3-(3-methyldiaziridin-3-yl)propanoic acid | 1186308-36-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 3-(3-methyldiaziridin-3-yl)propanoic acid
• 英文别名: 3-(3-Methyldiaziridin-3-yl)propanoic acid
• CAS: 1186308-36-0
• 化学式: C₅H₁₀N₂O₂
• 分子量: 130.147
• InChiKey: SDJKXJSGAJFERM-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  243.3±32.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.157±0.06 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.7
• 重原子数：
  9
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.8
• 拓扑面积：
  81.2
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(3-methyldiaziridin-3-yl)propanoic acid 在 4-二甲氨基吡啶 、 四溴化碳 、 4-甲基苯磺酸吡啶 、 三乙胺 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 氯仿 为溶剂， 反应 22.17h， 生成 (2E,6E)-8-bromo-2,6-dimethylocta-2,6-dien-1-yl 3-(3-methyl-3H-diazirin-3-yl)propanoate
  参考文献：
  名称：

  含二氮嗪的光活化类异戊二烯：异戊二烯半胱氨酸羧甲基转移酶的合成与应用

  摘要：

  光亲和标记是一种用于鉴定蛋白质-配体和蛋白质-蛋白质非共价相互作用的有用技术。光标记实验对于探测难以获得结构信息的膜结合蛋白特别有用。最广泛使用的光活性官能团类别包括芳基叠氮化物、重氮羰基、二氮丙啶和二苯甲酮。Diazirines 本质上比二苯甲酮小，并且在光解时产生卡宾，与二苯甲酮衍生的双自由基相比，与更广泛的氨基酸侧链反应；这使得二氮嗪可能成为更通用的光亲和标记剂。在本文中，一个通过固相合成产生α-因子衍生肽。除了 diazirine 部分，荧光素和生物素基团也被掺入到肽中，以帮助检测和富集光交联产物。这种含有二氮嗪的多功能肽是 Ste14p 的底物，Ste14p 是潜在抗癌靶标 Icmt 的酵母同源物，其K m (6.6 μM) 和V max (947 pmol min –1 mg –1 ) 值与a用基于二苯甲酮的类异戊二烯功能化的因子肽。光交联实验表明，二吖丙因探针光交联以Ste1

  DOI：

  10.1021/jo402600b
• 作为产物：
  描述：

  乙酰丙酸 在 氨 、 hydroxylamine-O-sulfonic acid 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 23.0h， 生成 3-(3-methyldiaziridin-3-yl)propanoic acid
  参考文献：
  名称：

  含二氮嗪的光活化类异戊二烯：异戊二烯半胱氨酸羧甲基转移酶的合成与应用

  摘要：

  光亲和标记是一种用于鉴定蛋白质-配体和蛋白质-蛋白质非共价相互作用的有用技术。光标记实验对于探测难以获得结构信息的膜结合蛋白特别有用。最广泛使用的光活性官能团类别包括芳基叠氮化物、重氮羰基、二氮丙啶和二苯甲酮。Diazirines 本质上比二苯甲酮小，并且在光解时产生卡宾，与二苯甲酮衍生的双自由基相比，与更广泛的氨基酸侧链反应；这使得二氮嗪可能成为更通用的光亲和标记剂。在本文中，一个通过固相合成产生α-因子衍生肽。除了 diazirine 部分，荧光素和生物素基团也被掺入到肽中，以帮助检测和富集光交联产物。这种含有二氮嗪的多功能肽是 Ste14p 的底物，Ste14p 是潜在抗癌靶标 Icmt 的酵母同源物，其K m (6.6 μM) 和V max (947 pmol min –1 mg –1 ) 值与a用基于二苯甲酮的类异戊二烯功能化的因子肽。光交联实验表明，二吖丙因探针光交联以Ste1

  DOI：

  10.1021/jo402600b

文献信息

• Base-Mediated One-Pot Synthesis of Aliphatic Diazirines for Photoaffinity Labeling
  作者：Lei Wang、Zetryana Puteri Tachrim、Natsumi Kurokawa、Fumina Ohashi、Yasuko Sakihama、Yasuyuki Hashidoko、Makoto Hashimoto

  DOI：10.3390/molecules22081389

  日期：——

  Aliphatic diazirines have been widely used as prominent photophores for photoaffinity labeling owing to their relatively small size which can reduce the steric effect on the natural interaction between ligands and proteins. Based on our continuous efforts to develop efficient methods for the synthesis of aliphatic diazirines, we present here a comprehensive study about base-mediated one-pot synthesis

  脂肪族二氮嗪由于其相对较小的尺寸可以减少配体和蛋白质之间自然相互作用的空间效应，因此已被广泛用作光亲和标记的主要发光体。基于我们不断努力开发合成脂肪族二氮丙啶的有效方法，我们在这里提出了一项关于碱介导的脂肪族二氮卓一锅合成的综合研究。发现氢氧化钾(KOH)也能有效促进脂肪族二氮嗪的构建。重要的是，与以前使用的碱叔丁醇钾 (t-BuOK) 相比，KOH 更便宜、可用性高且易于处理和储存。克级研究表明，它在用于脂肪族二氮嗪的规模化生产方面具有很大的优势。该协议非常简洁，可以轻松分离和纯化所需的产品。作为对脂肪族二氮丙啶的碱介导的一锅合成的第一次综合研究，这项工作为基于二氮丙啶的光亲和标记探针的制备和利用提供了很好的见解。
• [EN] BIS(DIAZIRINE) DERIVATIVES AS PHOTO-CROSSSLINKER FOR TREATING CORNEAL ECTATIC DISORDERS<br/>[FR] DÉRIVÉS DE BIS(DIAZIRINE) UTILISÉS EN TANT QU'AGENT DE PHOTO-RÉTICULATION POUR LE TRAITEMENT DE TROUBLES ECTASIQUES DE LA CORNÉE
  申请人：AVEDRO INC

  公开号：WO2020154673A1

  公开（公告）日：2020-07-30

  This disclosure features bis(diazirine) derivatives of the formulae (I) (l-a) or (l-b) that generate cross-linking in the cornea in response to exposure to an electromagnetic irradiation (e.g. UV-light). The compounds are useful, e.g. for treating a subject (e.g. a human) having a disease, disorder or condition in which abnormal shaping of the cornea (e.g. thinning of the cornea, e.g. bilateral thinning of the cornea, e.g. bilateral thinning of the central, paracentral, or peripheral cornea, or steepening (e.g., bulging) of the cornea) contributes to the pathology and/or symptoms, and/or progression of the disease, disorder or condition. Examples of such diseases, disorders or conditions include: (i) corneal ectatic disorders; (ii) vision conditions; and (iii) diseases, disorders, or conditions that are sequela or comorbid with any of the foregoing or any disclosed herein. More particular examples of such diseases, disorders or conditions include keratoconus, keratoglobus, pellucid marginal degeneration, corneal ectasia (e.g. postoperative ectasia, e.g. post-LASIK ectasia), Terrien's marginal degeneration, myopia, hyperopia, astigmatism, irregular astigmatism and presbyopia. In some embodiments, the claimed methods can be performed in the absence of added or supplemental oxygen levels, which can be advantageous in some applications. Preferred exemplary compounds are e.g. bis(diazirine) amino acid derivatives, such as e.g. example 1:

  这份披露涉及到式(I) (l-a)或(l-b)的双(重氮基)衍生物，当暴露于电磁辐射（例如紫外光）时，在角膜中产生交联作用。这些化合物可用于治疗患有疾病、疾病或病况的受试者（例如人类），其中角膜的异常形态（例如角膜变薄，例如角膜双侧变薄，例如角膜中央、副中央或周边变薄，或角膜变陡（例如突出））导致病理和/或症状的发生，以及/或疾病、疾病或病况的进展。此类疾病、疾病或病况的示例包括：(i) 角膜扩张性疾病；(ii) 视力状况；以及(iii) 与前述任何疾病、疾病或病况或本文所披露的任何内容相关的后遗症或共病。此类疾病、疾病或病况的更具体示例包括角膜锥状变性、角膜球状变性、边缘淡化变性、角膜扩张（例如术后扩张，例如术后LASIK扩张）、Terrien边缘变性、近视、远视、散光、不规则散光和老视。在某些实施例中，声称的方法可以在没有额外或补充氧气水平的情况下进行，这在某些应用中可能是有利的。优选的示例化合物包括双(重氮基)氨基酸衍生物，例如示例1：
• Identification of Pyruvate Carboxylase as the Cellular Target of Natural Bibenzyls with Potent Anticancer Activity against Hepatocellular Carcinoma via Metabolic Reprogramming
  作者：Yuwen Sheng、Yuwen Chen、Zhongqiu Zeng、Wenbi Wu、Jing Wang、Yuling Ma、Yuan Lin、Jichao Zhang、Yulan Huang、Wenhua Li、Qiyu Zhu、Xiao Wei、Suiyan Li、Wisanee Wisanwattana、Fu Li、Wanli Liu、Apichart Suksamrarn、Guolin Zhang、Wei Jiao、Fei Wang

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c01605

  日期：2022.1.13

  hepatocellular carcinoma (HCC). Erianin modulated cancer-related gene expression and induced changes in metabolic intermediates. Moreover, erianin promotes mitochondrial oxidative stress and inhibits glycolysis, leading to insufficient energy required for cell proliferation. Analysis of 14 natural analogs of erianin showed that some compounds exhibited potent inhibitory effects on PC. These results suggest that

  一些器官中的癌细胞增殖通常依赖于丙酮酸通过丙酮酸羧化酶 (PC) 转化为草酰乙酸，以补充三羧酸循环以支持生物质生产。在这项研究中，使用基于光亲和标记-点击化学的探针策略将 PC 鉴定为毛兰素的细胞靶标。Erianin 有效抑制 PC 的酶活性，从而介导 erinin 在人肝细胞癌 (HCC) 中的抗癌作用。Erianin 调节癌症相关基因的表达并诱导代谢中间体的变化。此外，毛兰素促进线粒体氧化应激并抑制糖酵解，导致细胞增殖所需的能量不足。对 14 种毛兰素天然类似物的分析表明，一些化合物对 PC 表现出有效的抑制作用。这些结果表明 PC 是 erinin 的细胞靶点，并揭示了 PC 在 HCC 肿瘤发生中未被识别的功能；毛兰素及其类似物需要进一步开发作为治疗 HCC 的新治疗策略。
• Synthesis, Enzymatic Peptide Incorporation, and Applications of Diazirine-Containing Isoprenoid Diphosphate Analogues
  作者：Katarzyna Justyna、Riki Das、Ellen L. Lorimer、Jiayue Hu、Jodi S. Pedersen、Andrea M. Sprague-Getsy、Garrett L. Schey、Michelle A. Sieburg、Olivia J. Koehn、Yen-Chih Wang、Yong-Xiang Chen、James L. Hougland、Carol L. Williams、Mark D. Distefano

  DOI：10.1021/acs.orglett.3c02736

  日期：2023.9.15

  near their C-termini. Here we describe the preparation of isoprenoid diphosphate analogues incorporating diazirine groups that can be used to probe interactions between prenylated proteins and other proteins that interact with them. Studies using synthetic peptides and whole proteins demonstrate that these diazirine analogues are efficient substrates for prenyltransferases. Photo-cross-linking experiments

  异戊二烯化蛋白质含有与其 C 末端附近的半胱氨酸残基相连的 C 15或 C 20 类异戊二烯。在这里，我们描述了掺入二氮丙啶基团的类异戊二烯二磷酸类似物的制备，该类似物可用于探测异戊二烯化蛋白质和与其相互作用的其他蛋白质之间的相互作用。使用合成肽和完整蛋白质的研究表明，这些二氮丙啶类似物是异戊二烯基转移酶的有效底物。使用掺有二氮丙啶功能化类异戊二烯的肽进行光交联实验，选择性地与几种不同的蛋白质交联。这些新的类异戊二烯类似物应该广泛用于蛋白质异戊二烯化的研究。
• Diazirine-Containing Photoactivatable Isoprenoid: Synthesis and Application in Studies with Isoprenylcysteine Carboxyl Methyltransferase
  作者：Jeffrey S. Vervacke、Amy L. Funk、Yen-Chih Wang、Mark Strom、Christine A. Hrycyna、Mark D. Distefano

  DOI：10.1021/jo402600b

  日期：2014.3.7

  benzophenone-derived diradical; this makes diazirines potentially more general photoaffinity-labeling agents. In this article, we describe the development and application of a new isoprenoid analogue containing a diazirine moiety that was prepared in six steps and incorporated into an a-factor-derived peptide produced via solid-phase synthesis. In addition to the diazirine moiety, fluorescein and biotin groups

  光亲和标记是一种用于鉴定蛋白质-配体和蛋白质-蛋白质非共价相互作用的有用技术。光标记实验对于探测难以获得结构信息的膜结合蛋白特别有用。最广泛使用的光活性官能团类别包括芳基叠氮化物、重氮羰基、二氮丙啶和二苯甲酮。Diazirines 本质上比二苯甲酮小，并且在光解时产生卡宾，与二苯甲酮衍生的双自由基相比，与更广泛的氨基酸侧链反应；这使得二氮嗪可能成为更通用的光亲和标记剂。在本文中，一个通过固相合成产生α-因子衍生肽。除了 diazirine 部分，荧光素和生物素基团也被掺入到肽中，以帮助检测和富集光交联产物。这种含有二氮嗪的多功能肽是 Ste14p 的底物，Ste14p 是潜在抗癌靶标 Icmt 的酵母同源物，其K m (6.6 μM) 和V max (947 pmol min –1 mg –1 ) 值与a用基于二苯甲酮的类异戊二烯功能化的因子肽。光交联实验表明，二吖丙因探针光交联以Ste1