(4-(2-methyl-2-phenyl-1,3-dioxol-4-yl)butyl)-O-(2-cyanoethyl)-N-N-diisopropylphosphoramidite | 1238080-07-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (4-(2-methyl-2-phenyl-1,3-dioxol-4-yl)butyl)-O-(2-cyanoethyl)-N-N-diisopropylphosphoramidite
• 英文别名: 3-[[Di(propan-2-yl)amino]-[4-(2-methyl-2-phenyl-1,3-dioxol-4-yl)butoxy]phosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 1238080-07-3
• 化学式: C₂₃H₃₅N₂O₄P
• 分子量: 434.516
• InChiKey: SXZNGXDDVRNIFZ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.3
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.61
• 拓扑面积：
  64
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

文献信息

• Modified phosphorous intermediates for providing functional groups on the 5' end of oligonucleotides
  申请人：LA JOLLA PHARMACEUTICAL

  公开号：EP0523978A1

  公开（公告）日：1993-01-20

  Phosphoramidites of the formula    where R is a base-labile protecting group, R¹ and R² are individually alkyl of 1 to 6 carbon atoms, cycloalkyl of 3 to 8 carbon atoms, or aryl of 6 to 20 carbon atoms or are joined together to form with the nitrogen atom a cyclic structure of 4-7 carbon atoms and 0 to 1 annular chalcogen atoms of atomic number 8 to 16, G is a hydrocarbylene group of 1 to 20 carbon atoms and Z is a hydroxy-protected vicinal diol group bound to G by one of the vicinal diol carbon atoms or a disulfide group and bound to G by one of the sulfur atoms of the disulfide group, with the proviso that G is of at least 4 carbon atoms when Z is said disulfide group are used in conventional automated oligonucleotide synthesis to introduce a functional aldehyde or thiol group on the 5′ end of the oligonucleotide to thereby provide a reactive site on the oligonucleotide that may be used to conjugate the oligonucleotide to molecules that contain a free amino group or an electrophilic center reactive with a thiol group.

  式中的磷酰胺 其中 R 为碱基易败保护基团，R¹ 和 R² 分别为 1 至 6 个碳原子的烷基、3 至 8 个碳原子的环烷基或 6 至 20 个碳原子的芳基，或连接在一起与氮原子形成 4 至 7 个碳原子和 0 至 1 个原子序数为 8 至 16 的环状链烯原子的环状结构、G 是 1 至 20 个碳原子的烃基，Z 是羟基保护的沧海二醇基，通过沧海二醇的一个碳原子或二硫化物基团与 G 结合，并通过二硫化物基团的一个硫原子与 G 结合、在传统的寡核苷酸自动合成中，当 Z 为所述二硫基时，G 至少有 4 个碳原子，用于在寡核苷酸的 5′端引入功能性醛基或硫醇基，从而在寡核苷酸上提供一个反应位点，可用于将寡核苷酸与含有游离氨基或与硫醇基反应的亲电中心的分子共轭。
• US5391785A
  申请人：——

  公开号：US5391785A

  公开（公告）日：1995-02-21
• US5726329A
  申请人：——

  公开号：US5726329A

  公开（公告）日：1998-03-10
• US5786512A
  申请人：——

  公开号：US5786512A

  公开（公告）日：1998-07-28
• US5874552A
  申请人：——

  公开号：US5874552A

  公开（公告）日：1999-02-23