Bis(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 4,4'-(carbonylbis(azanediyl))dibutanoate | 1240387-33-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Bis(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 4,4'-(carbonylbis(azanediyl))dibutanoate
• 英文别名: (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 4-[[4-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-4-oxobutyl]carbamoylamino]butanoate
• CAS: 1240387-33-0
• 化学式: C₁₇H₂₂N₄O₉
• 分子量: 426.383
• InChiKey: XZSQCCZQFXUQCY-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.47±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.59
• 拓扑面积：
  169
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

安全信息

• WGK Germany：
  3

制备方法与用途

描述：脲基-4,4′-二丁酸双(羟基琥珀酰亚胺)酯，又称DSBU或BuUrBU，是MS可切割尿素基赖氨酸-赖氨酸反应性同双功能交联剂中最长的版本，具有C4臂。在中性和轻微碱性pH条件下，它不可逆地将邻近的赖氨酸残基连接起来。其对称性的脲基部分容易发生碰撞诱导裂解，这使得在串联CID-MS实验中能够明确区分交联点。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Bis(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 4,4'-(carbonylbis(azanediyl))dibutanoate 、 gonadotropin releasing hormone 在 三(2-羰基乙基)磷盐酸盐 、 sodium chloride 作用下， 以 水 、 二甲基亚砜 、 甘油 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  用于蛋白质结构分析的通用基质辅助激光解吸/电离可裂解交联剂。

  摘要：

  蛋白质交联与质谱联用的概念具有很大的希望，可以得出有关蛋白质构象和蛋白质-蛋白质相互作用的结构信息。我们最近提出了一种解离性胺反应性交联剂（NHS-BuUrBu-NHS），本文证明该方法普遍适用于基质辅助激光解吸/电离串联质谱（MALDI-MS / MS）条件下的蛋白质结构分析，基于肽物质P，促黄体激素释放激素（LHRH）和过氧化物酶体增殖物激活受体α（PPARα）的32 kDa配体结合域的实例。交联剂的特征性碎片离子图谱和恒定的中性损失极大地简化了从复杂混合物中识别不同交联物种的过程，并大大降低了识别假阳性交联的可能性。因此，该交联剂具有以高度自动化的方式获得蛋白质和蛋白质复合物的结构信息的巨大潜力。

  DOI：

  10.1002/rcm.4812

文献信息

• CN115872950
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• A universal matrix-assisted laser desorption/ionization cleavable cross-linker for protein structure analysis
  作者：Mathias Q. Müller、Johannes J. Zeiser、Frank Dreiocker、Andreas Pich、Mathias Schäfer、Andrea Sinz

  DOI：10.1002/rcm.4812

  日期：2011.1.15

  concept of protein cross-linking in combination with mass spectrometry holds great promise to derive structural information on protein conformation and protein-protein interactions. We recently presented a dissociative amine-reactive cross-linker (NHS-BuUrBu-NHS) that is shown herein to be universally applicable to protein structure analysis under matrix-assisted laser desorption/ionization tandem mass

  蛋白质交联与质谱联用的概念具有很大的希望，可以得出有关蛋白质构象和蛋白质-蛋白质相互作用的结构信息。我们最近提出了一种解离性胺反应性交联剂（NHS-BuUrBu-NHS），本文证明该方法普遍适用于基质辅助激光解吸/电离串联质谱（MALDI-MS / MS）条件下的蛋白质结构分析，基于肽物质P，促黄体激素释放激素（LHRH）和过氧化物酶体增殖物激活受体α（PPARα）的32 kDa配体结合域的实例。交联剂的特征性碎片离子图谱和恒定的中性损失极大地简化了从复杂混合物中识别不同交联物种的过程，并大大降低了识别假阳性交联的可能性。因此，该交联剂具有以高度自动化的方式获得蛋白质和蛋白质复合物的结构信息的巨大潜力。