Variolin B

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯并吡啶类
• 英文名称: Variolin B
• 英文别名: 5-(2-aminopyrimidin-4-yl)-4-hydroxy-9-aminopyrido[3',2':4,5]pyrrolo[1,2-c]pyrimidine；5-(2-aminopyrimidin-4-yl)-4-hydroxypyrido[3',2':4,5]pyrrolo[1,2-c]-pyrimidin-9-amine；variolin B 2；9-Amino-5-(2-aminopyrimidin-4-yl)pyrido[3',2':4,5]pyrrolo[1,2-c]pyrimidin-4-ol；13-amino-8-(2-aminopyrimidin-4-yl)-1,3,12-triazatricyclo[7.4.0.02,7]trideca-2(7),4,8,10,12-pentaen-6-one
• 化学式: C₁₄H₁₁N₇O
• 分子量: 293.288
• InChiKey: RTHKPHCVZVYDFN-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  124
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4-甲氧基吡啶-N-氧化物 在 三乙基硅烷 、 正丁基锂 、 三氟甲磺酸 、 间氯过氧苯甲酸 、 三氟乙酸 、 三氯氧磷 、 乙硫醇钠 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 氯仿 、 1,2-二氯乙烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 103.0h， 生成 Variolin B
  参考文献：
  名称：

  Concise Total Syntheses of Variolin B and Deoxyvariolin B

  摘要：

  The total synthesis of the marine alkaloid variolin B has been achieved in 8 steps and 17% overall yield, starting from commercially available 4-chloro-2-methylthiopyrimidine. The key reaction involves the tandem deoxygenation and cyclization of a triarylmethanol using a combination of triethylsilane and trifluoroacetic acid. In addition, the deoxygenated analogue was prepared in 6 steps and 23% overall yield, starting from the same starting material.

  DOI：

  10.1021/jo050523v

文献信息

• Carbodiimide-Mediated Preparation of the Tricyclic Pyrido[3‘,2‘:4,5]pyrrolo[1,2-<i>c</i>]pyrimidine Ring System and Its Application to the Synthesis of the Potent Antitumoral Marine Alkaloid Variolin B and Analog
  作者：Pedro Molina、Pilar M. Fresneda、Santiago Delgado

  DOI：10.1021/jo026508x

  日期：2003.1.1

  pyrido[3',2':4,5]pyrrolo[1,2-c]pyrimidine ring system, and finally installation of the 2-aminopyrimidine ring at C5. The required 7-azaindole ring appropriately substituted is formed by a modified indole synthesis involving a nitrene insertion process (two steps). Formation of the annelated pyrimidine ring is achieved by two routes both involving a carbodiimide-mediated cyclization process, which allow

  海洋生物碱variolin B的总合成已通过13个步骤完成，由3-甲酰基-4-甲氧基吡啶的总收率为6.5％。我们的方法是基于依次形成7-氮杂吲哚环，三环吡啶并[3'，2'：4,5]吡咯并[1,2-c]嘧啶环体系，最后安装2-氨基嘧啶环在C5。所需的被适当取代的7-氮杂吲哚环是通过涉及腈插入过程的改性吲哚合成（两个步骤）形成的。退火的嘧啶环的形成通过两个途径完成，这两个途径均涉及碳二亚胺介导的环化过程，这允许在核心三环的C9处引入胺官能团（六个步骤）。使用Bredereck规程（三个步骤）在C5处安装东北2-氨基嘧啶环。最终的，
• Application of Selective Palladium-Mediated Functionalization of the Pyrido[3′,2′:4,5]pyrrolo[1,2-c]pyrimidine Heterocyclic System for the Total Synthesis of Variolin B and Deoxyvariolin B
  作者：Alejandro Baeza、Javier Mendiola、Carolina Burgos、Julio Alvarez-Builla、Juan J. Vaquero

  DOI：10.1002/ejoc.201000599

  日期：2010.10

  TosMIC equivalent afforded trihalosubstituted pyrido[3',2':4,5]pyrrolo[1,2-c]pyrimidine. This compound was used in a new total synthesis of the alkaloid variolin B by selective and sequential C-N, C-C, and C-O palladium-mediated functionalization at the C9, C5, and C4 positions of the pyrido[3',2':4,5]pyrrolo[1,2-c]pyrimidine system. A formal synthesis of deoxyvariolin B is also described by using

  受保护的 3-溴-2-(溴甲基)-4-甲氧基吡咯并[2,3-b]吡啶和甲苯磺酰甲基异氰化物 (TosMIC) 反应得到吡啶并[3',2':4,5]吡咯并[1,2 -c]嘧啶衍生物，收率良好。该化合物通过在 C5 位置安装嘧啶部分、水解和脱羧而转化为高级中间体，用于天然生物碱 variolin B 的全合成或正式合成。 3-溴-2-（溴甲基）-4- 的反应氯吡咯并[2,3-b]吡啶与N-甲苯磺酰甲基二氯甲酰亚胺作为合成的TosMIC等价物得到三卤代吡啶并[3',2':4,5]吡咯并[1,2-c]嘧啶。该化合物通过选择性和连续的 CN、CC 和 CO 钯介导的吡啶基 C9、C5 和 C4 位置的官能化，用于生物碱 variolin B 的新全合成 [3'，2':4,5]吡咯并[1,2-c]嘧啶系统。通过使用相同的合成策略还描述了 deoxyvariolin B 的正式合成。
• Total Syntheses of Variolin B and Deoxyvariolin B¹
  作者：Abderaouf Ahaidar、David Fernández、Gerardo Danelón、Carmen Cuevas、Ignacio Manzanares、Fernando Albericio、John A. Joule、Mercedes Álvarez

  DOI：10.1021/jo035332b

  日期：2003.12.1

  alternative synthetic routes have been developed for the preparation of variolin B and deoxyvariolin B. The strategy is based on the preparation of the core tricyclic ring common to all variolins, pyrido[3',2':4,5]pyrrolo[1,2-c]pyrimidine, followed by a palladium-catalyzed cross-coupling reaction to give the tetracyclic system.

  已开发出两种可供选择的合成途径来制备水痘蛋白B和脱氧水痘蛋白B。该策略基于制备所有水痘蛋白共有的核心三环，即pyrido [3'，2'：4,5] pyrrolo [1， 2-c]嘧啶，然后进行钯催化的交叉偶联反应，得到四环系统。
• Total synthesis of variolin B
  作者：Regan J Anderson、Jonathan C Morris

  DOI：10.1016/s0040-4039(01)01881-0

  日期：2001.12

  The total synthesis of the marine alkaloid variolin B has been achieved in eight steps, starting from commercially available 4-chloro-2-methylthiopyrimidine. The key reaction involves the tandem deoxygenation and cyclization of a triarylmethanol using a combination of triethylsilane and trifluoroacetic acid.

  从市售的4-氯-2-甲基硫代嘧啶开始，海洋生物碱variolin B的总合成已通过八个步骤完成。关键反应涉及使用三乙基硅烷和三氟乙酸的组合进行三芳基甲醇的串联脱氧和环化反应。
• Synthesis of the potent antitumoral marine alkaloid variolin B
  作者：Pedro Molina、Pilar M. Fresneda、Santiago Delgado、Juan Antonio Bleda

  DOI：10.1016/s0040-4039(01)02321-8

  日期：2002.2

  The synthesis of the marine alkaloid variolin B has been completed in seven steps, starting from the iminophosphorane derived from ethyl α-azido-β-(4-methoxy-7-azaindol-3-yl) acrylate, available by condensation of 2-formyl-4-methoxy-7-aza-indole with ethyl azidoacetate. Formation of the annulated 2-aminopyrimidine ring is achieved by tandem aza-Wittig/carbodiimide-mediated cyclization whereas the 2-aminopyrimidine

  从衍生自α-叠氮基-β-（4-甲氧基-7-氮杂吲哚-3-基）丙烯酸乙酯的亚氨基磷烷开始的七个步骤完成了海洋生物碱variolin B的合成，该丙烯酸可通过2-甲酰基的缩合反应获得。具有叠氮基乙酸乙酯的-4-甲氧基-7-氮杂吲哚。通过串联的氮杂-维蒂希/碳二亚胺介导的环化反应，形成环状的2-氨基嘧啶环，而使用乙酰基作为嘧啶环的C 2部分形成C-5处的2-氨基嘧啶取代基。