1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-tetrahydrofuran-2-yl)-5-(3-hydroxyprop-1-ynyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 77875-99-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-tetrahydrofuran-2-yl)-5-(3-hydroxyprop-1-ynyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: 5-(3-hydroxypropynyl)-dUrd；2'-deoxy-5-(3-hydroxyprop-1-yn-1-yl)uridine；5-(3-hydroxy-1-propynyl)-2'-deoxyuridine；1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-(3-hydroxyprop-1-ynyl)pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 77875-99-1
• 化学式: C₁₂H₁₄N₂O₆
• 分子量: 282.253
• InChiKey: OZFVVNYCZRZMDG-IVZWLZJFSA-N

物化性质

• 密度：
  1.61±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-tetrahydrofuran-2-yl)-5-(3-hydroxyprop-1-ynyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 吡啶 、 sodium hydrogen selenide 、 1,3二氯-1,1,3,3-四异丙基二硅氧烷 、 四丁基氟化铵 、 tris(tetra-n-butylammonium) hydrogen pyrophosphate 、 三氯氧磷 作用下， 生成
  参考文献：
  名称：

  [EN] HEAVY ATOM LABELED NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES, AND NUCLEIC ACID POLYMERS, AND USES THEREOF
  [FR] NUCLÉOSIDES, NUCLÉOTIDES ET POLYMÈRES D'ACIDES NUCLÉIQUES MARQUÉS AVEC DES ATOMES LOURDS ET LEURS UTILISATIONS

  摘要：

  本公开提供了一种通过电子显微镜（例如高分辨扫描透射电子显微镜（STEM））对核酸聚合物进行测序以改善测序读长的组合物和方法。本公开进一步提供了式（I）的重原子标记化合物：包括一个或多个式（II'）的重原子标记单元的核酸聚合物，例如式（II）的重原子标记核酸聚合物，以及其盐，其中G1、G2、G3、M1、M2、碱基（Base）和n的每个定义如本文所述，可选择用于所述方法中。

  公开号：

  WO2014078652A1
• 作为产物：
  描述：

  5-iodo-3',5'-di-O-p-toluyl-2'-deoxyuridine 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 三乙胺 为溶剂， 反应 5.5h， 生成 1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-tetrahydrofuran-2-yl)-5-(3-hydroxyprop-1-ynyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  核酸相关化合物。31.末端炔烃与5-碘尿嘧啶核苷的平滑高效钯钯催化偶联

  摘要：

  在三乙胺中存在二氯双（三苯基膦）钯和碘化铜（I）的情况下，末端炔烃与受保护的5-碘尿嘧啶核苷的偶联以72-92％的收率得到相应的5-（炔-1-基）尿嘧啶核苷。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(81)80115-3

文献信息

• Enzyme catalyzed therapeutic activation
  申请人：NewBiotics, Inc.

  公开号：US06683061B1

  公开（公告）日：2004-01-27

  This invention provides novel substrate compounds that selectively inhibit the proliferation of pathological cells, for example, pathological calls that endogenously overexpress a target enzyme that confers resistance to biologic and chemotherapeutic agents. The enzyme acts on a substrate compound to 1) convert it to a cellular toxin and/or 2) release a toxic byproduct. In one embodiment, the activity of the target enzyme has been greatly enhanced in a target cell as a result of loss of tumor suppressor function and/or selection resulting from previous exposure to chemotherapy. In another embodiment, the pathological cell contains a target enzyme that is an expression product of an infectious agent in the cell. Further provided by this invention is a method for treating a subject by delivering to the subject a prodrug as described herein. The prodrugs of this invention may be used alone or in combination with other chemotherapeutics or alternative anti-cancer therapies such as radiation.

  这项发明提供了新型底物化合物，可以选择性地抑制病理细胞的增殖，例如，内源性过度表达一种使生物和化疗药物产生耐药性的靶酶的病理细胞。该酶作用于底物化合物，可以将其转化为细胞毒素和/或释放出有毒副产物。在一种实施例中，由于肿瘤抑制基因功能丧失和/或之前暴露于化疗药物而导致的选择，目标细胞中的靶酶活性已被大大增强。在另一种实施例中，病理细胞含有一种是细胞内感染因子的表达产物的靶酶。此发明还提供了一种通过向受试者输送本文所述的前药来治疗受试者的方法。本发明的前药可以单独使用，也可以与其他化疗药物或放疗等替代抗癌疗法结合使用。
• Organometallic Nucleosides: Synthesis and Biological Evaluation of Substituted Dicobalt Hexacarbonyl 2′‐Deoxy‐5‐oxopropynyluridines
  作者：Renata Kaczmarek、Dariusz Korczyński、Karolina Królewska‐Golińska、Kraig A. Wheeler、Ferman A. Chavez、Agnieszka Mikus、Roman Dembinski

  DOI：10.1002/open.201700168

  日期：2018.3

  Reactions of dicobalt octacarbonyl [Co2(CO)8] with 2′‐deoxy‐5‐oxopropynyluridines and related compounds gave dicobalt hexacarbonyl nucleoside complexes (83–31 %). The synthetic outcomes were confirmed by X‐ray structure determination of dicobalt hexacarbonyl 2′‐deoxy‐5‐(4‐hydroxybut‐1‐yn‐1‐yl)uridine, which exhibits intermolecular hydrogen bonding between a modified base and ribose. The electronic structure

  八羰基二钴 [Co 2 (CO) 8 ] 与 2'-脱氧-5-氧代丙炔尿苷及相关化合物反应，得到六羰基二钴核苷复合物 (83-31%)。合成结果通过六羰基二钴 2'-脱氧-5-(4-羟基丁-1-yn-1-基)尿苷的 X 射线结构测定得到证实，其在修饰的碱基和核糖之间表现出分子间氢键。通过 DFT 计算表征了该化合物的电子结构。检查了有机金属核苷对 HeLa 和 K562 癌细胞系的生长抑制作用，并与炔基核苷前体的抑制作用进行了比较。二钴羰基部分与 2'-脱氧-5-炔基尿苷的配位导致细胞毒性效力显着增加。钴化合物表现出抗增殖活性，对 HeLa 细胞系的中值抑制值 (IC 50 ) 在 20 至 80 μm范围内，对 K562 细胞系在 18 至 30 μm范围内。通过使用 1,1-双（二苯基膦）甲烷 (dppm) 配体扩大了乙酰基取代的钴核苷的配位，该配体表现出相当水平的细胞毒性。在 K562
• Enzyme catalyzed therapeutic compounds
  申请人：——

  公开号：US20040077588A1

  公开（公告）日：2004-04-22

  This invention provides novel substrate compounds that selectively inhibit the proliferation f path logical cells, for example, pathological cells that endogenously overexpress a target enzyme that confers resistance to biologic and chemotherapeutic agents. The enzyme acts on a substrate compound to 1) convert it to a cellular toxin and/or 2) release a toxic byproduct. In one embodiment, the activity of the target enzyme has been greatly enhanced in a target cell as a result of loss f tum r suppressor function and/or selection resulting from previous exposure to chemotherapy. In another embodiment, the pathological cell contains a target enzyme that is an expression product of an infectious agent in the cell. Further provided by this invention is a method for treating a subject by delivering to the subject a prodrug as described herein. The prodrugs f this invention may be used alone or in combination with ther chemotherapeutics or alternative anti-cancer therapies such as radiation.

  本发明提供了新型底物化合物，其选择性地抑制病理细胞的增殖，例如，内源性过度表达靶酶的病理细胞，该靶酶赋予生物和化学治疗药物抵抗力。该酶作用于底物化合物，以1）将其转化为细胞毒素和/或2）释放有毒副产物。在一种实施例中，由于肿瘤抑制因子功能的丧失和/或先前接受化疗的选择，靶细胞中的靶酶活性已被大大增强。在另一种实施例中，病理细胞包含一个靶酶，该靶酶是细胞内感染因子的表达产物。本发明还提供了一种通过向受试者输送如本文所述的前药来治疗受试者的方法。本发明的前药可以单独使用或与其他化疗药物或替代抗癌疗法（例如放疗）联合使用。
• Novel phosphoramidate compounds and methods of use
  申请人：——

  公开号：US20030109697A1

  公开（公告）日：2003-06-12

  This invention provides compounds, compositions and methods for treating cancer, infectious disease, an autoimmune disorder or an inflammatory condition. Therapeutic compounds useful in the methods of this invention are 5′-phosphoramidatyl, 1,5-substituted pyrimidine compounds, derivatives, analogs and pharmaceutically acceptable salts thereof

  该发明提供了用于治疗癌症、传染病、自身免疫性疾病或炎症状况的化合物、组合物和方法。该发明方法中有用的治疗化合物是5'-磷酰胺基、1,5-取代嘧啶化合物、衍生物、类似物和药学上可接受的盐。
• Synergistic ECTA compositions
  申请人：——

  公开号：US20020147175A1

  公开（公告）日：2002-10-10

  This invention provides compositions containing an effective amount of a novel substrate compound that selectively inhibit the proliferation of hyperproliferative cells, for example, pathological cells that endogenously overexpress a target enzyme that confers resistance to biologic and chemotherapeutic agents and an effective amount of a nucleoside transport antagonistic agents. Further provided by this invention is a method for treating a subject by delivering to the subject the composition as described herein. The compositions of this invention may be used alone or in combination with other chemotherapeutics or alternative anti-cancer therapies such as radiation.

  本发明提供了一种含有有效量的新型底物化合物的组合物，该化合物选择性地抑制过度增殖的细胞，例如，内源性过度表达靶酶的病理细胞，并提供了有效量的核苷酸转运拮抗剂。本发明还提供了一种通过向受试者输送所述组合物来治疗受试者的方法。本发明的组合物可以单独使用或与其他化疗药物或替代抗癌疗法（如放疗）结合使用。