show that the Ni-center in the prosthetic group coenzyme F430 is penta- or hexacoordinated with the carboxamide group of a glutamine residue occupying the axial coordination site on the α-side of the macrocycle. To obtain diastereoselectively coordinated complexes for mechanistic and spectroscopic studies of the free coenzyme in solution, we aimed to prepare partial-synthetic derivatives of coenzyme F430
甲基
辅酶M还原酶的X射线结构表明,辅基辅酶F430的Ni中心与谷
氨酰胺残基的羧酰胺基具有5位或6位配位,谷
氨酰胺残基占据了大环α轴的轴向配位点。为了获得溶液中游离辅酶的机理和光谱学研究的非对映选择性配合物,我们旨在制备辅酶F430的部分合成衍
生物,该衍
生物具有通过以下方式连接的配位基团:
丙酸侧链之一的连接基。通过使用分子力学计算和两种不同的构象搜索方法,根据定义配位构象的几何标准,对一组包含
咪唑或
吡啶单元作为潜在
配体的50个结构进行了计算测试。最佳候选物被证明是含有脯
氨酸的三肽和四肽,其中甲基组
氨酸为C端残基。合成这些接头,并通过NMR确定其构象。通过使用实验确定的几何约束条件对分子模型进行改进,使我们能够确定三肽Pro-Pro-His(π - Me)-OMe(10)是在F430的C(3)或C(13)上连接到侧链的所有测试结构中最有希望的结构。