N-[4-[bis(1H-benzimidazol-2-ylmethyl)amino]-4-oxobutyl]-1-methyl-4-[[1-methyl-4-[[1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carbonyl)amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]pyrrole-2-carboxamide | 1000198-46-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-[4-[bis(1H-benzimidazol-2-ylmethyl)amino]-4-oxobutyl]-1-methyl-4-[[1-methyl-4-[[1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carbonyl)amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]pyrrole-2-carboxamide
• CAS: 1000198-46-8
• 化学式: C₄₄H₄₄N₁₄O₇
• 分子量: 880.923
• InChiKey: PWXWCCWPIKMBKQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.8
• 重原子数：
  65
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  260
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4-(1-methyl-4-(1-methyl-4-(1-methyl-4-(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)butanoic acid 、 bis(benzimidazol-2-ylmethyl)amine 在 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 以62%的产率得到N-[4-[bis(1H-benzimidazol-2-ylmethyl)amino]-4-oxobutyl]-1-methyl-4-[[1-methyl-4-[[1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carbonyl)amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]pyrrole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Zn（II）-IDB复合物的合成及生物学评估，该复合物附加有低聚聚酰胺作为有效的人工核酸酶。

  摘要：

  已经成功合成，表征和评估了锌（II）配合物，该配合物包含通过柔性接头缀合的低聚聚酰胺和双（2-苯并咪唑基甲基）胺（IDB），并被评估为DNA裂解剂。通过电泳研究了这些复合物对DNA的切割活性。结果表明，与不使用低聚聚酰胺的复合物相比，锌（II）配合物的切割活性增强。特别是，在高反应浓度（1.2mM）下，Zn（II）复合物可以切割具有一定选择性的质粒DNA。此外，光谱数据表明具有寡聚酰胺主链的Zn（II）复合物具有富含AT（腺嘌呤和胸腺嘧啶）的序列偏好。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2008.09.074