5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(3-trifluoroacetamido-1-propynyl)-α-2'-desoxyuridine | 932047-58-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(3-trifluoroacetamido-1-propynyl)-α-2'-desoxyuridine
• CAS: 932047-58-0
• 化学式: C₃₅H₃₂F₃N₃O₈
• 分子量: 679.65
• InChiKey: JSOWFHOLIDDJKA-JBOQNHBVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.24
• 重原子数：
  49.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  141.11
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(3-trifluoroacetamido-1-propynyl)-α-2'-desoxyuridine 在 吡啶 、 phosphonic acid 、 三甲基乙酰氯 作用下， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(3-trifluoroacetamido-1-propynyl)-α-2'-desoxyuridinyl-3'-hydrogenophosphonate
  参考文献：
  名称：

  5-Propynylamino α-deoxyuridine promotes DNA duplex stabilization of anionic and neutral but not cationic α-oligonucleotides

  摘要：

  Incorporation of 5-propynylamino and 5-propynyl alpha-2'-deoxyuridine into alpha-oligonucleotides (a-ON) allows high-affinity targeting of complementary DNA for a-ON with anionic and neutral backbone but not for cationic a-ON, revealing clues on the role of the amino group of the propynylamino on the formation of DNA duplexes. (c) 2006 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2006.11.052
• 作为产物：
  描述：

  5-iodo-3',5'-di-O-p-toluyl-2'-deoxyuridine 在 吡啶 、 甲醇 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 sodium methylate 、 三乙胺 、 六甲基二硅氮烷 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 58.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(3-trifluoroacetamido-1-propynyl)-α-2'-desoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  5-Propynylamino α-deoxyuridine promotes DNA duplex stabilization of anionic and neutral but not cationic α-oligonucleotides

  摘要：

  Incorporation of 5-propynylamino and 5-propynyl alpha-2'-deoxyuridine into alpha-oligonucleotides (a-ON) allows high-affinity targeting of complementary DNA for a-ON with anionic and neutral backbone but not for cationic a-ON, revealing clues on the role of the amino group of the propynylamino on the formation of DNA duplexes. (c) 2006 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2006.11.052