U-triazole-C1-β-GlcNAc | 1195960-61-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: U-triazole-C1-β-GlcNAc
• 英文别名: N-[(2R,3R,4R,5S,6R)-2-[[1-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl]triazol-4-yl]methoxy]-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]acetamide
• CAS: 1195960-61-2
• 化学式: C₂₀H₂₈N₆O₁₁
• 分子量: 528.476
• InChiKey: NTNSUCAAOPXZHU-TXLUXDHQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.2
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  238
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  、 N-acetyl-1-O-propargyl-β-D-glucosaminide 在 5-(1,2-dihydroxyethyl)-4-hydroxy-3-(sodiooxy)-2,5-dihydrofuran-2-one 、 tris[1-benzyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl]amine 、 copper(I) bromide 作用下， 以 甲醇 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.5h， 以76%的产率得到U-triazole-C1-β-GlcNAc
  参考文献：
  名称：

  Nucleoside triphosphate mimicry: a sugar triazolyl nucleoside as an ATP-competitive inhibitor of B. anthracis pantothenate kinase

  摘要：

  本文描述了一组核苷三磷酸类似物的合成，其中以中性的甲撑-三唑连接的单糖侧链取代了与Mg2+螯合的核苷三磷酸侧链。这些化合物被评估为炭疽杆菌泛酸激酶的抑制剂，并且发现一种竞争性抑制剂的Ki值比ATP的Km值低3倍。

  DOI：

  10.1039/b909729e

文献信息

• Structure-based design of UDP-GlcNAc analogs as candidate GnT-V inhibitors
  作者：Amol M. Vibhute、Hide-nori Tanaka、Sushil K. Mishra、Reina F. Osuka、Masamichi Nagae、Chizuko Yonekawa、Hiroaki Korekane、Robert J. Doerksen、Hiromune Ando、Yasuhiko Kizuka

  DOI：10.1016/j.bbagen.2022.130118

  日期：2022.6

  pocket structure, we hypothesized that UDP-GlcNAc analogs with increasing hydrophobicity may be GnT-V inhibitors. Methods: We chemically synthesized 10 UDP-GlcNAc analogs in which one or two phosphate groups were replaced with hydrophobic groups. To test these compounds, we set up an HPLC-based enzyme assay system for all N-glycan-branching GlcNAc transferases in which GnT-I–V activity was measured using

  背景： N-聚糖分支调节糖蛋白的各种功能。 N-乙酰葡糖胺基转移酶 V (GnT-V) 是一种作用于N-聚糖的 GlcNAc 转移酶，产生 GnT-V 的分支与癌症进展高度相关。这表明特定的GnT-V抑制剂可能成为癌症治疗的候选药物。为了设计新型 GnT-V 抑制剂，我们重点关注 GnT-V 对供体底物 UDP-GlcNAc 的独特且弱的识别。基于催化口袋结构，我们假设疏水性增加的UDP-GlcNAc类似物可能是GnT-V抑制剂。 方法：我们化学合成了 10 种 UDP-GlcNAc 类似物，其中一个或两个磷酸基团被疏水基团取代。为了测试这些化合物，我们针对所有N -聚糖分支 GlcNAc 转移酶建立了基于 HPLC 的酶测定系统，其中使用纯化的截短酶测量 GnT-I-V 活性。使用该系统，我们评估了合成化合物对 GnT-V 的抑制作用及其特异性。 结果：几种 UDP-GlcNAc 类似物抑制