5-iodo-3',5'-di-O-p-toluyl-2'-deoxyuridine | 31356-86-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-iodo-3',5'-di-O-p-toluyl-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 3',5'-di-O-p-toluoyl-5-iodo-2'-deoxyuridine；[(2R,3S,5R)-5-(5-iodo-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3-(4-methylbenzoyl)oxyoxolan-2-yl]methyl 4-methylbenzoate
• CAS: 31356-86-2
• 化学式: C₂₅H₂₃IN₂O₇
• 分子量: 590.371
• InChiKey: OENJVMKAWHZWNP-PWRODBHTSA-N

物化性质

• 熔点：
  204.5-206 °C
• 密度：
  1.65±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于氯仿、DCM、乙酸乙酯

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-iodo-3',5'-di-O-p-toluyl-2'-deoxyuridine 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 三乙胺 为溶剂， 反应 8.5h， 生成 1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-tetrahydrofuran-2-yl)-5-(4-hydroxybut-1-ynyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  核酸相关化合物。31.末端炔烃与5-碘尿嘧啶核苷的平滑高效钯钯催化偶联

  摘要：

  在三乙胺中存在二氯双（三苯基膦）钯和碘化铜（I）的情况下，末端炔烃与受保护的5-碘尿嘧啶核苷的偶联以72-92％的收率得到相应的5-（炔-1-基）尿嘧啶核苷。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(81)80115-3
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧-3',5'-二-O-(4-甲基苯甲酰)尿苷 在 一氯化碘 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以91%的产率得到5-iodo-3',5'-di-O-p-toluyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Carbohydrate-Conjugated dT Analogues Using ‘Click Chemistry’

  摘要：

  一种新型呋喃[2,3-d]嘧啶核苷与多种碳水化合物的偶联物，通过Sonogashira偶联和‘点击化学’合成。随后，在甲醇中用催化量的甲醇钠脱除4-甲苯酰基和乙酰基的保护，呋喃[2,3-d]嘧啶发生了重排，变成开环的酮型结构。其结构通过光谱学得以确认。

  DOI：

  10.1055/s-2007-983881

文献信息

• Nucleic acid related compounds. 38. Smooth and high-yield iodination and chlorination at C-5 of uracil bases and <i>p</i>-toluyl-protected nucleosides
  作者：Morris J. Robins、Philip J. Barr、Jerzy Giziewicz

  DOI：10.1139/v82-082

  日期：1982.3.1

  Treatment of uracil bases and protected nucleosides with iodine monochloride (ICl) gave the corresponding 5-iodouracil products in over 95% purified yields. Analogously facile chlorination was effected with iodobenzene dichloride (PhICl2). Protection of the nucleosides as p-toluyl esters provided reactants that were soluble in organic solvents and crystallized readily in high yields.

  用一氯化碘 (ICl) 处理尿嘧啶碱基和受保护的核苷，得到相应的 5-碘尿嘧啶产物，纯化产率超过 95%。用二氯化碘苯 (PhICl2) 进行类似的简便氯化。将核苷保护为对甲苯基酯提供了可溶于有机溶剂并容易以高产率结晶的反应物。
• Fluorescent Sugar and Uridine Conjugates of 1,8-Naphthalimides with Methyl and Ferrocenyl Headgroups
  作者：Giorgio Cavigiolio、Joy L. Morgan、Brian H. Robinson、Jim Simpson

  DOI：10.1071/ch04020

  日期：——

  The first amphiphilic sugar and deoxyuridine conjugates with a 4-ethynyl-1,8-N-methylnaphthalimide linker, a 4-ethynyldeoxyuridine conjugate with a N-undecylferrocenyl headgroup, and a 1,8-naphthalimide with a 2,3,4,6-tetra-O-acetate-β-d-glucopyranoside headgroup have been synthesized. A novel acrylate monomeric precursor for sugar–ethynylnaphthalimide polymers is also reported. The ethynyl tether forms complexes with Co2(CO)8 and Co2(CO)6dppm. The single-crystal X-ray structures of 2′-propynyl-2,3,4,6-tetra-O-acetate-β-d-glucopyranoside 4 and 4-(2′-propynyl-2,3,4,6-tetra-O-acetate-β-d-glucopyranoside)-N-methyl-1,8-naphthalimide 6 are also reported. With the exception of the Co2 complexes, the sugar and deoxyuridine conjugates are strongly fluorescent. ‘On–off’ fluorescent switching is achieved in the deoxyuridine conjugate with an undecylferrocenyl headgroup.

  首次合成了具有 4-乙炔基-1,8-N-甲基萘二甲酰亚胺连接体的两亲糖和脱氧尿苷共轭物、具有 N-十一烷基二茂铁基头基的 4-乙炔基脱氧尿苷共轭物以及具有 2,3,4,6-etra-O-acetate-β-d-glucopyranoside 头基的 1,8-萘二甲酰亚胺。此外，还报道了一种新型丙烯酸酯单体前体，可用于制备糖-乙炔基萘二甲酰亚胺聚合物。乙炔基醚与 Co2(CO)8 和 Co2(CO)6dppm 形成络合物。此外，还报道了 2′-丙炔基-2,3,4,6-四-O-乙酸酯-β-d-吡喃葡萄糖苷 4 和 4-(2′-丙炔基-2,3,4,6-四-O-乙酸酯-β-d-吡喃葡萄糖苷)-N-甲基-1,8-萘二甲酰亚胺 6 的单晶 X 射线结构。除 Co2 复合物外，糖和脱氧尿苷共轭物都具有强烈的荧光。带有十一烷基二茂铁基团的脱氧尿苷共轭物可实现 "开关 "荧光切换。
• Furan decorated nucleoside analogues as fluorescent probes: synthesis, photophysical evaluation, and site-specific incorporation
  作者：Nicholas J. Greco、Yitzhak Tor

  DOI：10.1016/j.tet.2007.01.073

  日期：2007.4

  properties of all furan containing nucleosides, identifies the furan thymidine analogue, 5-(fur-2-yl)-2'-deoxyuridine, as the best candidate for use as a responsive fluorescent probe in nucleic acids. 5-(fur-2-yl)-2'-deoxyuridine was then converted to the corresponding phosphoramidite and site specifically incorporated into DNA oligonucleotides with greater than 88% coupling efficiency. Such furan-modified

  报道了修饰的核苷类似物的合成和光物理评价，其中五元杂环（呋喃、噻吩、恶唑和噻唑）连接到 2'-脱氧尿苷的 5 位。由于其发射量子效率和对其微环境的敏感性程度，含呋喃衍生物被确定为该家族中最有希望的响应核苷。然后将呋喃部分连接到 2'-脱氧胞苷的 5 位以及腺苷和鸟苷的 8 位。对这四种含呋喃核苷类似物的光物理评估揭示了吸收、发射和量子效率的明显差异，具体取决于核苷（嘧啶或嘌呤）的类别。比较所有含呋喃核苷的光物理性质，确定呋喃胸苷类似物 5-(fur-2-yl)-2'-deoxyuridine 作为核酸中响应荧光探针的最佳候选者。然后将 5-(fur-2-yl)-2'-deoxyuridine 转化为相应的亚磷酰胺，并以大于 88% 的偶联效率将位点特异性地掺入 DNA 寡核苷酸中。这种呋喃修饰的寡核苷酸在与其互补的 DNA 链杂交后形成稳定的双链体，并显示出有利的荧光特征。
• 2'-deoxy-5-ethynyluridine-3',5'-diestens for treatment of VZV and CMV
  申请人：Burroughs Wellcome Co.

  公开号：US04863906A1

  公开（公告）日：1989-09-05

  The present invention relates to the use of 2'-deoxy-5-ethynyluridine and its pharmaceutically acceptable derivatives in the treatment and prophylaxis of varicella zoster virus and cytomegalovirus infections. Also provided are pharmaceutical formulations and processes for the preparation of the compounds according to the invention.

  本发明涉及在水痘带状疱疹病毒和巨细胞病毒感染的治疗和预防中使用2'-脱氧-5-乙炔尿苷及其药用可接受衍生物。还提供了根据本发明制备化合物的药物配方和过程。
• Simple Fluorescent Pyrimidine Analogues Detect the Presence of DNA Abasic Sites
  作者：Nicholas J. Greco、Yitzhak Tor

  DOI：10.1021/ja052000a

  日期：2005.8.1

  A family of simple pyrimidine analogues has been synthesized, and their photophysical properties have been investigated. The most responsive of the family was incorporated in DNA. This isosteric fluorescent DNA analogue monitors denaturation of a DNA duplex via fluorescence and positively detects the presence of abasic sites in DNA duplexes.

  合成了一系列简单的嘧啶类似物，并研究了它们的光物理性质。这个家族中反应最灵敏的被整合到 DNA 中。这种等排荧光 DNA 类似物通过荧光监测 DNA 双链体的变性，并积极检测 DNA 双链体中无碱基位点的存在。