Effect of substitution of photo-cross-linker in photochemical cytosine to uracil transition in DNA
作者:Siddhant Sethi、Yasuharu Takashima、Shigetaka Nakamura、Kenzo Fujimoto
DOI:10.1016/j.bmcl.2017.06.042
日期:2017.8
enzymatic and chemical methods for genome editing is their limited applicability for in vivo studies. In addition, non-enzymatic methods, such as photochemical DNA editing using 3-cyanovinylcarbazole (CNVK), require high temperatures to affect cytosine to uracil transformations. To overcome this limitation, we developed new photo-cross-linkers based on CNVK, 3-methoxycarbonlycarbazole, 3-carboxyvinylcarbazole
基因组编辑是蛋白质工程,遗传疾病治疗和非天然蛋白质生产的重要技术。当前用于基因组编辑的酶和化学方法的缺点是它们在体内研究中的适用性有限。另外,非酶促方法,例如使用3-氰基乙烯基咔唑(CNV K)进行光化学DNA编辑,需要高温才能影响胞嘧啶向尿嘧啶的转化。为克服此限制,我们开发了基于CNV K,3-甲氧基碳咔唑,3-羧基乙烯基咔唑和3-羰基酰胺乙烯基咔唑的新型光交联剂。与使用CNV相比,使用3-羧基乙烯基咔唑导致脱氨反应的加速更大K.影响超快光响应性核苷加速脱氨反应能力的最可能因素是含有光交联剂的寡脱氧核糖核苷酸的极性和亲水性。