12-[β-D-glucopyranosyl]-6,7,12,13-tetrahydroindolo[2,3-a]pyrrolo[3,4-c]carbazole-5,7-dione | 158204-55-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 12-[β-D-glucopyranosyl]-6,7,12,13-tetrahydroindolo[2,3-a]pyrrolo[3,4-c]carbazole-5,7-dione
• 英文别名: 11,11'-dechloro-4'-demethylrebeccamycin；BMY-41219；12-beta-D-glucopyranosyl-12,13-dihydro-5H-indolo[2,3-a]pyrrolo[3,4-c]carbazole-5,7(6H)-dione；3-[(2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]-3,13,23-triazahexacyclo[14.7.0.02,10.04,9.011,15.017,22]tricosa-1,4,6,8,10,15,17,19,21-nonaene-12,14-dione
• CAS: 158204-55-8
• 化学式: C₂₆H₂₁N₃O₇
• 分子量: 487.469
• InChiKey: FAKJOUAYZNXZGV-QCUUGYDUSA-N

物化性质

• 熔点：
  340-342 °C (decomp)(Solv: ethanol (64-17-5))
• 密度：
  1.86±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  157
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  L-蛋氨酸 、 12-[β-D-glucopyranosyl]-6,7,12,13-tetrahydroindolo[2,3-a]pyrrolo[3,4-c]carbazole-5,7-dione 在 SAH hydrolase 、 RebM methyltrasnferase 、 recombinant Homo sapiens methionine adenosyltransferase 2 、 potassium chloride 、 5’-三磷酸腺苷 、 magnesium chloride 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 5H-indolo(2,3-a)pyrrolo(3,4-c)carbazole-5,7(6h)-dione,1,11-dichloro-12,13-dihydro-12-(4-omethyl-beta-d-glucopyranosyl)
  参考文献：
  名称：

  合成和利用 S-腺苷-L-甲硫氨酸类似物的简便化学酶策略

  摘要：

  据报道，用于合成S-腺苷-L-甲硫氨酸 (SAM) 类似物的化学酶平台与下游 SAM 利用酶兼容。合成了 44 种非天然 S/Se 烷基化 Met 类似物，并将其用于探测五种不同的蛋氨酸腺苷转移酶 (MAT) 的底物特异性。人类 MAT II 是所分析的 MAT 中最受允许的之一，并且能够化学酶合成 29 种非天然 SAM 类似物。作为天然产物“烷基随机化”可行性的概念证明，通过使用耦合的 hMAT2-RebM 系统（RebM 是参与瑞贝卡霉素的糖 C4'- O-甲基转移酶）生成了一小组差异烷基化吲哚并咔唑类似物。生物合成）。在单个容器中耦合 SAM 合成和利用的能力避免了与 SAM 类似物快速分解相关的问题，从而为进一步研究各种 SAM 利用酶打开了大门。

  DOI：

  10.1002/anie.201308272
• 作为产物：
  描述：

  cis-3,4-bis(3-indolyl)-2,5-pyrrolidinedione 在 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 氯仿 为溶剂， 反应 104.0h， 生成 12-[β-D-glucopyranosyl]-6,7,12,13-tetrahydroindolo[2,3-a]pyrrolo[3,4-c]carbazole-5,7-dione
  参考文献：
  名称：

  区域控制的抗肿瘤抗生素AT2433-A1的合成。

  摘要：

  吲哚[2，3-a]咔唑糖苷是有效的抗肿瘤抗生素，目前正接受临床试验以治疗多种类型的癌症。AT2433-A1是该化合物家族中最复杂的成员，具有独特的二糖以及敏感的氨基脱氧糖和不对称糖苷配基。这种天然产物的合成需要糖基化的方法，该方法设定异头异构中心的立体化学和糖苷配基的区域化学。这些目标是通过对bis-3，4-（3-吲哚基）琥珀酰亚胺进行曼尼希环化反应而得到的，主要的二氢吲哚中间体可以与复杂的碳水化合物被立体选择性地糖基化，而没有羟基的保护或活化。通过在动力学或热力学条件之间进行选择，可以精确地控制曼尼希环化反应的区域化学。该策略最终导致抗肿瘤抗生素AT2433-A1的首次合成。

  DOI：

  10.1021/jo000911r

文献信息

• Natural Product Diversification Using a Non-natural Cofactor Analogue of <i>S</i>-Adenosyl-<scp>l</scp>-methionine
  作者：Changsheng Zhang、Rachel L. Weller、Jon S. Thorson、Scott R. Rajski

  DOI：10.1021/ja056231t

  日期：2006.3.1

  synthetic cofactor bearing a pendant 5'-amino acid N-mustard. Unlike previously studied synthetic cofactors, this material is very efficiently used by the natural product biosynthetic enzyme rebeccamycin methyltransferase (RebM) to generate a number of new rebeccamycin analogues. These data promote the notion that natural product methyltransferases can be used with non-natural cofactors to enhance

  带有 5'-氮丙啶或 5'-N-芥末亲电子试剂的腺苷类似物是甲基转移酶依赖性 DNA 烷化剂。我们在此展示了一种带有悬垂 5'-氨基酸 N-芥末的新型合成辅因子。与先前研究的合成辅因子不同，天然产物生物合成酶瑞贝卡霉素甲基转移酶 (RebM) 非常有效地使用这种材料来生成许多新的瑞贝卡霉素类似物。这些数据促进了天然产物甲基转移酶可与非天然辅因子一起使用以增强天然产物类似物的分子多样性以用于药物发现的概念。据我们所知，这是除 DNA 甲基转移酶之外的第一个生物甲基转移酶的文献，它可以利用这种合成辅因子。
• Indolocarbazole anticancer agents and methods of using same
  申请人：Advanced Life Sciences, Inc.

  公开号：US20040077554A1

  公开（公告）日：2004-04-22

  The present invention relates to anti-tumor compounds, compositions and methods. In particular, the invention relates to indolocarbazole analogues of the following general formulas that inhibit topoisomerase I activity. 1

  本发明涉及抗肿瘤化合物、组合物和方法。具体而言，本发明涉及抑制拓扑异构酶I活性的以下一般公式的吲哚咔唑类似物。
• US7122526B2
  申请人：——

  公开号：US7122526B2

  公开（公告）日：2006-10-17
• Facile Chemoenzymatic Strategies for the Synthesis and Utilization of<i>S</i>-Adenosyl-<scp>L</scp>-Methionine Analogues
  作者：Shanteri Singh、Jianjun Zhang、Tyler D. Huber、Manjula Sunkara、Katherine Hurley、Randal D. Goff、Guojun Wang、Wen Zhang、Chunming Liu、Jürgen Rohr、Steven G. Van Lanen、Andrew J. Morris、Jon S. Thorson

  DOI：10.1002/anie.201308272

  日期：2014.4.7

  the chemoenzymatic synthesis of 29 non‐native SAM analogues. As a proof of concept for the feasibility of natural product “alkylrandomization”, a small set of differentially‐alkylated indolocarbazole analogues was generated by using a coupled hMAT2–RebM system (RebM is the sugar C4′‐O‐methyltransferase that is involved in rebeccamycin biosynthesis). The ability to couple SAM synthesis and utilization

  据报道，用于合成S-腺苷-L-甲硫氨酸 (SAM) 类似物的化学酶平台与下游 SAM 利用酶兼容。合成了 44 种非天然 S/Se 烷基化 Met 类似物，并将其用于探测五种不同的蛋氨酸腺苷转移酶 (MAT) 的底物特异性。人类 MAT II 是所分析的 MAT 中最受允许的之一，并且能够化学酶合成 29 种非天然 SAM 类似物。作为天然产物“烷基随机化”可行性的概念证明，通过使用耦合的 hMAT2-RebM 系统（RebM 是参与瑞贝卡霉素的糖 C4'- O-甲基转移酶）生成了一小组差异烷基化吲哚并咔唑类似物。生物合成）。在单个容器中耦合 SAM 合成和利用的能力避免了与 SAM 类似物快速分解相关的问题，从而为进一步研究各种 SAM 利用酶打开了大门。
• Regiocontrolled Synthesis of the Antitumor Antibiotic AT2433-A1
  作者：John D. Chisholm、David L. Van Vranken

  DOI：10.1021/jo000911r

  日期：2000.11.1

  The indolo[2,3-a]carbazole glycosides are potent antitumor antibiotics currently undergoing clinical trials for the treatment of numerous types of cancer. AT2433-A1 is the most complex member of this family of compounds possessing a unique disaccharide with a sensitive aminodeoxysugar and an unsymmetric aglycon. The synthesis of this natural product requires a method for glycosylation that sets the

  吲哚[2，3-a]咔唑糖苷是有效的抗肿瘤抗生素，目前正接受临床试验以治疗多种类型的癌症。AT2433-A1是该化合物家族中最复杂的成员，具有独特的二糖以及敏感的氨基脱氧糖和不对称糖苷配基。这种天然产物的合成需要糖基化的方法，该方法设定异头异构中心的立体化学和糖苷配基的区域化学。这些目标是通过对bis-3，4-（3-吲哚基）琥珀酰亚胺进行曼尼希环化反应而得到的，主要的二氢吲哚中间体可以与复杂的碳水化合物被立体选择性地糖基化，而没有羟基的保护或活化。通过在动力学或热力学条件之间进行选择，可以精确地控制曼尼希环化反应的区域化学。该策略最终导致抗肿瘤抗生素AT2433-A1的首次合成。