶体结构进行了比较。环状六肽底物的乙酰化赖氨酸周围的构象或环状六肽抑制剂的氨基硫酸异羟肟酸[Asu（NHOH）]周围的构象与α-微管蛋白的赖氨酸-40周围的构象不同。构象的差异似乎在加帽位点引起一些位阻，导致结合能力差。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2004.01.014
• 作为产物：
  描述：

  (S)-N-((S)-5-Acetylamino-1-{(1S,2R)-2-benzyloxy-1-[(1S,2S)-1-(carboxymethyl-carbamoyl)-2-methyl-butylcarbamoyl]-propylcarbamoyl}-pentyl)-3-((S)-3-benzyloxy-2-tert-butoxycarbonylamino-propionylamino)-succinamic acid benzyl ester 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 [(2S,5S,8S,11S,17S)-5-(4-Acetylamino-butyl)-8-((R)-1-benzyloxy-ethyl)-17-benzyloxymethyl-11-((S)-sec-butyl)-3,6,9,12,15,18-hexaoxo-1,4,7,10,13,16-hexaaza-cyclooctadec-2-yl]-acetic acid benzyl ester
  参考文献：
  名称：

  对HDAC6抑制剂的研究：从α-微管蛋白序列设计的环六肽异羟肟酸的合成和构象分析。

  摘要：

  基于α-微管蛋白是HDAC6的底物以及环状四肽异羟肟酸（CHAP）对HDAC的优异抑制作用，设计并合成了用于HDAC6的环状六肽异羟肟酸抑制剂。出乎意料的是，环六肽异羟肟酸显示出非常低的HDAC抑制活性。为了解释低活性，我们进行了构象分析，并将其与α-微管蛋白的晶体结构进行了比较。环状六肽底物的乙酰化赖氨酸周围的构象或环状六肽抑制剂的氨基硫酸异羟肟酸[Asu（NHOH）]周围的构象与α-微管蛋白的赖氨酸-40周围的构象不同。构象的差异似乎在加帽位点引起一些位阻，导致结合能力差。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2004.01.014