4-[7-(3-carboxy-propoxy)naphthalen-2-yloxy]butyryl-Val-Leu-Val-OMe | 813432-38-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 4-[7-(3-carboxy-propoxy)naphthalen-2-yloxy]butyryl-Val-Leu-Val-OMe
• 英文别名: [7-(3-carboxypropoxy)naphthalene-2-yloxy]butyryl-Val-Leu-Val-OMe；4-[7-[4-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-1-methoxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-4-oxobutoxy]naphthalen-2-yl]oxybutanoic acid
• CAS: 813432-38-1
• 化学式: C₃₅H₅₁N₃O₉
• 分子量: 657.805
• InChiKey: GNKGLBZMYBFIME-MHDHXZMLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.6
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  169
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-[7-(3-carboxy-propoxy)naphthalen-2-yloxy]butyryl-Val-Leu-Val-OMe 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 44.0h， 生成 (S)-2-((S)-2-{(S)-2-[4-(7-{4-[N'-(5-Amino-2-methoxy-benzoyl)-hydrazino]-4-oxo-butoxy}-naphthalen-2-yloxy)-butyrylamino]-3-methyl-butyrylamino}-4-methyl-pentanoylamino)-3-methyl-butyric acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  含有氨基酸模拟片段的分子钳：野生型和突变的HIV-1蛋白酶二聚化的新抑制剂。

  摘要：

  我们已经设计，合成和评估了基于萘基支架的新型拟肽分子钳的抑制活性和代谢稳定性，以抑制HIV-1蛋白酶的二聚作用。将拟肽基序插入一条肽链中，使其对蛋白水解具有抗性。可以降低分子钳的肽特性，而无需改变它们抑制二聚化的方式。突变的HIV-1蛋白酶也容易受到二聚化抑制剂的影响，与野生型蛋白酶相比，多突变的蛋白酶ANAM-11对抑制剂的敏感性是其两倍。因此，可以在不损害抗二聚体分子钳体外抑制野生型和突变的HIV-1蛋白酶的能力的情况下提高抗二聚体分子钳的代谢稳定性。

  DOI：

  10.1021/jm060576k
• 作为产物：
  描述：

  2,7-二羟基萘 在 palladium on activated charcoal 氢氧化钾 、 氢气 、 potassium carbonate 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 127.0h， 生成 4-[7-(3-carboxy-propoxy)naphthalen-2-yloxy]butyryl-Val-Leu-Val-OMe
  参考文献：
  名称：

  新的受约束的“分子钳”旨在解离HIV-1蛋白酶二聚体。

  摘要：

  合成了基于与两条肽链连接的萘和喹啉骨架的新“分子钳”。设计它们的目的是通过靶向涉及每个单体的N和C末端的反平行β-折叠来防止HIV-1蛋白酶的二聚化。与先前描述的“分子钳”相比（Bouras，A .; Boggetto，N .; Benatalah，Z .; de Rosny，E .; Sicsic，S .; Reboux-Ravaud，MJ Med。Chem。1999，42，957- 962），引入了两种主要的不同结构特征：带正电荷的喹啉作为一种新的支架，以及两条显示不同序列的肽链。合成了十七个带有二肽或三肽链的“分子钳”。使用Zhang动力学技术在HIV-1蛋白酶上分析了这些分子。11个分子充当纯二聚抑制剂，大多在亚微摩尔范围内。与萘支架相比，喹啉一在几种情况下显示出有利于二聚化抑制。简化的疏水性Val-Leu-Val-OMe链被证实是特别有利的。C端类似物链Thr-Leu-Asn-O

  DOI：

  10.1021/jm040833q

文献信息

• Carbonylhydrazide-Based Molecular Tongs Inhibit Wild-Type and Mutated HIV-1 Protease Dimerization
  作者：Laure Dufau、Ana Sofia Marques Ressurreição、Roberto Fanelli、Nadjib Kihal、Anamaria Vidu、Thierry Milcent、Jean-Louis Soulier、Jordi Rodrigo、Audrey Desvergne、Karine Leblanc、Guillaume Bernadat、Benoit Crousse、Michèle Reboud-Ravaux、Sandrine Ongeri

  DOI：10.1021/jm300181j

  日期：2012.8.9

  Kinetic analyses and fluorescent probe binding studies showed that several molecular tongs can inhibit PR dimerization. The best nonpeptidic molecular tongs to date were obtained with an inhibition constant Kid of 50 nM for PR and 80 nM for the multimutated protease ANAM-11. The PR inhibition was selective, the aspartic proteases renin and pepsin were not inhibited.

  我们设计和合成了一种基于刚性萘基支架的新型分子钳，并评估了它们对HIV-1蛋白酶（PR）的抗二聚体活性。我们将羰基酰肼和寡酰肼（叠氮化物）片段插入它们的拟肽臂中，以减少疏水性并增加代谢稳定性。这些片段旨在通过复制天然PR中两个单体的N和C端之间形成的反平行β折叠中的氢键模式来破坏蛋白质之间的相互作用。动力学分析和荧光探针结合研究表明，几种分子钳可以抑制PR二聚化。迄今为止，最佳非肽类分子钳具有抑制常数K id对于PR为50nM，对于多突变蛋白酶ANAM-11为80nM。PR抑制是选择性的，天冬氨酸蛋白酶肾素和胃蛋白酶不被抑制。
• New Constrained “Molecular Tongs” Designed To Dissociate HIV-1 Protease Dimer
  作者：Naïma Merabet、Julien Dumond、Bruno Collinet、Laurence Van Baelinghem、Nicole Boggetto、Sandrine Ongeri、Fariza Ressad、Michèle Reboud-Ravaux、Sames Sicsic

  DOI：10.1021/jm040833q

  日期：2004.12.1

  New "molecular tongs" based on naphthalene and quinoline scaffolds linked to two peptidic strands were synthesized. They were designed to prevent dimerization of HIV-1 protease by targeting the antiparallel beta-sheet involving N- and C-termini of each monomer. Compared to "molecular tongs" previously described (Bouras, A.; Boggetto, N.; Benatalah, Z.; de Rosny, E.; Sicsic, S.; Reboux-Ravaud, M. J

  合成了基于与两条肽链连接的萘和喹啉骨架的新“分子钳”。设计它们的目的是通过靶向涉及每个单体的N和C末端的反平行β-折叠来防止HIV-1蛋白酶的二聚化。与先前描述的“分子钳”相比（Bouras，A .; Boggetto，N .; Benatalah，Z .; de Rosny，E .; Sicsic，S .; Reboux-Ravaud，MJ Med。Chem。1999，42，957- 962），引入了两种主要的不同结构特征：带正电荷的喹啉作为一种新的支架，以及两条显示不同序列的肽链。合成了十七个带有二肽或三肽链的“分子钳”。使用Zhang动力学技术在HIV-1蛋白酶上分析了这些分子。11个分子充当纯二聚抑制剂，大多在亚微摩尔范围内。与萘支架相比，喹啉一在几种情况下显示出有利于二聚化抑制。简化的疏水性Val-Leu-Val-OMe链被证实是特别有利的。C端类似物链Thr-Leu-Asn-O
• Molecular Tongs Containing Amino Acid Mimetic Fragments:  New Inhibitors of Wild-Type and Mutated HIV-1 Protease Dimerization
  作者：Ludovic Bannwarth、Albane Kessler、Stéphanie Pèthe、Bruno Collinet、Naïma Merabet、Nicole Boggetto、Sames Sicsic、Michèle Reboud-Ravaux、Sandrine Ongeri

  DOI：10.1021/jm060576k

  日期：2006.7.1

  peptidomimetic molecular tongs based on a naphthalene scaffold for inhibiting HIV-1 protease dimerization. Peptidomimetic motifs were inserted into one peptidic strand to make it resistant to proteolysis. The peptidic character of the molecular tongs can be decreased without changing the way they inhibit dimerization. Mutated HIV-1 proteases are also vulnerable to dimerization inhibitors, and the multimutated

  我们已经设计，合成和评估了基于萘基支架的新型拟肽分子钳的抑制活性和代谢稳定性，以抑制HIV-1蛋白酶的二聚作用。将拟肽基序插入一条肽链中，使其对蛋白水解具有抗性。可以降低分子钳的肽特性，而无需改变它们抑制二聚化的方式。突变的HIV-1蛋白酶也容易受到二聚化抑制剂的影响，与野生型蛋白酶相比，多突变的蛋白酶ANAM-11对抑制剂的敏感性是其两倍。因此，可以在不损害抗二聚体分子钳体外抑制野生型和突变的HIV-1蛋白酶的能力的情况下提高抗二聚体分子钳的代谢稳定性。