N-[2-[[2-[2-aminoethyl-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl]-N-[2-[2-[[(1S,2R,3S,5R,6S)-3,5-diamino-2-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-amino-6-(aminomethyl)-4,5-dihydroxyoxan-2-yl]oxy-6-hydroxycyclohexyl]amino]ethylamino]-2-oxoethyl]-2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetamide | 1092571-22-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: N-[2-[[2-[2-aminoethyl-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl]-N-[2-[2-[[(1S,2R,3S,5R,6S)-3,5-diamino-2-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-amino-6-(aminomethyl)-4,5-dihydroxyoxan-2-yl]oxy-6-hydroxycyclohexyl]amino]ethylamino]-2-oxoethyl]-2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetamide
• CAS: 1092571-22-6
• 化学式: C₃₅H₅₈N₁₄O₁₃
• 分子量: 882.932
• InChiKey: XGQSWDVUGHWVTB-YYPNCJHFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -10
• 重原子数：
  62
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.66
• 拓扑面积：
  419
• 氢给体数：
  13
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  在 吡啶 、 硫化氢 、 三乙胺 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 N-[2-[[2-[2-aminoethyl-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl]-N-[2-[2-[[(1S,2R,3S,5R,6S)-3,5-diamino-2-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-amino-6-(aminomethyl)-4,5-dihydroxyoxan-2-yl]oxy-6-hydroxycyclohexyl]amino]ethylamino]-2-oxoethyl]-2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  神经胺-二核苷和神经胺-PNA缀合物的合成及其与RNA相互作用的研究。

  摘要：

  合成了两种类型的神经胺衍生物，即神经胺-二核苷酸缀合物8a-g和神经胺-PNA缀合物12a-c和14a-d。通过叠氮基-亚胺与二核苷酸-5'-羧酸的缩合，然后还原和脱保护，来合成化合物8a-g。通过相似的策略合成化合物12a-c和14a-d。通过SPR评估缀合物8a-g，12a-c和14a-d对16S RNA，18S RNA和TAR RNA的结合亲和力。这表明缀合物12a-c和14a-d以与神经胺相同的水平与16S，18S RNA相互作用，与神经胺相比，14a和14d显示出对TAR RNA的约两倍的结合亲和力。但是，神经胺二核苷酸共轭物8a-g对16S，18S和TAR RNA的结合亲和力很弱，

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2008.09.062