5’-deoxy-2’,3’-O-isopropylidene-5’-thioladenosine | 32077-93-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: 5’-deoxy-2’,3’-O-isopropylidene-5’-thioladenosine
• 英文别名: O^2'_,O3'-isopropylidene-5'-thio-adenosine；O^2'_,O3'-Isopropyliden-5'-thio-adenosin；((3aS,4S,6R,6aR)-6-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2 dimethyltetrahydro furo[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)methanethiol；((3aS,4S,6R,6aR)-6-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2 dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)methanethiol；[(3aR,4R,6S,6aS)-4-(6-aminopurin-9-yl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]methanethiol
• CAS: 32077-93-3
• 化学式: C₁₃H₁₇N₅O₃S
• 分子量: 323.376
• InChiKey: CMHYUYXTEHEZCL-WOUKDFQISA-N

物化性质

• 熔点：
  186-189 °C
• 沸点：
  568.1±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.78±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.1
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  98.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5’-deoxy-2’,3’-O-isopropylidene-5’-thioladenosine 在 盐酸 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N-[3-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methylsulfanyl]propyl]benzamide
  参考文献：
  名称：

  组蛋白甲基转移酶DOT1L含腺苷抑制剂的合成及构效关系研究

  摘要：

  组蛋白 3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 已被发现是具有 MLL（混合谱系白血病）基因易位的急性白血病的药物靶点。总共设计和合成了 55 种含腺苷的化合物，其中鉴定了几种有效的 DOT1L 抑制剂，K i值低至 0.5 nM。与其他三种组蛋白甲基转移酶相比，这些化合物还显示出高选择性（> 4500 倍）。讨论了这些化合物对 DOT1L 的抑制活性的构效关系 (SAR)。强效 DOT1L 抑制剂对 MLL 易位白血病细胞系 MV4;11 和 THP1 的增殖具有选择性活性，EC 504–11 μM 的值。等温滴定量热研究表明，两种代表性抑制剂以高亲和力与 DOT1L:核小体复合物结合，仅与酶辅因子 SAM（S-腺苷-1-甲硫氨酸）竞争，而不与底物核小体竞争。

  DOI：

  10.1021/jm300917h
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-异丙叉腺苷 在 偶氮二甲酸二异丙酯 、 sodium methylate 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 2.08h， 生成 5’-deoxy-2’,3’-O-isopropylidene-5’-thioladenosine
  参考文献：
  名称：

  组蛋白甲基转移酶DOT1L含腺苷抑制剂的合成及构效关系研究

  摘要：

  组蛋白 3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 已被发现是具有 MLL（混合谱系白血病）基因易位的急性白血病的药物靶点。总共设计和合成了 55 种含腺苷的化合物，其中鉴定了几种有效的 DOT1L 抑制剂，K i值低至 0.5 nM。与其他三种组蛋白甲基转移酶相比，这些化合物还显示出高选择性（> 4500 倍）。讨论了这些化合物对 DOT1L 的抑制活性的构效关系 (SAR)。强效 DOT1L 抑制剂对 MLL 易位白血病细胞系 MV4;11 和 THP1 的增殖具有选择性活性，EC 504–11 μM 的值。等温滴定量热研究表明，两种代表性抑制剂以高亲和力与 DOT1L:核小体复合物结合，仅与酶辅因子 SAM（S-腺苷-1-甲硫氨酸）竞争，而不与底物核小体竞争。

  DOI：

  10.1021/jm300917h

文献信息

• Inactivation of S-Adenosyl-l-Homocysteine hydrolase with novel 5′-thioadenosine derivatives. Antiviral effects
  作者：Georges Guillerm、Danielle Guillerm、Corinne Vandenplas-Vitkowski、Cédric Glapski、Erick De Clercq

  DOI：10.1016/s0960-894x(03)00279-8

  日期：2003.5

  Synthesis of 5'-S-vinyl-5'-thioadenosine 5, 5'-S-ethynyl-5'-thioadenosine 7 and 5'-S-cyano-5'-thioadenosine 9 is described. Incubation of AdoHcy hydrolase with 5, 7 and 9 resulted in time- and concentration-dependent inactivation of the enzyme and partial depletion of its NAD(+) content. From these results and characterisation of metabolites released during the inactivation process, hypothetical mechanisms

  描述了5'-S-乙烯基-5'-硫代腺苷5、5'-S-乙炔基-5'-硫代腺苷7和5'-S-氰基-5'-硫代腺苷9的合成。用5、7和9孵育AdoHcy水解酶会导致该酶的时间和浓度依赖性失活以及其NAD（+）含量的部分消耗。从这些结果和灭活过程中释放的代谢产物的特征，提出了推测的机制。检查了5、7和9的抗病毒活性。注意到有5种针对牛痘，胡宁和牛痘病毒的显着活性。
• Modulators of Histone Methyltransferase, and Methods of Use Thereof
  申请人：Epizyme, Inc.

  公开号：US20160068559A1

  公开（公告）日：2016-03-10

  Disclosed are compounds, pharmaceutical compositions containing the compounds, and the uses of the compounds and compositions as modulators of histone methyltransferases, and for treating diseases influenced by modulation of histone methyltransferase activity.

  本发明涉及一种化合物、含有该化合物的药物组合物，以及将该化合物和组合物用作组蛋白甲基转移酶调节剂，以及治疗受组蛋白甲基转移酶活性调节影响的疾病的用途。
• [EN] MODULATORS OF HISTONE METHYLTRANSFERASE, AND METHODS OF USE THEREOF<br/>[FR] MODULATEURS D'HISTONE MÉTHYLTRANSFÉRASE ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：EPIZYME INC

  公开号：WO2012082436A3

  公开（公告）日：2012-09-20
• 5′-(N-aminoacyl)-sulfonamido-5′-deoxyadenosine: Attempts for a stable alternative for aminoacyl-sulfamoyl adenosines as aaRS inhibitors
  作者：Bharat Gadakh、Simon Smaers、Jef Rozenski、Mathy Froeyen、Arthur Van Aerschot

  DOI：10.1016/j.ejmech.2015.02.010

  日期：2015.3

  Synthesis of aminoacyl-sulfamoyl adenosines (aaSAs) and their peptidyl conjugates as aminoacyl tRNA synthetase (aaRS) inhibitors remains problematic due to the low yield of the aminoacylation and the subsequent conjugation reaction causing concomitant formation of a cyclic adenosine derivative. In an effort to reduce this undesirable side reaction, we aimed to prepare the corresponding aminoacyl sulfonamide (aaSoA) analogues as more stable alternatives for aaSA derivatives. Deletion of the 5'-oxygen in aaSA analogues should render the C-5' less electrophilic and therefore improve the stability of the aminoacyl sulfamate analogues. We therefore synthesized six sulfonamides and compared their activity against the respective aaSA analogues. However, except for the aspartyl derivative, the new compounds are not able to inhibit the corresponding aaRS. Possible reasons for this loss of activity are discussed by modeling and comparison of the newly synthesized aaSoA derivatives with their parent aaSA analogues. (C) 2015 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.
• Synthesis of S-(5′-deoxyadenosine-5′)-homocysteine, a product from enzymic methylations involving “active methionine”
  作者：J. Baddiley、G. A. Jamieson

  DOI：10.1039/jr9550001085

  日期：——