pantetheine dimethyl ketal | 167308-64-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: pantetheine dimethyl ketal
• 英文别名: (R)-N-(3-((2-mercaptoethyl)amino)-3-oxopropyl)-2,2,5,5-tetramethyl-1,3-dioxane-4-carboxamide；(4R)-2,2,5,5-tetramethyl-N-[3-oxo-3-(2-sulfanylethylamino)propyl]-1,3-dioxane-4-carboxamide
• CAS: 167308-64-7
• 化学式: C₁₄H₂₆N₂O₄S
• 分子量: 318.437
• InChiKey: BEJWEVOGZUWGEB-NSHDSACASA-N

物化性质

• 熔点：
  113-115 °C(Solv: ethyl acetate (141-78-6); hexane (110-54-3))
• 沸点：
  549.1±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.092±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.5
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  77.7
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  pantetheine dimethyl ketal 在 CoaA, CoaD and CoaE enzymes were amplified from a colony of E_. coli BL₂₁(DE₃) 作用下， 以 二甲基亚砜 、 甲苯 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 S-乙酰乙酰基辅酶a
  参考文献：
  名称：

  酰基辅酶A底物的化学酶法合成使小分子和蛋白质的原位标记成为可能。

  摘要：

  描述了一种化学酶促方法，其产生全功能的酰基辅酶A分子，然后将其用作底物以驱动原位酰基转移反应。还说明了基于质谱的测定法，以验证酰基辅酶A酶产物的身份。该方法响应于可以修饰为其相应的辅酶A硫酯的各种羧酸，在利用酰基辅酶A底物的广泛化学生物学研究中具有潜在的应用前景。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.5b02113
• 作为产物：
  描述：

  isopropylidene-D-pantethine 在 sodium tetrahydroborate 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 6.0h， 以84.7%的产率得到pantetheine dimethyl ketal
  参考文献：
  名称：

  磺酸盐/硝基甲基丙二酰硫酯等排体应用于甲基丙二酰辅酶 A 脱羧酶结构-功能研究

  摘要：

  丙二酰-硫酯是丙二酰-CoA 和丙二酰-S-酰基载体蛋白的反应中心，对脂肪酸、聚酮化合物和各种专门的代谢物生物合成必不可少。产生或使用丙二酰硫酯的酶会在晶体学时间范围内自发地水解或脱羧反应物，从而阻止确定结构-功能关系。为了解决这个问题，我们合成了一组甲基丙二酰辅酶A类似物，其中羧酸盐由磺酸盐或硝基表示，硫酯保留或由酯或酰胺表示。与我们的类似物复合的大肠杆菌甲基丙二酰辅酶 A 脱羧酶的结构提供了对底物结合和催化机制的深入了解。与直觉相反，我们类似物的带负电荷的磺酸盐和硝基官能团结合在活性位点疏水口袋中。脱羧后，烯醇中间体被组氨酸质子化，防止 CO2-烯醇重组，产生丙酰辅酶 A。活性测定支持组氨酸催化酸并揭示该酶显示出显着的水解活性。我们的结构还提供了对这种水解活性的洞察。我们的类似物以低微摩尔 Ki 值抑制脱羧/水解活性。该研究开创了使用具有羧酸等排体的丙二酰辅酶A类似物来研究酰基辅酶A羧

  DOI：

  10.1021/jacs.9b00650

文献信息

• Acyl-group specificity of AHL synthases involved in quorum-sensing in <i>Roseobacter</i> group bacteria
  作者：Lisa Ziesche、Jan Rinkel、Jeroen S Dickschat、Stefan Schulz

  DOI：10.3762/bjoc.14.112

  日期：——

  N-Acylhomoserine lactones (AHLs) are important bacterial messengers, mediating different bacterial traits by quorum sensing in a cell-density dependent manner. AHLs are also produced by many bacteria of the marine Roseobacter group, which constitutes a large group within the marine microbiome. Often, specific mixtures of AHLs differing in chain length and oxidation status are produced by bacteria, but how the biosynthetic enzymes, LuxI homologs, are selecting the correct acyl precursors is largely unknown. We have analyzed the AHL production in Dinoroseobacter shibae and three Phaeobacter inhibens strains, revealing strain-specific mixtures. Although large differences were present between the species, the fatty acid profiles, the pool for the acyl precursors for AHL biosynthesis, were very similar. To test the acyl-chain selectivity, the three enzymes LuxI₁ and LuxI₂ from D. shibae DFL-12 as well as PgaI₂ from P. inhibens DSM 17395 were heterologously expressed in E. coli and the enzymes isolated for in vitro incubation experiments. The enzymes readily accepted shortened acyl coenzyme A analogs, N-pantothenoylcysteamine thioesters of fatty acids (PCEs). Fifteen PCEs were synthesized, varying in chain length from C₄ to C₂₀, the degree of unsaturation and also including unusual acid esters, e.g., 2E,11Z-C18:2-PCE. The latter served as a precursor of the major AHL of D. shibae DFL-12 LuxI₁, 2E,11Z-C18:2-homoserine lactone (HSL). Incubation experiments revealed that PgaI₂ accepts all substrates except C₄ and C₂₀-PCE. Competition experiments demonstrated a preference of this enzyme for C₁₀ and C₁₂ PCEs. In contrast, the LuxI enzymes of D. shibae are more selective. While 2E,11Z-C18:2-PCE is preferentially accepted by LuxI₁, all other PCEs were not, except for the shorter, saturated C₁₀–C₁₄-PCEs. The AHL synthase LuxI₂ accepted only C₁₄ PCE and 3-hydroxydecanoyl-PCE. In summary, chain-length selectivity in AHLs can vary between different AHL enzymes. Both, a broad substrate acceptance and tuned specificity occur in the investigated enzymes.

  N-酰基脱氨核糖乳酸（AHLs）是重要的细菌信使，在细胞密度依赖的方式中介导不同的细菌特征。AHLs也被许多海洋玫瑰细菌组的细菌产生，这在海洋微生物组中占据着一个大的群体。通常，细菌会产生具有不同链长和氧化状态的AHLs的特定混合物，但是生物合成酶LuxI同源物如何选择正确的酰前体大部分是未知的。我们分析了Dinoroseobacter shibae和三株Phaeobacter inhibens菌株中的AHL产生，揭示了菌株特异性混合物。尽管这些物种之间存在很大差异，但脂肪酸谱，即AHL生物合成的酰前体池，非常相似。为了测试酰链选择性，从D. shibae DFL-12的三种酶LuxI1和LuxI2以及从P. inhibens DSM 17395的PgaI2在大肠杆菌中异源表达，并将酶分离用于体外孵育实验。这些酶容易接受缩短的酰辅酶A类似物，即脂肪酸的泛酸半胱氨基乙酰硫酯（PCEs）。合成了15种PCEs，链长从C4到C20不等，不饱和度不同，还包括不寻常的酸酯，例如2E,11Z-C18:2-PCE。后者作为D. shibae DFL-12 LuxI1的主要AHL的前体，2E,11Z-C18:2-脱氨核糖乳酸（HSL）。孵育实验表明，PgaI2接受除C4和C20-PCE之外的所有底物。竞争实验表明，这种酶对C10和C12 PCE有偏好。相比之下，D. shibae的LuxI酶更具选择性。虽然2E,11Z-C18:2-PCE优先被LuxI1接受，但除了较短的饱和C10-C14-PCE之外，所有其他PCE都不被接受。AHL合酶LuxI2仅接受C14 PCE和3-羟基癸酰-PCE。总之，AHL中的链长选择性在不同的AHL酶之间可能有所不同。在研究的酶中既有广泛的底物接受性，也有调节的特异性。
• [EN] METHODS FOR PRODUCING D-TRYPTOPHAN AND SUBSTITUTED D-TRYPTOPHANS<br/>[FR] PROCÉDÉS DE PRODUCTION DE D-TRYPTOPHANE ET DE D-TRYPTOPHANES SUBSTITUÉS
  申请人：UNIV CALIFORNIA

  公开号：WO2021055696A1

  公开（公告）日：2021-03-25

  Single-module nonribosomal peptide synthetases (NRPSs) and NRPS-like enzymes activate and transform carboxylic acids in both primary and secondary metabolism; and are of great interest due to their biocatalytic potentials. The single-module NRPS IvoA is essential for fungal pigment biosynthesis. As disclosed herein, we show that IvoA catalyzes ATP-dependent unidirectional stereoinversion of L-tryptophan to D-tryptophan with complete conversion. While the stereoinversion is catalyzed by the epimerization (E) domain, the terminal condensation (C) domain stereoselectively hydrolyzes D-tryptophanyl-S-phosphopantetheine thioester and thus represents a noncanonical C domain function. Using IvoA, we demonstrate a biocatalytic stereoinversion/deracemization route to access a variety of substituted D-tryptophan analogs in high enantiomeric excess.

  单模块非核糖体肽合酶（NRPSs）和类NRPS酶在初级和次级代谢中激活和转化羧酸，由于其生物催化潜力，备受关注。单模块NRPS IvoA 对真菌色素生物合成至关重要。正如本文所披露的，我们展示了IvoA 催化ATP依赖的L-色氨酸向D-色氨酸的单向立体反转，实现了完全转化。虽然立体反转由外消旋（E）结构域催化，但末端缩合（C）结构域具有立体选择性地水解D-色氨酰-S-磷酰巯基丝氨酸酯，因此代表了非规范的C结构域功能。利用IvoA，我们展示了一种生物催化的立体反转/去消旋途径，以获得多种取代D-色氨酸类似物，其旋光异构体过量达到高水平。
• Step-Economic Synthesis of Biomimetic β-Ketopolyene Thioesters and Demonstration of Their Usefulness in Enzymatic Biosynthesis Studies
  作者：Johannes Wunderlich、Theresa Roß、Marius Schröder、Frank Hahn

  DOI：10.1021/acs.orglett.0c01348

  日期：2020.7.2

  by limited access to appropriate substrate surrogates. We present a step-economic synthetic access to biomimetic β-ketopolyene thioesters that is based on an Ir-catalyzed reductive Horner–Wadsworth–Emmons olefination. New β-ketotriene and pentaenethioates of pantetheine and N-acetylcysteamine were exemplarily synthesized via short and concise routes. The usefulness of these compounds was demonstrated

  多烯硫酯中间体的生物合成工艺研究由于难以获得合适的底物替代物而变得复杂。我们提出了一种仿生的β-酮多烯硫酯的逐步经济合成方法，该方法基于Ir催化的还原性Horner-Wadsworth-Emmons烯烃化反应。示例性地通过简短的途径合成泛酸的新的β-酮三烯和戊烯硫醚以及N-乙酰基半胱胺。这些化合物的有用性在体外测定中得到了证明，该酮还原酶结构域来自Mycolactone生物合成的MycKRB。
• The Role of a Nonribosomal Peptide Synthetase in<scp>l</scp>-Lysine Lactamization During Capuramycin Biosynthesis
  作者：Xiaodong Liu、Yuanyuan Jin、Zheng Cui、Koichi Nonaka、Satoshi Baba、Masanori Funabashi、Zhaoyong Yang、Steven G. Van Lanen

  DOI：10.1002/cbic.201500701

  日期：2016.5.3

  biosynthetic mechanism for producing the aminocaprolactam moiety in the capuramycin anti‐mycobacterial antibiotics was delineated by using a combined in vivo and in vitro approach. The process is initiated by adenylation and thioesterification of l‐Lys and characterized by an apparently nonenzymatic intramolecular lactamization.

  天然产物中的氨基己内酰胺：通过体内和体外相结合的方法，描述了在辣椒霉素抗分枝杆菌抗生素中产生氨基己内酰胺部分的生物合成机制。该过程由L -Lys 的腺苷酸化和硫酯化引发，其特征是明显的非酶分子内内酰胺化。
• COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE TREATMENT OF INFLAMMATION AND LIPID DISORDERS
  申请人：Kandula Mahesh

  公开号：US20150057347A1

  公开（公告）日：2015-02-26

  The invention relates to the compounds of formula I and formula II or its pharmaceutical acceptable salts, as well as polymorphs, solvates, enantiomers, stereoisomers and hydrates thereof. The pharmaceutical compositions comprising an effective amount of compounds of formula I or formula II; and methods for treating or preventing inflammation and lipid disorders may be formulated for oral, buccal, rectal, topical, transdermal, transmucosal, intravenous, parenteral administration, syrup, or injection. Such compositions may be used to treatment of hypertriglyceridemia, steatohepatitis, cystinosis and inflammatory diseases.

  该发明涉及公式I和公式II的化合物或其药用可接受的盐，以及其多晶型、溶剂合物、对映体、立体异构体和水合物。包括有效量的公式I或公式II化合物的药物组合物；以及用于治疗或预防炎症和脂质紊乱的方法可以制成口服、颊内、直肠、局部、经皮、经粘膜、静脉、肠道给药、糖浆或注射剂。这种组合物可用于治疗高三酸甘油酯血症、脂肪肝、半胱氨酸症和炎症性疾病。