(3R,S)-1-[3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-1,2-dideoxy-β-D-ribofuranos-1-yl]-5-phenylpent-4-yn-3-one | 1352789-49-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (3R,S)-1-[3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-1,2-dideoxy-β-D-ribofuranos-1-yl]-5-phenylpent-4-yn-3-one
• 英文别名: 5-[(6aR,8S,9aS)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]-1-phenylpent-1-yn-3-one
• CAS: 1352789-49-1
• 化学式: C₂₈H₄₄O₅Si₂
• 分子量: 516.825
• InChiKey: FCYHZZDNGHRNMP-HZFUHODCSA-N

物化性质

• 沸点：
  527.4±35.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.05±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.5
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.68
• 拓扑面积：
  54
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3R,S)-1-[3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-1,2-dideoxy-β-D-ribofuranos-1-yl]-5-phenylpent-4-yn-3-one 在 4-二甲氨基吡啶 、 四丁基氟化铵 、 三乙胺 作用下， 以 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 53.0h， 生成 4-[2-(5-O-dimethoxytrityl-1,2-dideoxy-β-D-ribofuranos-1-yl)ethyl]-2-phenyl-3H-1,5-benzodiazepine
  参考文献：
  名称：

  高-C-核苷亚磷酰胺的合成及其在寡核苷酸中的位点特异性掺入

  摘要：

  开发了一种有效的方法来制备同型-C-核苷。D-核糖的β-烯丙基C-糖苷转化为噻吩并嘧啶核苷和2-脱氧-D-核糖的苯二氮卓核苷。为了通过固相合成掺入寡核苷酸，两种衍生物都被转化为相关的 3'-亚磷酰胺结构单元。然后将这些亚磷酰胺定点掺入 DNA 寡核苷酸中。将修饰后的 DNA 链与不同的 DNA 和 RNA 链杂交，研究了它们的解链温度和圆二色光谱。有趣的是，尽管在 DNA-DNA 杂交的情况下，非天然核苷导致熔解温度显着降低，甚至低于错配杂交的水平，

  DOI：

  10.1002/ejoc.201500996
• 作为产物：
  描述：

  (2R,3S,4R,5S)-2-(hydroxymethyl)-5-(prop-2-en-1-yl)oxolane-3,4-diol 在 咪唑 、 硼烷四氢呋喃络合物 、 偶氮二异丁腈 、 碘 、 三正丁基氢锡 、 碳酸氢钠 、 戴斯-马丁氧化剂 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 30.0h， 生成 (3R,S)-1-[3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-1,2-dideoxy-β-D-ribofuranos-1-yl]-5-phenylpent-4-yn-3-one
  参考文献：
  名称：

  高-C-核苷亚磷酰胺的合成及其在寡核苷酸中的位点特异性掺入

  摘要：

  开发了一种有效的方法来制备同型-C-核苷。D-核糖的β-烯丙基C-糖苷转化为噻吩并嘧啶核苷和2-脱氧-D-核糖的苯二氮卓核苷。为了通过固相合成掺入寡核苷酸，两种衍生物都被转化为相关的 3'-亚磷酰胺结构单元。然后将这些亚磷酰胺定点掺入 DNA 寡核苷酸中。将修饰后的 DNA 链与不同的 DNA 和 RNA 链杂交，研究了它们的解链温度和圆二色光谱。有趣的是，尽管在 DNA-DNA 杂交的情况下，非天然核苷导致熔解温度显着降低，甚至低于错配杂交的水平，

  DOI：

  10.1002/ejoc.201500996

文献信息

• A versatile approach to novel homo-C-nucleosides based on aldehydes and acetylenic ketones derived from ribo- and 2-deoxy-ribofuranose C-glycosides
  作者：Heike Waechtler、Dilver Peña Fuentes、José A. Quincoces Suarez、Dirk Michalik、Alexander Villinger、Udo Kragl、Christian Vogel

  DOI：10.3998/ark.5550190.0013.310

  日期：——

  ranosyl-1-yl)propanal (1), 3-(1,2-dideoxy-β-D-ribofuranos-1-yl)propanal (14), 1-(1-desoxy-β-D-ribofuranos-1-yl)pent-4-yn- 3-on (19), 1-(1-desoxy-β-D-ribofuranos-1-yl)-5-phenyl-pent-4-yn-3-on (20), 1-(1,2-didesoxy-β- D-ribofuranos-1-yl)pent-4-yn-3-on (29), and 1-(1,2-didesoxy-β-D-ribofuranos-1-yl)-5-phenyl- pent-4-yn-3-on (30) with different nucleophiles. The preparation of 1 and 14 proceeds by Knoevenagel

  通过完全保护的 3-(1-脱氧-β-D-呋喃核糖基-1-基)丙醛 (1), 3-( 1,2-dideoxy-β-D-ribofuranos-1-yl)propanal (14), 1-(1-desoxy-β-D-ribofuranos-1-yl)pent-4-yn-3-on (19) , 1-(1-desoxy-β-D-ribofuranos-1-yl)-5-phenyl-pent-4-yn-3-on (20), 1-(1,2-didesoxy-β-D-ribofuranos -1-基)pent-4-yn-3-on (29)和1-(1,2-二脱氧-β-D-呋喃核糖-1-基)-5-苯基-pent-4-yn-3 -on (30) 与不同的亲核试剂。1和14的制备通过与丙二腈、氰基乙酰胺和2-氰基-N-(4-甲氧基-苯基)乙酰胺的Knoevenagel反应进行，随后用硫环化成噻吩5、7、8、16，然后用原甲酸三乙酯环化得到噻吩并嘧啶
• A Versatile Approach to Alcohol, Aldehyde, Ketone and Amine Derivatives Starting from β-Allyl C-Glycosides of d-Ribofuranose and 2-Deoxy-d-ribofuranose
  作者：Christian Vogel、Heike Wächtler、Dilver Fuentes、Dirk Michalik、Martin Köckerling、Alexander Villinger、Udo Kragl、Quirino Cedeño

  DOI：10.1055/s-0030-1260200

  日期：2011.10

  An efficient preparative procedure is described, leading from β-allyl C-glycosides of d-ribofuranose to alcohols by a hydroboration-oxidation procedure. The corresponding aldehydes were obtained by Swern or Dess-Martin oxidation. Alternatively, two of the alcohols were mesylated to gain access to azides and amines. Treatment of the aldehydes with ethynylmagnesium bromide or phenylethynyllithium and consecutive oxidation of the diastereomeric­ alcohols provided the acetylenic ketones in good to excellent yields. The obtained derivatives serve as important intermediates for the synthesis of various heterocyclic systems.

  本研究介绍了一种高效的制备方法，通过氢硼氧化法将 d-ribofuranose 的δ-烯丙基 C-糖苷转化为醇。通过 Swern 或 Dess-Martin 氧化反应可得到相应的醛。此外，还可对其中两种醇进行甲磺酰化，以获得叠氮化物和胺。用乙炔溴化镁或苯乙炔锂处理醛类，并连续氧化非对映醇，可得到乙炔酮，收率从良好到极佳。获得的衍生物是合成各种杂环系统的重要中间体。
• Synthesis of Homo-C-Nucleoside Phosphoramidites and Their Site-Specific Incorporation into Oligonucleotides
  作者：Katharina Höfler、Tristan Zimmermann、Dilver Peña Fuentes、Christian Vogel、Chris Meier

  DOI：10.1002/ejoc.201500996

  日期：2015.11

  thienopyrimidine nucleoside and the benzodiazepine nucleoside of 2-deoxy-D-ribose. For incorporation into oligonucleotides by solid-phase synthesis, both derivatives were transformed into the related 3′-phosphoramidite building blocks. These phosphoramidites were then site-specifically incorporated into DNA oligonucleotides. The modified DNA strands were hybridized with different DNA and RNA strands, and

  开发了一种有效的方法来制备同型-C-核苷。D-核糖的β-烯丙基C-糖苷转化为噻吩并嘧啶核苷和2-脱氧-D-核糖的苯二氮卓核苷。为了通过固相合成掺入寡核苷酸，两种衍生物都被转化为相关的 3'-亚磷酰胺结构单元。然后将这些亚磷酰胺定点掺入 DNA 寡核苷酸中。将修饰后的 DNA 链与不同的 DNA 和 RNA 链杂交，研究了它们的解链温度和圆二色光谱。有趣的是，尽管在 DNA-DNA 杂交的情况下，非天然核苷导致熔解温度显着降低，甚至低于错配杂交的水平，