4-硫-ump二钠盐 | 4145-46-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 中文名称: 4-硫-ump二钠盐
• 英文名称: 4-Thiouridin-5'-phosphat
• 英文别名: 4-thio-UMP；4-Thiouridine-5'-monophosphate；[(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(2-oxo-4-sulfanylidenepyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 4145-46-4
• 化学式: C₉H₁₃N₂O₈PS
• 分子量: 340.251
• InChiKey: CKTAUHRBDDXUDJ-XVFCMESISA-N

物化性质

• 密度：
  1.88±0.1 g/cm3(Predicted)
• 稳定性/保质期：
  在常温常压下保持稳定

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  181
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

安全信息

• 危险类别码：
  R66
• 安全说明：
  S24
• 储存条件：
  -20℃下应避光、存于通风且干燥的地方，并密封保存。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-硫-ump二钠盐 在 sodium hydroxide 、 N,N'-羰基二咪唑 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 56.0h， 生成 methyl 3-[1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-[[hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]sulfanylpropanoate
  参考文献：
  名称：

  尿苷 5'-二磷酸类似物在人 P2Y6 受体上的结构-活性关系。

  摘要：

  研究了尿嘧啶核苷酸激活的 P2Y6 受体的结构-活性关系和分子模型。合成了带有核糖部分、尿嘧啶环和二磷酸基团取代的尿苷 5'-二磷酸 (UDP) 类似物，并测定了其对人 P2Y6 受体的活性。尿嘧啶环在 4 位上进行修饰，合成 4-取代的硫尿苷 5'-二磷酸类似物，以及在 2、3 和 5 位进行修饰。研究了磷酸链水平修饰的影响通过制备环状3',5'-二磷酸类似物、3'-二磷酸类似物和几种二核苷酸二磷酸。 5-Iodo-UDP 32 (EC50 = 0.15 microM) 与 UDP 等价，而 2'-羟基（氨基、叠氮基）的取代会大大降低效力。与 UDP 相比，2- 和 4- 硫代类似物分别为 20 和 21 也相对有效。然而，大多数其他修改大大降低了效力。分子模型表明，5'-UDP 和类似物的 β-磷酸对于与受体的三个保守阳离子残基中的两个建立静电相互作用至关重要。在4-硫醚衍生物中，4-乙硫基类似物23显示出0

  DOI：

  10.1021/jm060485n
• 作为产物：
  描述：

  2',3',5'-三乙酰尿苷 在 劳森试剂 、 氨 、 水 、 三乙基碳酸氢铵缓冲液 、 1,8-双二甲氨基萘 、 三氯氧磷 作用下， 以 甲醇 、 磷酸三乙酯 、 苯 为溶剂， 反应 42.0h， 生成 4-硫-ump二钠盐
  参考文献：
  名称：

  Structural Modifications of UMP, UDP, and UTP Leading to Subtype-Selective Agonists for P2Y₂, P2Y₄, and P2Y₆ Receptors

  摘要：

  A large series of derivatives and analogues of the uracil nucleotides UMP, UDP, and UTP with modifications in various positions of the uracil moiety and/or the phosphate groups were synthesized and evaluated at human P2Y(2), P2Y(4), and P2Y(6) receptors. 2-(Ar)alkylthio substitution of UMP and UDP was best tolerated by the P2Y(2) receptor, 2-Phenethylthio-UMP (13e) showed an EC50 value of 1.3 mu M at P2Y(2) and > 70-fold selectivity versus P2Y(4) and P2Y(6) receptors. Substitution of the 2-keto group in UMP by NH (13g, iso-CMP) resulted in the first potent and selective P2Y(4) agonist (EC50 4.98 mu M > 20-fold selective vs P2Y(2) and P2Y(6)). In contrast, :replacement of the 2-keto function in UDP by NH yielded a potent P2Y(2) agonist (12g, iso-CDP, EC50 = 0.604 mu M, > 100-fold selective). In an attempt to obtain metabolically stable UTP analogues, beta,gamma-dichloro- and beta,gamma-difluoro-methylene-UTP derivatives were synthesized. The triphosphate modifications were much better tolerated by P2Y(2), and in some cases also by P2Y(6), than by P2Y(4) receptors. 4-Thio-beta,gamma-difluoromethylene-UTP (14g) was a potent P2Y(2) agonist with an EC50 value of 0.134 mu M and > 50-fold selectivity. N3-Phenacyl-beta,gamma-dichloromethylene-UTP (14b) proved to be a potent P2Y(6) receptor agonist (EC50 0.142 mu M) with high selectivity versus P2Y(4) (50-fold) and moderate selectivity versus P2Y(2) receptors (6-fold).

  DOI：

  10.1021/jm1016297

文献信息

• Human P2Y₁₄ Receptor Agonists: Truncation of the Hexose Moiety of Uridine-5′-Diphosphoglucose and Its Replacement with Alkyl and Aryl Groups
  作者：Arijit Das、Hyojin Ko、Lauren E. Burianek、Matthew O. Barrett、T. Kendall Harden、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/jm901432g

  日期：2010.1.14

  Uridine-5′-diphosphoglucose (UDPG) activates the P2Y14 receptor, a neuroimmune system GPCR. P2Y14 receptor tolerates glucose substitution with small alkyl or aryl groups or its truncation to uridine 5′-diphosphate (UDP), a full agonist at the human P2Y14 receptor expressed in HEK-293 cells. 2-Thiouracil derivatives displayed selectivity for activation of the human P2Y14 vs the P2Y6 receptor, such as

  尿苷-5'-二磷酸葡萄糖 (UDPG) 激活 P2Y 14受体，这是一种神经免疫系统 GPCR。P2Y 14受体耐受用小烷基或芳基取代的葡萄糖或其截断为尿苷 5'-二磷酸 (UDP)，这是在 HEK-293 细胞中表达的人类 P2Y 14受体的完全激动剂。2-硫尿嘧啶衍生物显示出激活人 P2Y 14与 P2Y 6受体的选择性，例如 2-硫代-UDP 4（EC 50 = 1.92 nM，P2Y 14，选择性比 P2Y 6 高224 倍）及其β-丙氧基酯18 . 欧共体50UDP 的 β-甲基酯及其 2-硫代类似物的值分别为 2730 和 56 nM。β-叔的丁基酯4是11倍UDPG更有效，但β-芳氧基或更大，β支链烷基酯，例如环己基，不太有效。UDP 与刚性北或南甲氧基碳（双环 [3.1.0] 己烷） 组的核糖替代消除了 P2Y 14受体激动剂活性。α,β-亚甲基和二氟亚甲基对 P2Y 14
• Structure−Activity Relationship of Uridine 5‘<b>-</b>Diphosphoglucose Analogues as Agonists of the Human P2Y₁₄ Receptor
  作者：Hyojin Ko、Ingrid Fricks、Andrei A. Ivanov、T. Kendall Harden、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/jm061222w

  日期：2007.5.1

  moieties abolished activity; this is among the least permissive P2Y receptors. However, a 2-thiouracil modification in 15 (EC50 49 +/- 2 nM) enhanced the potency of UDPG (but not UDP-glucuronic acid) by 7-fold. 4-Thio analogue 13 was equipotent to UDPG, but S-alkylation was detrimental. Compound 15 was docked in a rhodposin-based receptor homology model, which correctly predicted potent agonism of UDP-fructose

  UDP葡萄糖（UDPG）及其衍生物是Gi蛋白偶联的P2Y14受体的天然激动剂，它存在于免疫系统中。我们合成并表征了在碱基，核糖和葡萄糖部分修饰的UDPG的药理学新类似物，作为结合建模设计新配体的基础。通过工程化的Galpha-q / i蛋白将在COS-7细胞中表达的重组人P2Y14受体与磷脂酶C偶联。尿嘧啶或核糖部分的大多数修饰废除了活性。这是最不被允许的P2Y受体之一。然而，在15（EC50 49 +/- 2 nM）中的2-硫尿嘧啶修饰将UDPG（而不是UDP-葡萄糖醛酸）的效力提高了7倍。4-硫代类似物13与UDPG等价，但是S-烷基化是有害的。化合物15停靠在基于罗丹蛋白的受体同源性模型中，该模型正确预测了UDP-果糖，UDP-甘露糖和UDP-肌醇的有效激动作用。UDPG的己糖部分与多个H键和带电荷的残基相互作用，并为激动剂修饰提供了肥沃的区域。
• Reactions of Pd(dien)Cl+ with thione-containing nucleosides, nucleotides and oligonucleotides: increase of both enthalpy and entropy of activation in the DNA-environment
  作者：Anna Ericson、Yelena Iljina、Jason L. McCary、Robert S. Coleman、Sofi K.C. Elmroth

  DOI：10.1016/s0020-1693(99)00257-1

  日期：2000.1

  Reactions of chloro(diethylenetriamine)palladium(II) with 4-thio-2%-deoxyuridine, 4-thiouridine-5%-monophosphate, d(T8 s4 UT8), 6-thio-2%-deoxyinosine, 6-mercapto-purine riboside-5%-monophosphate and d(T8 s6 IT8) have been investigated using diode-array and conventional stopped-flow spectroscopy in acidic aqueous solution as a function of excess concentration of Pd(II) and temperature. The observed

  氯（二亚乙基三胺）钯（II）与4-硫代-2％-脱氧尿苷，4-硫代尿苷-5％-单磷酸，d（T8 s4 UT8），6-硫代-2％-脱氧肌苷，6-巯基嘌呤的反应已使用二极管阵列和传统的停流光谱法研究了酸性水溶液中核糖5％单磷酸和d（T8 s6 IT8）与过量Pd（II）和温度的关系。观察到的速率常数和活化参数表明了一种反应机理，其中不稳定的氯配体被Pd（II）配合物配位域中的硫酮单元直接取代。发现将两种硫代核苷掺入单链寡核苷酸中将加合物形成的速率增加约1倍。2-3，与相应单核苷酸的反应相比。与单体反应相比，DNA环境中加合物的形成导致DH“-和DS”-值均增加。因此，观察到的DNA促进的反应性是DS术语对活化能的贡献降低的结果。©2000 Elsevier Science SA保留所有权利。
• POLYETHYLENE GLYCOL DERIVATIVE
  申请人：Sonoke Satoru

  公开号：US20100074880A1

  公开（公告）日：2010-03-25

  The present invention includes a novel polyethylene glycol derivative; a drug carrier comprising the derivative; and a pharmaceutical composition comprising the drug carrier having a pharmacologically active substance included therein. Specifically disclosed are: a polyethylene glycol derivative represented by the general formula (I); a drug carrier comprising the derivative and 2-O-(2-diethylaminoethyl)carbamoyl-1,3-O-dioleoyl-glycerol; and a pharmaceutical composition comprising the drug carrier and a pharmacologically active substance (preferably double-stranded RNA, double-stranded DNA or an oligonucleic acid), wherein R represents a saturated or unsaturated aliphatic hydrocarbon group having 10 to 30 carbon atoms or a saturated or unsaturated fatty acid residue having 10 to 30 carbon atoms; and n represents an integer of 30 to 150.

  本发明包括一种新型聚乙二醇衍生物；一种包含该衍生物的药物载体；以及一种包含有药理活性物质的药物组合物，其包括该药物载体。具体揭示了：由通式（I）表示的聚乙二醇衍生物；包括该衍生物和2-O-(2-二乙氨基乙基)氨基甲酰基-1,3-O-二油酰甘油的药物载体；以及包含有药理活性物质（优选为双链RNA、双链DNA或寡核苷酸）的药物组合物，其中R表示具有10到30个碳原子的饱和或不饱和脂肪族碳氢基团或脂肪酸残基；n表示30到150的整数。
• DRUG CARRIER
  申请人：Sonoke Satoru

  公开号：US20110098344A1

  公开（公告）日：2011-04-28

  A drug carrier characterized by mainly containing a polyethylene-glycol-modified phospholipid and a cationic lipid and containing the polyethylene-glycol-modified phospholipid in a concentration within a specific range. The drug carrier, which is of the in-blood residence type, is characterized by comprising a polyethylene-glycol-modified phospholipid represented by the following general formula (I) or a pharmaceutically acceptable salt thereof: [wherein X represents the following (II) or (III) and n is an integer of 30-150] [wherein R 1 represents a saturated linear C 17-22 fatty acid residue] and 2-O-(2-diethylaminoethyl)carbamoyl-1,3-O-dioleoylglylcerol. It is further characterized in that the polyethylene-glycol-modified phospholipid represented by the general formula (I) is contained in an amount of 30-50 wt. % based on the total amount of the lipids in the drug carrier.

  一种药物载体，其主要包含聚乙二醇修饰的磷脂和阳离子脂质，并且聚乙二醇修饰的磷脂的浓度在特定范围内。该药物载体属于血内驻留型，其特征在于包含以下通式（I）表示的聚乙二醇修饰的磷脂或其药学上可接受的盐：[其中X表示以下（II）或（III），n是30-150的整数][其中R1表示饱和线性C17-22脂肪酸残基]和2-O-(2-二乙氨乙基)氨基甲酰基-1,3-O-二油酰基甘油。它进一步特征在于，根据药物载体中脂质的总量，聚乙二醇修饰的磷脂的含量为30-50重量％。