N-(3-(prop-2-yn-1-yloxy)propyl)trifluoroacetamide | 1099527-75-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-(3-(prop-2-yn-1-yloxy)propyl)trifluoroacetamide
• 英文别名: 2,2,2-trifluoro-N-(3-prop-2-ynoxypropyl)acetamide
• CAS: 1099527-75-9
• 化学式: C₈H₁₀F₃NO₂
• 分子量: 209.168
• InChiKey: OYYSYSXPVVKLRS-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  38.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(3-(prop-2-yn-1-yloxy)propyl)trifluoroacetamide 在 水 、 sodium hydroxide 作用下， 反应 2.0h， 以58%的产率得到3-(prop-2-ynyloxy)propylamine
  参考文献：
  名称：

  新型核苷5'-三磷酸和含炔或氨基的亚磷酰胺的合成，用于核酸的后合成功能

  摘要：

  设计并合成了一系列新的含有炔或氨基的核苷5'-三磷酸和亚磷酰胺，用于核酸的后合成功能。为此，使用了新的3-氨基丙氧基丙炔基连接基团。它包含两种替代功能：用于氨基-炔基修饰的寡核苷酸与相应的活化酯反应的氨基和用于铜（I）催化的叠氮化物-炔烃环加成（CuAAC）反应的炔基。结果表明，可以使用多种连接新接头的方法来合成各种修饰的嘧啶核苷。

  DOI：

  10.1080/15257770.2011.595379
• 作为产物：
  描述：

  3-(2-丙炔-1-氧基)-1-丙醇 在 氯化亚砜 、 caesium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 168.0h， 生成 N-(3-(prop-2-yn-1-yloxy)propyl)trifluoroacetamide
  参考文献：
  名称：

  新型核苷5'-三磷酸和含炔或氨基的亚磷酰胺的合成，用于核酸的后合成功能

  摘要：

  设计并合成了一系列新的含有炔或氨基的核苷5'-三磷酸和亚磷酰胺，用于核酸的后合成功能。为此，使用了新的3-氨基丙氧基丙炔基连接基团。它包含两种替代功能：用于氨基-炔基修饰的寡核苷酸与相应的活化酯反应的氨基和用于铜（I）催化的叠氮化物-炔烃环加成（CuAAC）反应的炔基。结果表明，可以使用多种连接新接头的方法来合成各种修饰的嘧啶核苷。

  DOI：

  10.1080/15257770.2011.595379

文献信息

• Nucleotide Compounds including a rigid linker
  申请人：Applied Biosystems, LLC

  公开号：EP2202238A1

  公开（公告）日：2010-06-30

  A nucleoside/tide compound having the structure: NUC-L-S-LB/LG, is described wherein NUC is a nucleoside/tide having a nucleobase portion B, L is a rigid linkage, S is a spacer; and LB/LG is a member of a linkage pair or a label. NUC is attached to L through B such that when B is a purine, L is attached to the 8-position of the purine, when B is 7-deazapurine, L is attached to the 7-position of the 7-deazapurine, and when B is pyrimidine, L is attached to the 5-position of the pyrimidine. In an important aspect of the invention, L has the structure (a) wherein each of n, o and p are integers ranging from 0 to 3, and the sum of n, o and p is at least 2, and each of W, X, Y and Z is selected from the group consisting of carbon and nitrogen. The invention further includes polynucleotide compounds comprising the nucleoside/tide, and primer extension methods utilizing the nucleoside/tide, particularly when used in combination with certain mutant polymerase enzymes.

  描述了一种具有以下结构的核苷/苷酸化合物：NUC-L-S-LB/LG：其中 NUC 是具有核碱基部分 B 的核苷/苷酸，L 是刚性连接，S 是间隔物；LB/LG 是连接对的成员或标签。NUC 通过 B 连接到 L 上，当 B 是嘌呤时，L 连接到嘌呤的 8 位；当 B 是 7-脱氮嘌呤时，L 连接到 7-脱氮嘌呤的 7 位；当 B 是嘧啶时，L 连接到嘧啶的 5 位。在本发明的一个重要方面，L 具有结构（a），其中 n、o 和 p 各为 0 至 3 的整数，且 n、o 和 p 之和至少为 2，W、X、Y 和 Z 各选自碳和氮组成的组。本发明还包括包含该核苷/苷的多核苷酸化合物，以及利用该核苷/苷的引物延伸方法，特别是与某些突变聚合酶结合使用时。
• NUCLEOTIDE COMPOUNDS INCLUDING A RIGID LINKER
  申请人：Applied Biosystems, LLC

  公开号：EP1121371B1

  公开（公告）日：2009-05-27