c[Aoda-Nal-β3Leu-Ala]; Aoda = (S)-2-amino-8-oxo-decanoic acid | 1187754-63-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: c[Aoda-Nal-β3Leu-Ala]; Aoda = (S)-2-amino-8-oxo-decanoic acid
• 英文别名: c[Aoda-Nal-β3Leu-Ala]；cyclo[1Nal-bAla(3S-iBu)-Ala-Aoda]；(3S,6S,9S,13S)-9-methyl-13-(2-methylpropyl)-3-(naphthalen-1-ylmethyl)-6-(6-oxooctyl)-1,4,7,10-tetrazacyclotridecane-2,5,8,11-tetrone
• CAS: 1187754-63-7
• 化学式: C₃₃H₄₆N₄O₅
• 分子量: 578.752
• InChiKey: HFDUFQFVUVYKCX-MQIQBBKZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  134
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-octanedioic acid 1-allyl ester 8-tert-butyl ester 、 Fmoc-L-亮氨酸 、 Fmoc-L-丙氨酸 、 乙基溴化镁 、 Fmoc-3-(1-萘基)-L-丙氨酸 在 三氟乙酸 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 c[Aoda-Nal-β3Leu-Ala]; Aoda = (S)-2-amino-8-oxo-decanoic acid
  参考文献：
  名称：

  通过环状α3β-四肽的聚焦组合文库发现强效和选择性组蛋白脱乙酰酶抑制剂

  摘要：

  组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 抑制剂是了解表观遗传调控的有力工具，已被证明在治疗各种癌症方面特别有前途，但发现有效的、异构体选择性 HDAC 抑制剂一直是一项重大挑战。我们最近开发了一种环状 α 3 β-四肽支架，用于制备具有新型选择性特征的 HDAC 抑制剂（J. Am. Chem. Soc. 2009 , 131 , 3033）。在这项研究中，我们通过合成阐述这个支架相对于侧链多样性一个-珠-一个-化合物环四肽类似物的组合文库，并使用方便的筛选平台将这些集中文库的两代应用于发现有效的 HDAC 配体。我们的研究导致了第一个 HDAC6 选择性环状四肽类似物，它将环状四肽的使用扩展到 II 类 HDAC 同种型。这些发现突出了环状四肽作为表观遗传调节剂和可能的抗癌药物先导化合物的持久潜力。

  DOI：

  10.1021/jm900850t

文献信息

• Discovery of Potent and Selective Histone Deacetylase Inhibitors via Focused Combinatorial Libraries of Cyclic α₃β-Tetrapeptides
  作者：Christian A. Olsen、M. Reza Ghadiri

  DOI：10.1021/jm900850t

  日期：2009.12.10

  libraries to the discovery of potent HDAC ligands using a convenient screening platform. Our studies led to the first HDAC6-selective cyclic tetrapeptide analogue, which extends the use of cyclic tetrapeptides to the class II HDAC isoforms. These findings highlight the persistent potential of cyclic tetrapeptides as epigenetic modulators and possible anticancer drug lead compounds.

  组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 抑制剂是了解表观遗传调控的有力工具，已被证明在治疗各种癌症方面特别有前途，但发现有效的、异构体选择性 HDAC 抑制剂一直是一项重大挑战。我们最近开发了一种环状 α 3 β-四肽支架，用于制备具有新型选择性特征的 HDAC 抑制剂（J. Am. Chem. Soc. 2009 , 131 , 3033）。在这项研究中，我们通过合成阐述这个支架相对于侧链多样性一个-珠-一个-化合物环四肽类似物的组合文库，并使用方便的筛选平台将这些集中文库的两代应用于发现有效的 HDAC 配体。我们的研究导致了第一个 HDAC6 选择性环状四肽类似物，它将环状四肽的使用扩展到 II 类 HDAC 同种型。这些发现突出了环状四肽作为表观遗传调节剂和可能的抗癌药物先导化合物的持久潜力。