(R)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-((4-methylbenzyl)selanyl)propanoic acid | 1365284-49-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (R)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-((4-methylbenzyl)selanyl)propanoic acid
• 英文别名: Fmoc-Sec(4-methoxybenzyl)-OH；Fmoc-Sec(Meb)-OH；Fmoc-Sec(pMeBzl)-OH；(2R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-[(4-methylphenyl)methylselanyl]propanoic acid
• CAS: 1365284-49-6
• 化学式: C₂₆H₂₅NO₄Se
• 分子量: 494.449
• InChiKey: ONTNSAXNCVVXSV-DEOSSOPVSA-N

物化性质

• 沸点：
  690.7±55.0 °C(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.61
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  75.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 危险类别：
  6.1
• 危险性防范说明：
  P501,P273,P260,P270,P271,P264,P280,P302+P352,P391,P314,P337+P313,P305+P351+P338,P362+P364,P332+P313,P301+P310+P330,P304+P340+P311,P403+P233,P405
• 危险品运输编号：
  3283
• 危险性描述：
  H301+H331,H315,H319,H373,H410
• 包装等级：
  III

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-甘氨酸 、 (R)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-((4-methylbenzyl)selanyl)propanoic acid 、 Fmoc-L-苯丙氨酸 、 Fmoc-Thr-OH 、 FMOC-赖氨酸 在 哌啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  口服抗癌异双金属 PtIV−AuI 配合物显示出高体内活性和低毒性

  摘要：

  具有双重作用机制的口服抗癌异双金属 Pt IV -Au I N -杂环卡宾配合物在体内表现出高效低毒。两种金属的结合导致对硫氧还蛋白还原酶的增强抑制作用，并促进前药在激活前共同转运到肿瘤中。

  DOI：

  10.1002/anie.202217233
• 作为产物：
  描述：

  4-甲基氯苄 在 sodium tetrahydroborate 、 碳酸氢钠 、 sodium hydroxide 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 (R)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-((4-methylbenzyl)selanyl)propanoic acid
  参考文献：
  名称：

  类乳唑硫肽的固相合成

  摘要：

  报道了从头发现的类乳唑硫肽的合成策略。该方法围绕中心三杂环氨基酸的收敛和可扩展制备及其在 Fmoc 固相肽合成中用于模块化肽链组装的利用。还描述了一种用于制备用于生物学研究的 C 末端功能化硫肽的技术。11 种 TNIK 抑制剂硫肽及其 6 种衍生物的多毫克量合成突出了所开发协议的实用性。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.2c02870

文献信息

• Cyclization of Peptides by using Selenolanthionine Bridges
  作者：Aline Dantas de Araujo、Mehdi Mobli、Glenn F. King、Paul F. Alewood

  DOI：10.1002/anie.201204229

  日期：2012.10.8

  Selenocysteine does the job: Lanthionine bridges are important structural elements in naturally occurring lantibiotics. They can be engineered into peptides to increase biological activity and metabolic stability. Macrocyclization of peptides by intramolecular thiolation of cysteine is often difficult but can be achieved by replacing cysteine with the more reactive isosteric selenocysteine amino acid

  硒代半胱氨酸发挥作用：羊毛硫氨酸桥是天然存在的羊毛硫抗生素中的重要结构元素。它们可以被工程化为肽以增加生物活性和代谢稳定性。通过半胱氨酸的分子内硫醇化作用使肽大环化通常是困难的，但是可以通过用反应性更强的等排硒代半胱氨酸氨基酸代替半胱氨酸来实现。
• The use of 2,2′-dithiobis(5-nitropyridine) (DTNP) for deprotection and diselenide formation in protected selenocysteine-containing peptides
  作者：Alayne L. Schroll、Robert J. Hondal、Stevenson Flemer

  DOI：10.1002/psc.1430

  日期：2012.3

  cysteine derivatives in solid phase peptide synthesis, there is a striking paucity of analogous selenocysteine Se‐protecting groups in the literature. However, the growing interest in selenocysteine‐containing peptides and proteins requires a corresponding increase in availability of synthetic routes into these target molecules. It therefore becomes important to design new sidechain protection strategies

  与固相肽合成中可用于半胱氨酸衍生物的大量侧链保护基团相比，类似的硒代半胱氨酸硒显着缺乏- 文献中的保护基团。然而，对含硒代半胱氨酸的肽和蛋白质的兴趣日益增长，需要相应增加合成这些目标分子的途径。因此，为硒代半胱氨酸设计新的侧链保护策略以及用于去除硒代半胱氨酸的多种新型脱保护化学变得很重要。在本文中，我们概述了两种新的 Fmoc 硒代半胱氨酸衍生物 [Fmoc-Sec(Meb) 和 Fmoc-Sec(Bzl)] 的合成，以配合市售的 Fmoc-Sec(Mob) 衍生物并将它们合并到两个模型肽中。使用我们小组先前描述的 2,2'-二硫双 (5-硝基吡啶) (DTNP) 条件对这些肽进行了 Sec 脱保护试验。进一步评估了脱保护方法是否适用于介导催产素模板化目标肽中同时形成的二硒化物。发现 Sec(Mob) 和 Sec(Meb) 对 DTNP 条件非常不稳定，无论是否存在茴香硫醚，而 Sec(Bzl)
• A Compact Reprogrammed Genetic Code for De Novo Discovery of Proteolytically Stable Thiopeptides
  作者：Alexander A. Vinogradov、Yue Zhang、Keisuke Hamada、Shunsuke Kobayashi、Kazuhiro Ogata、Toru Sengoku、Yuki Goto、Hiroaki Suga

  DOI：10.1021/jacs.3c12037

  日期：2024.3.27

  that the utilization of compact reprogrammed genetic codes in mRNA display libraries can lead to the discovery of thiopeptides predominantly composed of nonproteinogenic structural elements. We demonstrate the feasibility of our designs by conducting affinity selections against Traf2- and NCK-interacting kinase (TNIK). The experiment identified a series of thiopeptides with high affinity to the target

  硫肽是一组结构复杂的肽类天然产物，在生物工程应用中具有广阔的前景。先前建立的硫肽/mRNA展示平台能够从头发现具有设计生物活性的类似天然产物的硫肽。然而，与天然硫肽相比，所发现的结构主要由蛋白氨基酸组成，这在许多情况下导致代谢稳定性较低。在这里，我们重新开发了该平台，并证明在 mRNA 展示库中利用紧凑的重编程遗传密码可以发现主要由非蛋白结构元件组成的硫肽。我们通过针对 Traf2 和 NCK 相互作用激酶 (TNIK) 进行亲和力选择来证明我们设计的可行性。实验鉴定出一系列与目标蛋白具有高亲和力（最佳K D = 2.1 nM）和激酶抑制活性（最佳IC 50 = 0.15 μM）的硫肽。这些发现的化合物在 18 个残基大环中含有多达 15 个非蛋白氨基酸，在人血清中表现出高代谢稳定性，半衰期长达 99 小时。 TNIK 与发现的硫肽复合物的 X 射线共晶结构揭示了非蛋白结构单元如何促进靶标
• Flemer, Stevenson, Protein and Peptide Letters, 2014, vol. 21, # 12, p. 1257 - 1264
  作者：Flemer, Stevenson

  DOI：——

  日期：——