methyl 2-[2-(thiophen-2-yl)ethylamine]acetate | 158458-82-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl 2-[2-(thiophen-2-yl)ethylamine]acetate
• 英文别名: Methyl 2-{[2-(thiophen-2-YL)ethyl]amino}acetate；methyl 2-(2-thiophen-2-ylethylamino)acetate
• CAS: 158458-82-3
• 化学式: C₉H₁₃NO₂S
• mdl: MFCD11153480
• 分子量: 199.274
• InChiKey: ZXMYWILLCWUBGN-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.444
• 拓扑面积：
  66.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 2-[2-(thiophen-2-yl)ethylamine]acetate 在 碳酸氢钠 、 三氟乙酸 作用下， 以 吡啶 、 乙醚 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 (2S)-1-N-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-2-N-phenyl-1-N-(2-thiophen-2-ylethyl)pyrrolidine-1,2-dicarboxamide
  参考文献：
  名称：

  N-Alkyl Urea Hydroxamic Acids as a New Class of Peptide Deformylase Inhibitors with Antibacterial Activity

  摘要：

  摘要肽变形酶（PDF）是一种原核生物金属酶，对细菌生长至关重要，是开发抗菌剂的新靶点。之前报道的所有具有足够抗菌活性的 PDF 抑制剂都有一个共同的结构特征，即在 P1′位点上有一个 2-取代的烷酰基。通过迭代平行合成和传统药物化学的结合，我们发现了一类新的 PDF 抑制剂，其 P1′位点上含有 N-烷基脲。我们发现了对革兰氏阳性和革兰氏阴性病原体（包括金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌和流感嗜血杆菌）的 MIC ≤4 μg/ml 的化合物。抑制 EscherichiacoliNi-PDF 50%酶活性所需的浓度（IC50s）≤0.1 μM，这表明了抑制剂的特异性。此外，这些化合物对 PDF 具有很高的选择性，对母细胞蛋白酶和其他哺乳动物金属蛋白酶的 IC50 始终为 >200 μM。结构-活性关系分析确定了可提高效力和降低细胞毒性的优选替代物。其中一种化合物（VRC4307）与 PDF 进行了共晶体化，并确定了分辨率为 1.7 Å 的酶抑制剂结构。这一结构信息表明，脲化合物的结合位置与之前确定的琥珀酸羟肟酸酯的结合位置相似。在小鼠保护试验中，VRC4232 和 VRC4307 这两种化合物显示出体内疗效，50% 的保护剂量分别为 30.8 毫克/千克体重和 17.9 毫克/千克体重。这些 N-烷基脲羟肟酸为确定可用作抗菌剂的新型 PDF 抑制剂提供了一个起点。

  DOI：

  10.1128/aac.46.9.2752-2764.2002
• 作为产物：
  描述：

  2-噻吩乙醇 、 甘胺酸甲酯 在 碳酸氢钠 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 三苯基膦 、 TBDE-PS 、 苯硫酚 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 methyl 2-[2-(thiophen-2-yl)ethylamine]acetate
  参考文献：
  名称：

  N-Alkyl Urea Hydroxamic Acids as a New Class of Peptide Deformylase Inhibitors with Antibacterial Activity

  摘要：

  摘要肽变形酶（PDF）是一种原核生物金属酶，对细菌生长至关重要，是开发抗菌剂的新靶点。之前报道的所有具有足够抗菌活性的 PDF 抑制剂都有一个共同的结构特征，即在 P1′位点上有一个 2-取代的烷酰基。通过迭代平行合成和传统药物化学的结合，我们发现了一类新的 PDF 抑制剂，其 P1′位点上含有 N-烷基脲。我们发现了对革兰氏阳性和革兰氏阴性病原体（包括金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌和流感嗜血杆菌）的 MIC ≤4 μg/ml 的化合物。抑制 EscherichiacoliNi-PDF 50%酶活性所需的浓度（IC50s）≤0.1 μM，这表明了抑制剂的特异性。此外，这些化合物对 PDF 具有很高的选择性，对母细胞蛋白酶和其他哺乳动物金属蛋白酶的 IC50 始终为 >200 μM。结构-活性关系分析确定了可提高效力和降低细胞毒性的优选替代物。其中一种化合物（VRC4307）与 PDF 进行了共晶体化，并确定了分辨率为 1.7 Å 的酶抑制剂结构。这一结构信息表明，脲化合物的结合位置与之前确定的琥珀酸羟肟酸酯的结合位置相似。在小鼠保护试验中，VRC4232 和 VRC4307 这两种化合物显示出体内疗效，50% 的保护剂量分别为 30.8 毫克/千克体重和 17.9 毫克/千克体重。这些 N-烷基脲羟肟酸为确定可用作抗菌剂的新型 PDF 抑制剂提供了一个起点。

  DOI：

  10.1128/aac.46.9.2752-2764.2002

文献信息

• [EN] CCK AND/OR GASTRIN RECEPTOR LIGANDS<br/>[FR] LIGANDS POUR LES RECEPTEURS DE LA CCK ET/OU LA GASTRINE
  申请人：FERRING B.V.

  公开号：WO1993020099A2

  公开（公告）日：1993-10-14

  (EN) This invention relates to novel compounds with the general structure A-B-C and their pharmaceutically acceptable salts, to medicinal compositions containing them, and to the use of such medicinal compositions in the treatment of certain disease states. The compounds of the invention are represented schematically as A-B-C wherein S1-S4 are in general lypophilic residues, S5 is a polar or hydrophilic residue, and L1-L5 are optional linking units. The compounds of this invention bind to CCK and/or gastrin receptors with high affinity and are therefore useful in the treatment of diseases which involve the dysfunction of a physiological process regulated by either of these hormones.(FR) Cette invention concerne de nouveaux composés de la structure générale A-B-C et leurs sels acceptables sur le plan pharmaceutique, des compositions médicinales les contenant et l'utilisation de telles compositions médicinales pour le traitement de certaines maladies. Les composés de l'invention sont représentés schématiquement par A-B-C où S1-S4 sont d'une façon générale des groupements lipophiles, S5 est un groupement polaire ou hydrophile et L1-L5 sont des unités de liaison facultatives. Les composés de cette invention se fixent aux récepteurs de la cholécystokinine et/ou de la gastrine avec une très grande affinité et sont donc utiles pour le traitement de maladies découlant d'un dysfonctionnement d'un processus physiologique régulé par l'une ou l'autre de ces hormones.