3-{glycyl-[1-methyl-4-(4-amino-1-methylpyrrole-2-carboxamido)pyrrole-2-carboxamido]}dimethylaminopropane | 134985-42-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 3-{glycyl-[1-methyl-4-(4-amino-1-methylpyrrole-2-carboxamido)pyrrole-2-carboxamido]}dimethylaminopropane
• CAS: 134985-42-5
• 化学式: C₁₉H₂₉N₇O₃
• 分子量: 403.484
• InChiKey: ZILVRFFMRLRNMZ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.19
• 重原子数：
  29.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  126.42
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3,6-phenanthrenedicarboxylic acid 、 3-{glycyl-[1-methyl-4-(4-amino-1-methylpyrrole-2-carboxamido)pyrrole-2-carboxamido]}dimethylaminopropane 在 N-甲基吗啉 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以49%的产率得到phenanthrene-3,6-dicarboxamido{3-[glycyl-1-methyl-4-(4-amino-1-methylpyrrole-2-carboxamido)pyrrole-2-carboxamido]dimethylaminopropane}
  参考文献：
  名称：

  一些头对头连接的DNA小沟结合剂的合成

  摘要：

  已经制备了一系列首尾相连的杂环氨基酸二聚体，用于研究与DNA小沟结合的亲和力和选择性。合成目标的选择由基于计算机的设计主导。已经包括几种新颖的二羧酸连接基，包括吲哚，菲，芴酮和双苯并噻吩。通过印迹分析与DNA的结合表明对衍生自2,7-二氢菲二羧酸的化合物具有很高的亲和力，并且对包含至少4个AT对的AT富集区域具有主要选择性，但具有跨越两个CG碱基对的能力。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(00)00432-4
• 作为产物：
  描述：

  3-{carbobenzoxyglycyl-[1-methyl-4-(4-amino-1-methylpyrrole-2-carboxamido)pyrrole-2-carboxamido]}dimethylaminopropane 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 异丙醇 为溶剂， 反应 15.0h， 生成 3-{glycyl-[1-methyl-4-(4-amino-1-methylpyrrole-2-carboxamido)pyrrole-2-carboxamido]}dimethylaminopropane
  参考文献：
  名称：

  一些头对头连接的DNA小沟结合剂的合成

  摘要：

  已经制备了一系列首尾相连的杂环氨基酸二聚体，用于研究与DNA小沟结合的亲和力和选择性。合成目标的选择由基于计算机的设计主导。已经包括几种新颖的二羧酸连接基，包括吲哚，菲，芴酮和双苯并噻吩。通过印迹分析与DNA的结合表明对衍生自2,7-二氢菲二羧酸的化合物具有很高的亲和力，并且对包含至少4个AT对的AT富集区域具有主要选择性，但具有跨越两个CG碱基对的能力。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(00)00432-4