1-O-(chloromethyl)-2,3-di-O-benzyl-D-glycerol | 96429-72-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 甘油脂
• 英文名称: 1-O-(chloromethyl)-2,3-di-O-benzyl-D-glycerol
• CAS: 96429-72-0
• 化学式: C₁₈H₂₁ClO₃
• 分子量: 320.816
• InChiKey: RDSRHKPKYNXBJU-GOSISDBHSA-N

物化性质

• 沸点：
  437.0±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.146±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.0
• 重原子数：
  22.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  27.69
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  3.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-O-(chloromethyl)-2,3-di-O-benzyl-D-glycerol 在 4-二甲氨基吡啶 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三苯基氯硅烷 、 四氯化锡 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 10.0h， 生成 N⁴-benzoyl-1-{1′-[(2′′R)-2′′,3′′-bis(benzyloxy)propoxy]methyl}-5-fluorocytosine
  参考文献：
  名称：

  通过将无环5-氟胞嘧啶（FC）核苷掺入DNA，深入了解DNA胞嘧啶5甲基转移酶（DNMT）的识别机制。

  摘要：

  DNA胞嘧啶5甲基转移酶（DNMT）催化双链DNA中CpG序列中胞嘧啶C5位置的甲基化，从而在人细胞的表观遗传调控步骤中产生5-methylCpG（mCpG）。DNMT的整个反应机理分为六个步骤，即扫描，识别，翻转，环锁，甲基化和释放。甲基化和释放机制已得到充分研究；但是，关于其他反应步骤的报道很少。为了深入了解反应机理，我们计划将无环核苷掺入到寡聚脱氧核苷酸（ODNs）中，这可以使目标核碱基容易翻转出来，并研究了ODN和DNMT之间的相互作用。这里，我们描述了包含新的无环5-氟胞嘧啶核苷的ODN的设计和合成及其生理和生物学特性，包括它们与DNMT的相互作用。我们发现，包含无环5-氟胞嘧啶核苷的ODNs比包含5-氟-2'-脱氧胞苷的ODNs具有更高的柔韧性。由于B形式的螺旋度降低，预计ODN的观察到的柔韧性会影响扫描和识别步骤。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2018.05.008
• 作为产物：
  描述：

  1,2,5,6-tetra-O-benzyl-D-mannitol 在 盐酸 、 sodium tetrahydroborate 、 sodium periodate 、 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 1-O-(chloromethyl)-2,3-di-O-benzyl-D-glycerol
  参考文献：
  名称：

  （S）-，（R）-和（+/-）-9-[（2,3-二羟基-1-丙氧基）甲基]鸟嘌呤，2'-nor-2'的线性异构体的合成和抗疱疹活性-脱氧鸟苷。

  摘要：

  外消旋9-[（（2,3-二羟基-1-丙氧基）甲基]鸟嘌呤[（+/-）-iNDG]，无环鸟苷（ACV）的新类似物和2'-nor-2'-脱氧鸟苷的结构类似物（2'NDG），合成并发现抑制1型单纯疱疹病毒（HSV-1）和2型（HSV-2）的复制。随后，由手性中间体制备其旋光异构体（R）-和（S）-iNDG。制备1,2-二-O-苄基-D-和-L-甘油的氯甲基醚，使其与三（三甲基甲硅烷基）鸟嘌呤反应，得到9-烷基化的鸟嘌呤，将其通过催化氢解脱保护。针对细胞培养中的HSV-1和HSV-2，（S）-iNDG的活性比R对映异构体高约10至25倍，并且具有与ACV和2'NDG相当的ED50。（R）-iNDG的活性较差，其磷酸化产物对病毒DNA聚合酶的抑制作用较弱。在小鼠腹膜内或口腔内感染HSV-1或阴道内感染HSV-2的小鼠中，（S）-9-[（2,3-二羟基-1-丙氧基）甲基]鸟嘌呤[（S）-iNDG]的药效低于2

  DOI：

  10.1021/jm00145a014