3-(benzyloxymethyl)thymine | 119451-90-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 3-(benzyloxymethyl)thymine
• 英文别名: 3-((benzyloxy)methyl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；N³-BOM-thymine；2,4(1H,3H)-Pyrimidinedione, 5-methyl-3-[(phenylmethoxy)methyl]-；5-methyl-3-(phenylmethoxymethyl)-1H-pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 119451-90-0
• 化学式: C₁₃H₁₄N₂O₃
• 分子量: 246.266
• InChiKey: XOQOAFYFNMHNSD-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  127 °C
• 密度：
  1.216±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  58.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(benzyloxymethyl)thymine 在 三乙酰氧基硼氢化钠 、 potassium carbonate 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 1,2-二氯乙烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 99.0h， 生成 5-methyl-1-(1-(3-phenoxybenzyl)piperidin-3-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  拟订针对抗结核病药物的专有胸苷酸激酶抑制剂基序

  摘要：

  我们报告了基于革兰氏阳性细菌TMPK抑制剂命中化合物1的一系列非核苷Mtb TMPK抑制剂的设计和合成（1 – 14）。开发了实用的合成方法以访问这些类似物。几种化合物显示出有希望的Mtb TMPK抑制潜能，并可以建立结构-活性关系，这有助于进一步优化。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2016.08.041
• 作为产物：
  描述：

  O,O-二(三甲基甲硅烷基)胸苷 在 四丁基氟化铵 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 45.25h， 生成 3-(benzyloxymethyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  Benneche, Tore; Gundersen, Lise-Lotte; Undheim, Kjell, Acta chemica Scandinavica. Series B: Organic chemistry and biochemistry, 1988, vol. 42, # 6, p. 384 - 389

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Efficient diastereoselective synthesis of a new class of azanucleosides: 2′-homoazanucleosides
  作者：Jakob Bouton、Kristof Van Hecke、Serge Van Calenbergh

  DOI：10.1016/j.tet.2017.05.083

  日期：2017.7

  Azanucleosides, sugar-modified nucleoside analogues containing a 4' nitrogen atom, have shown a lot of therapeutic potential, e.g. as anti-cancer and antiviral agents. We report the synthesis of a series of 2'-homoazanucleosides, in which the nucleobase is attached to the 2'-position of the pyrrolidine ring via a methylene linker. A suitable orthogonally protected iminosugar was synthesized by ring

  氮杂核苷是含有 4' 氮原子的糖修饰核苷类似物，已显示出很大的治疗潜力，例如作为抗癌和抗病毒剂。我们报道了一系列 2'-同氮杂核苷的合成，其中核碱基通过亚甲基连接体连接到吡咯烷环的 2'-位置。以闭环复分解和二羟基化为关键步骤合成了合适的正交保护的亚氨基糖，并通过与适当保护的核碱基的Mitsunobu反应进一步转化为一系列8个核苷类似物。然后用硫醇进一步衍生腺嘌呤类似物的5'位，得到2种另外的化合物。评估最终化合物的生物活性。
• Synthesis of Nucleosides with Additional Nucleobases
  作者：Charlotte Andersen、S⊘ren L. Pedersen、Poul Nielsen

  DOI：10.1080/15257770701542199

  日期：2007.11.26

  The syntheses of two nucleosides with additional nucleobases in the 2'-position are presented. The nucleosides have two- and one-carbon linkers to the additional nucleobase, respectively. The two nucleosides are synthesized from different strategies. The nucleoside with two carbons in the linker has been incorporated into oligonucleotides and showed stabilization of a tree-way junction.

  提出了两个在2'位置具有附加核苷碱基的核苷的合成。核苷分别具有至另一个核苷碱基的二碳和一碳接头。这两种核苷是从不同的策略合成的。连接子中具有两个碳原子的核苷已被整合到寡核苷酸中，并显示出树状连接的稳定性。
• Influence of theN3-Protection Group onN1- vs.O2-Alkylation in the Mitsunobu Reaction
  作者：Olaf R. Ludek、Chris Meier

  DOI：10.1002/ejoc.200500801

  日期：2006.2

  The influence of the N3-protection group of thymine on the regioselectivity of the N1- vs. O2-alkylation under Mitsunobu conditions is described. A series of N3-protected thymine derivatives 8a–f was prepared and coupled to cyclopentanol as model compound for carbocyclic nucleoside precursors. Finally, the N3-BOM group was selected to improve our previously reported synthetic strategy to carbocyclic

  描述了在 Mitsunobu 条件下胸腺嘧啶的 N3-保护基团对 N1-与 O2-烷基化的区域选择性的影响。制备了一系列 N3 保护的胸腺嘧啶衍生物 8a-f，并与环戊醇偶联作为碳环核苷前体的模型化合物。最后，选择 N3-BOM 组来改进我们之前报道的碳环胸苷 (carba-dT) 合成策略。此外，2,6-二甲基-Bz 基团专门导致了carba-dT 的O2-类似物。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2006)
• New and Efficient Synthesis of Racemic Cyclopent-3-en-1-yl Nucleoside Analogues and Their Derivatives
  作者：Bastian Reichardt、Olaf R. Ludek、Chris Meier

  DOI：10.1135/cccc20061011

  日期：——

  A new, efficient synthesis of racemic cyclopent-3-en-1-yl nucleoside analogues has been developed starting from cyclopentadiene. The key step is the regioselective hydroboration of an intermediately formed mixture of two alkylated cyclopentadienes to give one cyclopentenol. The remaining double bond was further functionalized by hydroboration, epoxidation, cis-hydroxylation and cyclopropanation.

  已开发出一种新的高效合成方法，从环戊二烯出发合成了外消旋环戊-3-烯-1-基核苷类似物。关键步骤是对中间形成的两种烷基化环戊二烯混合物进行区域选择性氢硼化，得到一个环戊醇。剩余的双键进一步通过氢硼化、环氧化、顺式羟基化和环丙烷化进行官能化。
• Convergent or Linear? A Challenging Question in Carbocyclic Nucleoside Chemistry
  作者：Victor Marquez、Olaf Ludek

  DOI：10.1055/s-2007-990847

  日期：2007.11

  dine (N-MCT) is a carbocyclic nucleoside analogue with potent anti-HSV and KSHV activity. The critical step in the synthesis of N-MCT and other carbocyclic nucleoside analogues is the introduction of the nucleobase into the carbocyclic moiety. For this, convergent and linear strategies were compared side by side. In the convergent approach, the base was coupled to the carbocyclic moiety by either a

  North-methanocarbathymidine (N-MCT) 是一种碳环核苷类似物，具有有效的抗 HSV 和 KSHV 活性。合成 N-MCT 和其他碳环核苷类似物的关键步骤是将核碱基引入碳环部分。为此，并排比较了收敛策略和线性策略。在收敛方法中，碱基通过光信反应或甲磺酸酯的置换与碳环部分偶联。该策略导致形成不同量的O 2 -区域异构体，这取决于所应用的程序。此外，Mitsunobu 反应的副产物必须从偶联产物中分离出来。虽然更长，但线性策略选择性地导致目标化合物 N-MCT，总产率与收敛方法相当，