N2-({6-[2-({[6-{2-[({6-[2-({[6-{2-[ ({8-[2-({[8-(2-{[(8-{2-[({8-[2-(cetylamino)ethyl]-2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl}acetyl)amino]ethyl}-2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)acetyl]amino}ethyl)-2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl]acetyl}amino)ethyl]-2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl}acetyl)amino]ethyl}-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl]acetyl}-amino)ethyl]-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl}acetyl)amino]ethyl}-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl]acetyl}amino)ethyl]-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl}acetyl)-L-lysyl-L-lysinamide | 1328886-00-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N2-({6-[2-({[6-{2-[({6-[2-({[6-{2-[ ({8-[2-({[8-(2-{[(8-{2-[({8-[2-(cetylamino)ethyl]-2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl}acetyl)amino]ethyl}-2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)acetyl]amino}ethyl)-2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl]acetyl}amino)ethyl]-2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl}acetyl)amino]ethyl}-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl]acetyl}-amino)ethyl]-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl}acetyl)amino]ethyl}-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl]acetyl}amino)ethyl]-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl}acetyl)-L-lysyl-L-lysinamide
• CAS: 1328886-00-5
• 化学式: C₁₁₄H₁₃₃N₄₅O₂₇
• 分子量: 2565.6
• InChiKey: ASJCBZOWAVEIPG-TVMORXBRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.13
• 重原子数：
  186.0
• 可旋转键数：
  64.0
• 环数：
  16.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.34
• 拓扑面积：
  1037.37
• 氢给体数：
  25.0
• 氢受体数：
  53.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N4-[(benzyloxy)carbonyl]-6-[2-({[(9H-fluoren-9-yl)methoxy]carbonyl}amino)ethyl]cytosine-1-acetic acid 、 、 乙酸酐 、 N-alpha-芴甲氧羰基-N-epsilon-叔丁氧羰基-L-赖氨酸 在 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 二甲基亚砜 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 N2-({6-[2-({[6-{2-[({6-[2-({[6-{2-[ ({8-[2-({[8-(2-{[(8-{2-[({8-[2-(cetylamino)ethyl]-2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl}acetyl)amino]ethyl}-2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)acetyl]amino}ethyl)-2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl]acetyl}amino)ethyl]-2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl}acetyl)amino]ethyl}-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl]acetyl}-amino)ethyl]-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl}acetyl)amino]ethyl}-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl]acetyl}amino)ethyl]-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl}acetyl)-L-lysyl-L-lysinamide
  参考文献：
  名称：

  具有整合的碱基和骨干的寡核苷酸类似物。第28章

  摘要：

  受保护的酰肼联尿嘧啶和腺嘌呤衍生tetranucleoside类似物17,19和21在溶液中，通过偶合二聚体肼合成6和10与羧酸7,11，和16。这些肼和酸被部分地脱保护的肼得到的5,9，和15，将它们通过偶合肼制备3和14与羧酸4和8。完全保护的UU二聚体5的晶体结构分析显示的反平行双链环状与尿嘧啶单元氢键形成经由ħ  N（3）和OC（2）。观察到尿嘧啶单元之间的屈曲度为30.9°，并且尿嘧啶单元II和Fmoc的芴9-基（= 9 H-芴-9-基）甲氧基羰基之间存在堆积相互作用。酰肼ħ  N（3'）和Fmoc的CO基形成分子内氢键。的尿嘧啶和腺嘌呤衍生的，水溶性的酰肼联自身互补八聚体23 - 32和非自互补尿嘧啶衍生十聚体33获得通过偶联羧酸4和8在固体载体上。1个H-NMR分析在CDCl 3，CDCL的混合物3和（d 6）DMSO，和（d 8）THF表明，部分脱保护二聚体5，6，

  DOI：

  10.1002/hlca.201100124