5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2'-O-[2-[(2,3-dihydro-1,3-dioxo-1H-isoindol-2-yl)oxy]ethyl]-5-methyluridine | 212061-25-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2'-O-[2-[(2,3-dihydro-1,3-dioxo-1H-isoindol-2-yl)oxy]ethyl]-5-methyluridine
• 英文别名: 5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2'-O-[2-[(1,3-dihydro-1,3-dioxo-2H-isoindol-2-yl)oxy]ethyl]-5-methyluridine；2'-O-[2-(phthalimidoxy)ethyl]-5'-t-butyldiphenylsilyl-5-methyluridine；2'-O-[(2-phthalimidoxy)ethyl]-5'-tert-butyldiphenylsilyl-5-methyluridine；2'-O-[2-(2-phthalimidoxy)ethyl]-5'-tert-butyldiphenylsilyl-5-methyluridine；2'-O-[2-(2-phthalimidoxy)ethyl]-5'-t-butyldiphenylsilyl-5-methyluridine；2'-O-([2-phthalimidoxy]ethyl)-5'-O-tert-butyldiphenylsilyl-5-methyluridine；2'-O-[(2-phthalimidoxy)ethyl]-5'-O-t-butyldiphenylsilyl-5-methyluridine；2'-O-[(2-phthalimidoxy)ethyl]-51-t-butyldiphenylsilyl-5-methyluridine；2-[2-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-4-hydroxy-2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxyethoxy]isoindole-1,3-dione
• CAS: 212061-25-1
• 化学式: C₃₆H₃₉N₃O₉Si
• 分子量: 685.806
• InChiKey: YDCMWTAYCLVFHY-XWJIURCXSA-N

物化性质

• 密度：
  1.36±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.29
• 重原子数：
  49
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  144
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2'-O-[2-[(2,3-dihydro-1,3-dioxo-1H-isoindol-2-yl)oxy]ethyl]-5-methyluridine 在 甲基肼 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 2'-O-(aminooxyethyl) thymidine
  参考文献：
  名称：

  Antisense modulation of Notch (Drosophila) homolog 4 expression

  摘要：

  提供了用于调节Notch（果蝇）同源物4表达的反义物质、组合物和方法。这些组合物包括针对编码Notch（果蝇）同源物4的核酸的反义物质，特别是反义寡核苷酸。提供了使用这些化合物调节Notch（果蝇）同源物4表达以及治疗与Notch（果蝇）同源物4表达相关疾病的方法。

  公开号：

  US20040077568A1
• 作为产物：
  描述：

  2,2'-O-脱水-5-甲基尿嘧啶核苷 在 4-二甲氨基吡啶 、 硼烷四氢呋喃络合物 、 碳酸氢钠 、 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 为溶剂， 反应 36.0h， 生成 5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2'-O-[2-[(2,3-dihydro-1,3-dioxo-1H-isoindol-2-yl)oxy]ethyl]-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  2'-O- [2-[（N，N-二甲基氨基）氧基]乙基]修饰的核苷和寡核苷酸的合成。

  摘要：

  已开发出一种通用的合成路线，用于合成2'-O- [2-[（N，N-二甲基氨基）氧基]乙基]（缩写为2'-O-DMAOE）修饰的嘌呤和嘧啶核苷及其相应的核苷亚磷酰胺和固体支持物。为了合成2'-O-DMAOE嘌呤核苷，通过将碳-碳键氧化裂解为相应的醛，从2'-O-烯丙基嘌呤核苷（13a和15）获得关键中间体B（方案1）通过减少。为了合成嘧啶核苷，用乙二醇的硼酸酯打开2,2'-脱水-5-甲基尿苷5，得到了关键的中间体B。将2'-O-（2-羟乙基）核苷进行了高产率的转化，通过区域选择性的Mitsunobu反应，形成相应的2'-O- [2-[（1,3-dihydro-1，3-二氧代-2H-异吲哚-2-基）氧基]乙基]核苷（18、19和20）。随后将这些化合物脱保护并转化为2'-O- [2-[（[亚甲基氨基）氧基]乙基]衍生物（22、23和24）。还原并用甲醛进行第二次还原胺化，得到相应的2'-O-

  DOI：

  10.1021/jo0103975

文献信息

• Nucleoside derivatives as inhibitors of RNA-dependent RNA viral polymerase
  申请人：——

  公开号：US20020147160A1

  公开（公告）日：2002-10-10

  The present invention provides nucleoside compounds and certain derivatives thereof which are inhibitors of RNA-dependent RNA viral polymerase. These compounds are inhibitors of RNA-dependent RNA viral replication and are useful for the treatment of RNA-dependent RNA viral infection. They are particularly useful as inhibitors of hepatitis C virus (HCV) NS5B polymerase, as inhibitors of HCV replication, and/or for the treatment of hepatitis C infection. The invention also describes pharmaceutical compositions containing such nucleoside compounds alone or in combination with other agents active against RNA-dependent RNA viral infection, in particular HCV infection. Also disclosed are methods of inhibiting RNA-dependent RNA polymerase, inhibiting RNA-dependent RNA viral replication, and/or treating RNA-dependent RNA viral infection with the nucleoside compounds of the present invention.

  本发明提供了核苷化合物及其某些衍生物，这些衍生物是RNA依赖性RNA病毒聚合酶的抑制剂。这些化合物是RNA依赖性RNA病毒复制的抑制剂，可用于治疗RNA依赖性RNA病毒感染。它们特别适用于作为丙型肝炎病毒（HCV）NS5B聚合酶的抑制剂，作为HCV复制的抑制剂，以及/或用于治疗丙型肝炎感染。本发明还描述了包含这种核苷化合物的药物组合物，单独使用或与其他对RNA依赖性RNA病毒感染，特别是HCV感染有效的制剂组合使用。还公开了使用本发明的核苷化合物抑制RNA依赖性RNA聚合酶、抑制RNA依赖性RNA病毒复制和/或治疗RNA依赖性RNA病毒感染的方法。
• 2‘-<i>O</i>-{2-[<i>N</i>,<i>N</i>-(Dialkyl)aminooxy]ethyl}- Modified Antisense Oligonucleotides
  作者：Thazha P. Prakash、Muthiah Manoharan、Andrew M. Kawasaki、Elena A. Lesnik、Stephen R. Owens、Guillermo Vasquez

  DOI：10.1021/ol006555g

  日期：2000.12.1

  [structure] Oligonucleotides with two novel modifications, 2'-O-¿2-[N, N-(dimethyl)aminooxy]ethyl¿ (2'-O-DMAOE) and 2'-O-¿2-[N, N-(diethyl)aminooxy]ethyl¿ (2'-O-DEAOE), have been synthesized. These modifications exhibit high binding affinity to target RNA (and not to DNA) and enhance the nuclease stability of oligonucleotides considerably with t(1/2) > 24 h as a phosphodiester.

  [结构]具有两个新颖修饰的寡核苷酸，2'-O-¿2-[N，N-（二甲基）氨基氧基]乙基（2'-O-DMAOE）和2'-O-¿2-[N，N -（二乙基）氨基氧基]乙基（2'-O-DEAOE）已经合成。这些修饰表现出对靶RNA（而不是DNA）的高结合亲和力，并以t（1/2）> 24 h作为磷酸二酯显着增强了寡核苷酸的核酸酶稳定性。
• Antisense modulation of cyclin-dependent kinase 6 expression
  申请人：Isis Pharmaceuticals Inc.

  公开号：US20040087523A1

  公开（公告）日：2004-05-06

  Antisense compounds, compositions and methods are provided for modulating the expression of cyclin-dependent kinase 6. The compositions comprise antisense compounds, particularly antisense oligonucleotides, targeted to nucleic acids encoding cyclin-dependent kinase 6. Methods of using these compounds for modulation of cyclin-dependent kinase 6 expression and for treatment of diseases associated with expression of cyclin-dependent kinase 6 are provided.

  提供了用于调节细胞周期依赖性激酶6表达的反义化合物、组合物和方法。这些组合物包括针对编码细胞周期依赖性激酶6的核酸的反义化合物，特别是反义寡核苷酸。提供了利用这些化合物调节细胞周期依赖性激酶6表达以及治疗与细胞周期依赖性激酶6表达相关的疾病的方法。
• Antisense modulation of PTPN12 expression
  申请人：Isis Pharmaceuticals Inc.

  公开号：US20030232434A1

  公开（公告）日：2003-12-18

  Antisense compounds, compositions and methods are provided for modulating the expression of PTPN12. The compositions comprise antisense compounds, particularly antisense oligonucleotides, targeted to nucleic acids encoding PTPN12. Methods of using these compounds for modulation of PTPN12 expression and for treatment of diseases associated with expression of PTPN12 are provided.

  提供了用于调节PTPN12表达的反义化合物、组合物和方法。这些组合物包括针对编码PTPN12的核酸的反义化合物，特别是反义寡核苷酸。提供了使用这些化合物调节PTPN12表达和治疗与PTPN12表达相关疾病的方法。
• Antisense modulation of histone deacetylase 2 expression
  申请人：Isis Pharmaceuticals Inc.

  公开号：US20030236204A1

  公开（公告）日：2003-12-25

  Antisense compounds, compositions and methods are provided for modulating the expression of histone deacetylase 2. The compositions comprise antisense compounds, particularly antisense oligonucleotides, targeted to nucleic acids encoding histone deacetylase 2. Methods of using these compounds for modulation of histone deacetylase 2 expression and for treatment of diseases associated with expression of histone deacetylase 2 are provided.

  提供了用于调节组蛋白去乙酰化酶2表达的反义物化合物、组合物和方法。这些组合物包括特别针对编码组蛋白去乙酰化酶2的核酸的反义物化合物，特别是反义寡核苷酸。提供了利用这些化合物调节组蛋白去乙酰化酶2表达并治疗与组蛋白去乙酰化酶2表达相关疾病的方法。