1-(2’,3’,5’-tri-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl)-thymine | 4336-39-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-(2’,3’,5’-tri-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl)-thymine
• 英文别名: (2R,3R,4R,5R)-2-(acetoxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3,4-diyl diacetate；2,3,5-tri-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl thymine；5-methyluridine 2′,3′,5′-triacetate；2′,3′,5′-tri-O-acetyl-β-D-ribothymidine；O^2'_,O3'_,O5'-triacetyl-5-methyl-uridine；1-(2',3',5'-tri-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl)-5-methyluridine；2′,3′,5′-tri-O-acetyl-5-methyluridine；5-methyluridine triacetate；[(2R,3R,4R,5R)-3,4-diacetyloxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl acetate
• CAS: 4336-39-4
• 化学式: C₁₆H₂₀N₂O₉
• 分子量: 384.343
• InChiKey: XMDWATDROXTTHT-RGCMKSIDSA-N

物化性质

• 熔点：
  167-168 °C(Solv: ethyl acetate (141-78-6))
• 密度：
  1.40±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.1
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  138
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2’,3’,5’-tri-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl)-thymine 在 palladium diacetate 、 lithium bromide 、 sodium methylate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲醇 为溶剂， 反应 39.0h， 以68%的产率得到司他夫定
  参考文献：
  名称：

  由三乙酰5-甲基尿苷合成2′,3′-二脱氢-3′- 脱氧胸苷的方法

  摘要：

  本发明涉及一种由三乙酰5‑甲基尿苷合成2´,3´‑二脱氢‑3´‑脱氧胸苷的方法：钯催化三乙酰5‑甲基尿苷的消除反应，然后羟基脱保护生成2´,3´‑二脱氢‑3´‑脱氧胸苷。该化合物的制备步骤为：取三乙酰5‑甲基尿苷、钯催化剂和卤化锂加入到有机溶剂中，加热，反应结束后蒸干反应液；然后再加入甲醇钠和甲醇溶液、室温搅拌，反应结束后，过滤、蒸干甲醇；剩余固体用丙酮重结晶、过滤、干燥即得2´,3´‑二脱氢‑3´‑脱氧胸苷产物。该方法两步合成2´,3´‑二脱氢‑3´‑脱氧胸苷化合物，避免了有毒卤素和大量强酸的使用、操作简单，经济高效，产率高，应用前景广阔。

  公开号：

  CN106632554B
• 作为产物：
  描述：

  2',3',5'-三乙酰尿苷 在 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 nitrosonium tetrafluoroborate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 1-(2’,3’,5’-tri-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl)-thymine
  参考文献：
  名称：

  嘧啶核苷的修饰和同位素标记中的转糖基化。

  摘要：

  嘧啶核苷的转糖基化在微波辐射下一锅合成尿苷衍生物中得到证明。具有5-硝基的2'，3'，5'-三-O-乙酰尿苷的感应活化产生反应性更高的糖基供体。在优化的Vorbrüggen条件下，5-硝基尿苷促进了与一系列5-取代的尿嘧啶的可逆核碱基交换。该协议还以热加热下的克级反应为例。该策略可轻松获得同位素标记的尿苷。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.0c01941

文献信息

• Systematic assignment of NMR spectra of 5-substituted-4-thiopyrimidine nucleosides
  作者：Xiaohui Zhang、Jian Wang、Yao-Zhong Xu

  DOI：10.1002/mrc.3980

  日期：2013.9

  characterization of 5‐substituted‐4‐thiopyrimidine nucleosides (ribonucleosides and 2'‐deoxynucleosides) was performed using NMR spectroscopy. Assignments of all proton and carbon signals of 5‐bromo‐4‐thiouridine and related nucleosides were systematically carried out and firmly established by COSY and HMQC techniques. The NMR data of various 4‐thiopyrimidine nucleosides are compared, and the key contributing

  使用 NMR 光谱对 5-取代-4-硫代嘧啶核苷（核糖核苷和 2'-脱氧核苷）进行明确表征。5-溴-4-硫尿苷和相关核苷的所有质子和碳信号的分配是通过 COZY 和 HMQC 技术系统地进行并牢固建立的。比较了各种 4-硫代嘧啶核苷的 NMR 数据，并讨论了关键影响因素。这里介绍的方法适用于其他修饰的核苷和核苷酸，以及核碱基。版权所有 © 2013 John Wiley & Sons, Ltd.
• [EN] SYNTHESIS OF BACKBONE MODIFIED MORPHOLINO OLIGONUCLEOTIDES AND CHIMERAS USING PHOSPHORAMIDITE CHEMISTRY<br/>[FR] SYNTHÈSE D'OLIGONUCLÉOTIDES MORPHOLINO MODIFIÉS PAR SQUELETTE ET CHIMÈRES UTILISANT LA CHIMIE PHOSPHORAMIDITE
  申请人：UNIV COLORADO REGENTS

  公开号：WO2018057430A1

  公开（公告）日：2018-03-29

  Amine substituted morpholino oligonucleotides, other than the classical N,N-dimethylamino PMO analogue, and methods of efficiently synthesizing these oligonucleotides with high yield are provided. Morpholino oligonucleotides having thiophosphoramidate, phosphoramidate, phosphoramidate diester, and alkyl phosphoramidate linkers. Chimeras containing unmodified DNA/RNA and other analogs of DNA/RNA can be prepared. These oligonucleotides form duplexes with complementary DNA or RNA that are more stable than natural DNA or DNA/RNA complexes, are active with RNAse H1, and may be transfected into cells using standard lipid reagents. These analogues are therefore useful for numerous applications.

  提供了替代传统N,N-二甲基氨基PMO类似物的吗啉基寡核苷酸以及高产率有效合成这些寡核苷酸的方法。这些寡核苷酸具有硫代磷酰胺酸酰胺、磷酸酰胺酰胺、磷酸酰胺二酯和烷基磷酰胺酰胺连接基。可以制备含有未修饰DNA/RNA和其他DNA/RNA类似物的嵌合体。这些寡核苷酸与互补的DNA或RNA形成的双链比天然DNA或DNA/RNA复合物更稳定，与RNA酶H1活性，可以使用标准脂质试剂转染到细胞中。因此，这些类似物在许多应用中非常有用。
• Effective Synthesis of Nucleosides Utilizing O-Acetyl-Glycosyl Chlorides as Glycosyl Donors in the Absence of Catalyst: Mechanism Revision and Application to Silyl-Hilbert-Johnson Reaction
  作者：Chengyuan Liang、Weihui Ju、Shunjun Ding、Han Sun、Gennian Mao

  DOI：10.3390/molecules22010084

  日期：——

  An effective synthesis of nucleosides using glycosyl chlorides as glycosyl donors in the absence of Lewis acid has been developed. Glycosyl chlorides have been shown to be pivotal intermediates in the classical silyl-Hilbert-Johnson reaction. A possible mechanism that differs from the currently accepted mechanism advanced by Vorbrueggen has been proposed and verified by experiments. In practice, this

  已经开发了在不存在路易斯酸的情况下使用糖基氯化物作为糖基供体的有效的核苷合成方法。糖基氯已被证明是经典的甲硅烷基-希尔伯特-约翰逊反应中的关键中间体。已经提出了一种可能的机制，该机制与Vorbrueggen提出的当前接受的机制不同，并通过实验进行了验证。实际上，这种无催化剂的方法可轻松轻松地获得卡培他滨。
• A general method for N-glycosylation of nucleobases promoted by (p-Tol)₂SO/Tf₂O with thioglycoside as donor
  作者：Guang-jian Liu、Xiao-tai Zhang、Guo-wen Xing

  DOI：10.1039/c5cc03617h

  日期：——

  35 nucleosides were synthesized by coupling thioglycosides with pyrimidines and purines under the preactivation of (p-Tol)₂SO/Tf₂O in high yields and with β-stereoselectivities.

  35个核苷酸通过在高产率和β-立体选择性下，在（p-Tol）2SO/Tf2O的预活化下，将硫代糖苷与嘧啶和嘌呤偶联合成。
• An Efficient Approach to the Synthesis of Nucleosides: Gold(I)-Catalyzed N-Glycosylation of Pyrimidines and Purines with Glycosyl ortho-Alkynyl Benzoates
  作者：Qingju Zhang、Jiansong Sun、Yugen Zhu、Fuyi Zhang、Biao Yu

  DOI：10.1002/anie.201100514

  日期：2011.5.16

  Persuaded with gold: The title reaction in the presence of [Ph3PAuNTf2] (Tf=trifluoromethanesulfonyl) led conveniently to the corresponding nucleosides with excellent regioselectivity (see scheme). Even purine derivatives underwent this transformation owing to the mild conditions, which enabled the use of protecting groups that would not usually be compatible with N‐glycosylation conditions.

  用金说服：在[Ph 3 PAuNTf 2 ]（Tf =三氟甲磺酰基）存在下的标题反应可方便地产生具有良好区域选择性的相应核苷（参见方案）。由于条件温和，即使是嘌呤衍生物也经历了这种转变，这使得能够使用通常与N-糖基化条件不相容的保护基。