3-((4R)-2-(4-methoxyphenyl)-5,5-dimethyl-1,3-dioxane-4-carboxamido)propanoic acid | 864239-47-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 3-((4R)-2-(4-methoxyphenyl)-5,5-dimethyl-1,3-dioxane-4-carboxamido)propanoic acid
• 英文别名: 3-{[(4R)-2-(p-methoxyphenyl)-5,5-dimethyl-1,3-dioxan-4-yl]carbonylamino}propionic acid；3-[[(4R)-2-(4-methoxyphenyl)-5,5-dimethyl-1,3-dioxane-4-carbonyl]amino]propanoic acid
• CAS: 864239-47-4
• 化学式: C₁₇H₂₃NO₆
• 分子量: 337.373
• InChiKey: CJZGGABZTIUAKJ-LBAUFKAWSA-N

物化性质

• 沸点：
  576.7±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.192±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  94.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-((4R)-2-(4-methoxyphenyl)-5,5-dimethyl-1,3-dioxane-4-carboxamido)propanoic acid 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 (4R)-2-(4-methoxyphenyl)-5,5-dimethyl-N-(3-(3-morpholinopropylamino)-3-oxopropyl)-1,3-dioxane-4-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  探索大肠杆菌泛酸激酶活性位点中底物结合所必需的结构基序

  摘要：

  辅酶 A (CoA) 生物合成酶已被用于生产各种 CoA 类似物，包括 CoA 依赖性酶的机械探针，例如参与脂肪酸生物合成的酶。这些酶对于激活泛酰胺类抗菌剂和最近报道的抗生素抗性抑制剂家族也很重要。在此我们报告了泛酸激酶选择性的研究，泛酸激酶是 CoA 生物合成的第一步和限速步骤。开发了一种强大的合成路线，以允许快速访问在 β-丙氨酸部分、羧酸盐或孪生二甲基基团上多样化的泛酸类似物的小型文库。所有衍生物均作为大肠杆菌泛酸激酶 ( Ec潘K）。四种衍生物，全是N-芳香族泛酰胺，被证明与作为Ec PanK底物的基准N-戊基泛酰胺 (N5-pan)等效，而另外两种也具有N-芳香族基团，是为此报道的一些最佳底物酶。这些数据为未来在生产有用的 CoA 类似物时设计 PanK 底物提供了见解。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2014.04.030
• 作为产物：
  描述：

  calcium (R)-pantothenate 在 D(+)-10-樟脑磺酸 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 3-((4R)-2-(4-methoxyphenyl)-5,5-dimethyl-1,3-dioxane-4-carboxamido)propanoic acid
  参考文献：
  名称：

  比例荧光探针成像活细胞中的泛肽酶

  摘要：

  泛酸酶催化泛酸裂解为泛酸（维生素B5）和半胱胺，参与氧化应激的调节，泛酸的循环利用和细胞迁移。然而，由于缺乏合适的荧光成像探针，进一步阐明该酶的细胞功能受到很大限制。通过将泛酸与甲酚紫结合，在此我们开发了一种新的荧光探针CV-PA用于泛酶的测定。该探头不仅具有较长的分析波长，而且还显示线性比例（I 628/582 nm）对泛酶的荧光反应，范围为5–400 ng / mL，检出限为4.7 ng / mL。该探针已用于评估不同抑制剂的效率并定量检测血清样品中的泛酸酶，表明胎牛血清和新生小牛血清中的泛酸酶比正常人血清中的泛酸酶高得多。值得注意的是，使用该探针首次实现了在不同活细胞（LO2和HK-2）中泛酶的比例成像和原位定量比较。已经发现，LO2细胞中泛酶的水平比HK-2细胞中泛酶的水平大得多，如通过蛋白质印迹分析进一步证实的。提出的探针可能有助于更好地了解泛素酶在与泛素相关的病理生理过程中的特定功能。

  DOI：

  10.1021/acs.analchem.7b03303

文献信息

• [EN] PANTETHENOYLCYSTEINE DERIVATIVES AND USES THEREOF<br/>[FR] DÉRIVÉS DE PANTÉTHÉNOYLCYSTÉINE ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：COMET THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2020198573A1

  公开（公告）日：2020-10-01

  The present disclosure relates to compounds of Formula (I) or (II): (Formulae (I), (II)), and pharmaceutically acceptable salts or solvates thereof. The present disclosure also relates to pharmaceutical compositions comprising the compounds and therapeutic and diagnostic uses of the compounds and pharmaceutical compositions.

  本公开涉及式(I)或(II)的化合物：(式(I)，(II))，以及其药用可接受的盐或溶剂化合物。本公开还涉及包含这些化合物的药物组合物，以及这些化合物和药物组合物的治疗和诊断用途。
• Synthesis and Evaluation of Bioorthogonal Pantetheine Analogues for in Vivo Protein Modification
  作者：Jordan L. Meier、Andrew C. Mercer、Heriberto Rivera、Michael D. Burkart

  DOI：10.1021/ja063217n

  日期：2006.9.1

  target for the site-specific modification of fusion systems and new approaches to natural product proteomics. A detailed study of pantetheine analogues was performed in order to identify suitable partners for covalent protein labeling inside living cells. A rapid synthesis of pantothenamide analogues was developed and used to produce a panel which was evaluated for in vitro and in vivo protein labeling

  体内载体蛋白标记最近已成为融合系统的位点特异性修饰和天然产物蛋白质组学新方法的一个有吸引力的目标。对泛酰巯基乙胺类似物进行了详细研究，以确定活细胞内共价蛋白标记的合适伙伴。开发了泛酰胺类似物的快速合成，并用于生产用于体外和体内蛋白质标记评估的面板。动力学比较允许构建结构-活性关系，以查明载体蛋白标记选择的接头、染料和生物正交报告基因。最后，生物正交泛酰巯基乙胺类似物在体内以高特异性靶向载体蛋白，并在粗细胞裂解物中与报告分子进行化学选择性连接。
• Stereospecific Synthesis of <i>threo</i>- and <i>erythro</i>-β-Hydroxyglutamic Acid During Kutzneride Biosynthesis
  作者：Matthias Strieker、Elizabeth M. Nolan、Christopher T. Walsh、Mohamed A. Marahiel

  DOI：10.1021/ja9054417

  日期：2009.9.23

  D-3-hydroxyglutamic acid, which is found in the threo and erythro isomers in mature kutznerides. In this study, two putative nonheme iron oxygenase enzymes, KtzO and KtzP, were recombinantly expressed, characterized biochemically in vitro, and found to stereospecifically hydroxylate the beta-position of glutamic acid. KtzO generates threo-L-hydroxyglutamic acid and KtzP catalyzes the formation of the erythro-isomer

  抗真菌和抗微生物 kutznerides，由一种 α-羟基酸和五种非蛋白质氨基酸组成的六肽，是在非核糖体生产的天然产物中发现的结构多样性的显着例子。它们含有 D-3-羟基谷氨酸，它存在于成熟库兹奈德的苏式和赤式异构体中。在这项研究中，两种假定的非血红素铁加氧酶 KtzO 和 KtzP 被重组表达，在体外进行生化表征，并发现可以立体特异性地将谷氨酸的 β 位羟基化。KtzO 生成苏-L-羟基谷氨酸，KtzP 催化与非核糖体肽合成酶 KtzH 的第三个模块的肽基载体蛋白结合的赤型异构体的形成。该模块具有截短的腺苷酸化结构域，无法激活和整合谷氨酸。在第三个 KtzH 模块中缺乏功能性腺苷酸化结构域由独立的腺苷酸化结构域 KtzN 反式补偿，KtzN 在截短的腺苷酸化结构域和 KtzO 或 KtzP 存在的情况下激活谷氨酸并将其转移到 KtzH 的载体上。开发了一种使用不可水解辅酶 A 类似物的方法，用于确定
• Small Molecule Restores Itaconate Sensitivity in<i>Salmonella enterica</i>: A Potential New Approach to Treating Bacterial Infections
  作者：Fabien Hammerer、Justin H. Chang、Dustin Duncan、Angel Castañeda Ruiz、Karine Auclair

  DOI：10.1002/cbic.201600078

  日期：2016.8.17

  Become more sensitive: Although new antibiotics and resistance inhibitors provide temporary solutions to resistance, they are bound to become obsolete. In this work, we propose a new approach, coined bacterio‐modulation. It does not directly kill bacteria, and therefore minimally selects for resistant strains, but renders them more susceptible to macrophages' defenses.

  变得更加敏感：尽管新的抗生素和抗药性抑制剂为抗药性提供了临时解决方案，但它们势必会过时。在这项工作中，我们提出了一种新的方法，即造币细菌调节。它不会直接杀死细菌，因此很少选择抗性菌株，但使它们更容易受到巨噬细胞防御的影响。
• Visualizing the Chain-Flipping Mechanism in Fatty-Acid Biosynthesis
  作者：Joris Beld、Hu Cang、Michael D. Burkart

  DOI：10.1002/anie.201408576

  日期：2014.12.22

  within its hydrophobic core, but this dynamic mechanism remains poorly understood. We exploited solvatochromic pantetheine probes attached to ACP that fluoresce when sequestered. The addition of a catalytic partner lures the cargo out of the ACP and into the active site of the enzyme, thus enhancing fluorescence to reveal the elusive chain‐flipping mechanism. This activity was confirmed by the use of

  脂肪酸合酶的酰基载体蛋白（ACP）在其疏水性核心内螯合了延长产物，但这种动力学机制仍知之甚少。我们利用了附着在ACP上的溶剂化变色泛肽探针，该探针在被隔离时会发出荧光。催化伴侣的加入将货物引诱出ACP并进入酶的活性位点，从而增强了荧光从而揭示了难以捉摸的链翻转机制。通过使用双溶剂变色交联探针和溶液相NMR光谱证实了这种活性。通过单分子荧光技术可以观察到链翻转机制，从而证明了大肠杆菌ACP及其酮酰基合酶催化伙伴KASII之间的特异性。