1-(4-quinolyl)methyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecane | 250692-35-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: 1-(4-quinolyl)methyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecane
• 英文别名: cy4q；4-(1,4,7,10-Tetraazacyclododecan-1-Ylmethyl)quinoline；4-(1,4,7,10-tetrazacyclododec-1-ylmethyl)quinoline
• CAS: 250692-35-4
• 化学式: C₁₈H₂₇N₅
• 分子量: 313.446
• InChiKey: ZOBKJHWKGWGMPU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.6
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  52.2
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(4-quinolyl)methyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecane 、 zinc(II) chloride 以 乙醇 为溶剂， 以75%的产率得到[Zn(1-(4-quinolyl)methyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecane)(H2O)]Cl2
  参考文献：
  名称：

  双功能锌（II）大环复合物识别DNA中胸腺嘧啶凸起的结构基础

  摘要：

  1-（4-喹啉基）甲基-1,4,7,10-四氮杂环十二烷（cy4q）的锌（II）络合物选择性结合DNA中的胸腺嘧啶凸起和RNA中的尿嘧啶凸起。对于发夹茎中的胸腺嘧啶隆起，在DNA双链体中的胸腺嘧啶隆起和在RNA发夹中的尿嘧啶隆起，结合常数在低微摩尔范围内。Zn（cy4q）与一系列含有不同侧翼碱基的胸腺嘧啶凸起的发夹的结合研究表明，该复合物对胸腺嘧啶凸起与邻近的嘌呤具有中等选择性。最牢固结合的Zn（cy4q）–DNA胸腺嘧啶凸出加合物的解离常数比具有完全互补茎的相似序列或含有胞嘧啶，鸟嘌呤或腺嘌呤的凸出更紧密100倍。为了探讨悬垂基团的作用，另外三种含有1,4,7，N，N-二甲基萘-1-胺（dsc）。Zn（cybp）复合物以适度的亲和力结合，但对胸腺嘧啶凸起的DNA发夹和缺乏凸起的DNA的选择性很小。同样，Zn（dsc）与胸腺嘧啶凸起和具有完全互补茎的发夹均弱结合。cy2q的锌（II）配合物具有与Zn

  DOI：

  10.1021/ic3004245

文献信息

• Structural Basis for Bifunctional Zinc(II) Macrocyclic Complex Recognition of Thymine Bulges in DNA
  作者：Imee Marie A. del Mundo、Kevin E. Siters、Matthew A. Fountain、Janet R. Morrow

  DOI：10.1021/ic3004245

  日期：2012.5.7

  10-tetraazacyclododecane (cy4q) binds selectively to thymine bulges in DNA and to a uracil bulge in RNA. Binding constants are in the low-micromolar range for thymine bulges in the stems of hairpins, for a thymine bulge in a DNA duplex, and for a uracil bulge in an RNA hairpin. Binding studies of Zn(cy4q) to a series of hairpins containing thymine bulges with different flanking bases showed that the complex

  1-（4-喹啉基）甲基-1,4,7,10-四氮杂环十二烷（cy4q）的锌（II）络合物选择性结合DNA中的胸腺嘧啶凸起和RNA中的尿嘧啶凸起。对于发夹茎中的胸腺嘧啶隆起，在DNA双链体中的胸腺嘧啶隆起和在RNA发夹中的尿嘧啶隆起，结合常数在低微摩尔范围内。Zn（cy4q）与一系列含有不同侧翼碱基的胸腺嘧啶凸起的发夹的结合研究表明，该复合物对胸腺嘧啶凸起与邻近的嘌呤具有中等选择性。最牢固结合的Zn（cy4q）–DNA胸腺嘧啶凸出加合物的解离常数比具有完全互补茎的相似序列或含有胞嘧啶，鸟嘌呤或腺嘌呤的凸出更紧密100倍。为了探讨悬垂基团的作用，另外三种含有1,4,7，N，N-二甲基萘-1-胺（dsc）。Zn（cybp）复合物以适度的亲和力结合，但对胸腺嘧啶凸起的DNA发夹和缺乏凸起的DNA的选择性很小。同样，Zn（dsc）与胸腺嘧啶凸起和具有完全互补茎的发夹均弱结合。cy2q的锌（II）配合物具有与Zn