5-(1H-indol-2-yl)-3-methoxy-1H-pyrrole-2-carbaldehyde | 1033391-26-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 5-(1H-indol-2-yl)-3-methoxy-1H-pyrrole-2-carbaldehyde
• 英文别名: tert-butyl 2-(5-formyl-4-methoxy-1H-pyrrol-2-yl)-1H-indole-1-carboxylate；5-(1-Boc-2-indolyl)-3-methoxypyrrole-2-carboxaldehyde；tert-butyl 2-(5-formyl-4-methoxy-1H-pyrrol-2-yl)indole-1-carboxylate
• CAS: 1033391-26-2
• 化学式: C₁₉H₂₀N₂O₄
• 分子量: 340.379
• InChiKey: GCEFDCVHLHSYRJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  73.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(1H-indol-2-yl)-3-methoxy-1H-pyrrole-2-carbaldehyde 在 水 作用下， 反应 0.58h， 以91%的产率得到5-(1H-吲哚-2-基)-3-甲氧基-1H-吡咯-2-甲醛
  参考文献：
  名称：

  合成的Prodiginine Obatoclax（GX15-070）及其相关类似物：阴离子结合，跨膜转运和细胞毒性

  摘要：

  合成的prodiginine obatoclax有望作为一种潜在的抗癌药物。尽管作用机理尚不清楚，但该化合物可促进癌细胞的凋亡。迄今为止，仅提出了抑制BCL-2蛋白的作用机制。为了深入了解其他可能的作用方式，我们通过密度泛函理论计算研究了溶液中，固态的奥贝托克及其相关类似物的阴离子结合特性。这些化合物非常适合与阴离子如氯离子和碳酸氢根相互作用。通过使用氯离子选择性电极技术和13种磷脂在模型磷脂脂质体中测定了合成化合物的阴离子转运特性13 C NMR光谱。结果表明，这些化合物是有效的阴离子交换剂，能以非常低的浓度促进脂质双层中氯离子​​，碳酸氢根和硝酸根的转运。对小细胞肺癌细胞系GLC4的体外研究表明，活性离子载体能够释放活细胞中的pH梯度，并且这些化合物的细胞毒性与离子载体活性密切相关。

  DOI：

  10.1002/chem.201101547
• 作为产物：
  描述：

  4-甲氧基-3-吡咯啉-2-酮 在 四(三苯基膦)钯 、 sodium carbonate 、 三溴氧磷 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 4.75h， 生成 5-(1H-indol-2-yl)-3-methoxy-1H-pyrrole-2-carbaldehyde
  参考文献：
  名称：

  基于花青的小分子线粒体损伤诱导癌细胞凋亡。

  摘要：

  线粒体是细胞的强大力量，由于其参与多种细胞功能，已成为抗癌治疗中非常规的靶标之一。然而，用于癌细胞中选择性线粒体损伤的小分子的发展仍然是有限的，很少被探索。为了解决这个问题，在我们的工作中，我们通过一种简洁的策略合成了一种天然产物，启发了基于花青的3-甲氧基吡咯小分子文库。该策略涉及Vilsmeier和Pd（0）催化的Suzuki交叉偶联反应作为关键步骤。对HeLa宫颈癌细胞中文库成员的筛选揭示了两个新分子，它们位于亚细胞线粒体中并对其造成了破坏。这些小分子干扰抗凋亡蛋白（Bcl-2 / Bcl-xl）和促凋亡蛋白（Bax）产生活性氧（ROS）。分子对接研究表明，与obatoclax（泛Bcl-2抑制剂）相比，两个分子均与Bcl-2蛋白的BH3结构域更紧密地结合。这些新颖的小分子将细胞周期阻滞在G0 / G1期，裂解了caspase-3 / 9，最终提示了晚期细胞凋亡。这种小分子介导的线粒

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.9b00304

文献信息

• Chemoenzymatic synthesis of prodigiosin analogues—exploring the substrate specificity of PigC
  作者：Suresh R. Chawrai、Neil R. Williamson、George P. C. Salmond、Finian J. Leeper

  DOI：10.1039/b719353j

  日期：——

  Analogues of prodigiosin, a tripyrrolic pigment produced by Serratia species with potent immunosuppressive and anticancer activities, have been produced by feeding synthetic analogues of the normal precursor MBC to mutants of Serratia sp. ATCC 39006 or to engineered strains of Escherichia coli; in this way it has been shown that the prodigiosin synthesising enzyme, PigC, has a relaxed substrate-specificity.

  由沙雷氏菌（Serratia species）产生的一种具有强效免疫抑制和抗癌活性的三吡咯色素——灵菌红素（prodigiosin）的类似物，已通过向沙雷氏菌ATCC 39006突变体或经改造的大肠杆菌菌株中投喂正常前体MBC的合成类似物而得到生产。由此表明，灵菌红素合成酶PigC对底物具有较为宽松的特异性。
• Synthesis and biological activity of obatoclax derivatives as novel and potent SHP-1 agonists
  作者：Jung-Chen Su、Kuen-Feng Chen、Wei-Lin Chen、Chun-Yu Liu、Jui-Wen Huang、Wei-Tien Tai、Pei-Jer Chen、InKi Kim、Chung-Wai Shiau

  DOI：10.1016/j.ejmech.2012.08.024

  日期：2012.10

  the Bcl-2 family. Herein we describe the synthesis of obatoclax derivatives by replacement of the pyrrole and indole ring of obatoclax with thiophene, furan and thiazolidinedione. The in vitro cytotoxicity of the newly synthesized compounds is evaluated against hepatocellular carcinoma cells. Pyrrole and indole substituents of obatoclax analogues exhibited potent inhibition of cell growth. Among the tested

  Obatoclax是一种线性的寡吡咯化合物，可拮抗Bcl-2家族的抗凋亡作用。在本文中，我们描述了通过用噻吩，呋喃和噻唑烷二酮代替obatoclax的吡咯和吲哚环来合成obatoclax衍生物的方法。评价了新合成的化合物对肝癌细胞的体外细胞毒性。obatoclax类似物的吡咯和吲哚取代基表现出对细胞生长的有效抑制作用。在测试的化合物中，5d和5e对PLC5细胞有6.3和13.2μM的活性。进一步的分析证实了这些类似物在细胞死亡与p-STAT3抑制和SHP-1活化之间具有相关性。
• Inhibition of Human Enhancer of Zeste Homolog 2 with Tambjamine Analogs
  作者：Martin Kotev、Pilar Manuel-Manresa、Elsa Hernando、Vanessa Soto-Cerrato、Modesto Orozco、Roberto Quesada、Ricardo Pérez-Tomás、Victor Guallar

  DOI：10.1021/acs.jcim.7b00178

  日期：2017.8.28

  methyl transfer active site, showing, in addition, that the EZH2 isolated crystal structure is capable of being used in molecular screening studies. Altogether, this work provides a successful molecular model that will help in the identification of new specific EZH2 inhibitors and identify a novel class of tambjamine-derived EZH2 inhibitors with promising activities for their use in cancer treatment

  结合计算模型，从头化合物合成，以及体外和细胞实验，我们进行了对zeste同源2（EZH2）组蛋白赖氨酸N-甲基转移酶增强剂的抑制研究。该酶是PRC2复合物的重要催化组分，其改变与不同的癌症有关。我们在这里介绍几种在体外具有低微摩尔的tambjamine启发的衍生物导致癌细胞中组蛋白3三甲基化水平显着降低的活性。我们证明了在甲基转移活性位点的结合，此外，表明，EZH2分离的晶体结构能够用于分子筛选研究。总而言之，这项工作提供了一个成功的分子模型，将有助于鉴定新的特异性EZH2抑制剂，并鉴定出一类新的坦布胺衍生的EZH2抑制剂，它们在癌症治疗中具有广阔的应用前景。
• Novel imidazopyridine suppresses STAT3 activation by targeting SHP-1
  作者：Jung-Chen Su、Chuan-Hsun Chang、Szu-Hsien Wu、Chung-Wai Shiau

  DOI：10.1080/14756366.2018.1497019

  日期：2018.1.1

  The unregulated activation of STAT3 has been demonstrated to occur in many cancers and enhances tumour growth, migration, and invasion. Stimulation by cytokines, growth factors, and hormones triggers this activation by phosphorylating STAT3 at tyrosine 705. Novel imidazopyridine compounds were synthesized to evaluate the inhibition of STAT3 at Y705. Among the tested compounds, 16 reduced the level of phospho-STAT3, inhibited the downstream signalling cascade and subsequently attenuated the survival of hepatocellular carcinoma (HCC) cells. Further assays showed that the reduction effects of compound 16 on tyrosine 705 of STAT3 were attributed to up-regulation of protein tyrosine phosphatase SHP-1.
• Mitochondrial Impairment by Cyanine-Based Small Molecules Induces Apoptosis in Cancer Cells
  作者：Sohan Patil、Deepshikha Ghosh、Mithun Radhakrishna、Sudipta Basu

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.9b00304

  日期：2020.1.9

  proteins compared to obatoclax (a pan-Bcl-2 inhibitor). These novel small molecules arrested the cell cycle in the G0/G1 phase, cleaved caspase-3/9, and finally prompted late apoptosis. This small molecule-mediated mitochondrial damage induced remarkably high cervical cancer cell death. These unique small molecules can be further explored as chemical biology tools and next-generation organelle-targeted anticancer

  线粒体是细胞的强大力量，由于其参与多种细胞功能，已成为抗癌治疗中非常规的靶标之一。然而，用于癌细胞中选择性线粒体损伤的小分子的发展仍然是有限的，很少被探索。为了解决这个问题，在我们的工作中，我们通过一种简洁的策略合成了一种天然产物，启发了基于花青的3-甲氧基吡咯小分子文库。该策略涉及Vilsmeier和Pd（0）催化的Suzuki交叉偶联反应作为关键步骤。对HeLa宫颈癌细胞中文库成员的筛选揭示了两个新分子，它们位于亚细胞线粒体中并对其造成了破坏。这些小分子干扰抗凋亡蛋白（Bcl-2 / Bcl-xl）和促凋亡蛋白（Bax）产生活性氧（ROS）。分子对接研究表明，与obatoclax（泛Bcl-2抑制剂）相比，两个分子均与Bcl-2蛋白的BH3结构域更紧密地结合。这些新颖的小分子将细胞周期阻滞在G0 / G1期，裂解了caspase-3 / 9，最终提示了晚期细胞凋亡。这种小分子介导的线粒