2',3'-O-bis-(tert-butyldimethylsilyl)cytidine | 72409-47-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2',3'-O-bis-(tert-butyldimethylsilyl)cytidine
• 英文别名: 2',3'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)cytidine；O^2'_,O3'-bis-(tert-butyl-dimethyl-silanyl)-cytidine；4-amino-1-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 72409-47-3
• 化学式: C₂₁H₄₁N₃O₅Si₂
• 分子量: 471.745
• InChiKey: BUXPAKUSVYSXKP-VDHUWJSZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2',3'-O-bis-(tert-butyldimethylsilyl)cytidine 在 吡啶 、 1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 二甲基亚砜 、 甲苯 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 N-[1-[(2R,3R,4R,5S)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-formyloxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]acetamide
  参考文献：
  名称：

  胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷的5'-羟基-5'-膦酸酯衍生物的立体选择性合成。

  摘要：

  胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷（ara-C）的（R）-和（S）-5'-羟基5'-膦酸酯衍生物均通过亚磷酸酯加成或路易斯酸介导的适当保护的5'-核苷醛进行氢膦酰化而制得。亚磷酸酯被添加到作为2'，3'-丙酮化物保护的胞嘧啶醛中，主要生成5'R异构体，而亚磷酸酯添加到相应的2'，3'-bis TBS衍生物则有利于5'S立体化学。相反，亚磷酸酯加到由ara-C衍生的2'，3'-双TBS保护的醛中仅得到5'R加合物。但是，相同的ara-C醛的TiCl（4）介导的氢膦酰化作用以2：1的比例有利于5'S立体异构体。一旦所有四个非对映异构体都存在，这些化合物的立体化学可根据其光谱数据或从其O-甲基扁桃酸酯衍生物获得。在膦酸酯和各种保护基水解后，测试了四种α-羟基膦酸作为核苷单磷酸激酶底物的能力以及对K562细胞的毒性。

  DOI：

  10.1021/jo020483k
• 作为产物：
  描述：

  胞苷 在 咪唑 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 2',3'-O-bis-(tert-butyldimethylsilyl)cytidine
  参考文献：
  名称：

  嘧啶取代的氨基酰基-氨磺酰基酰基核苷作为靶向I类氨基酰基-tRNA合成酶的潜在抑制剂的比较分析

  摘要：

  氨酰基-tRNA合成酶（aaRSs）催化氨基酸与其同源tRNA的ATP依赖性偶联。aaRSs对于蛋白质翻译至关重要，被认为是开发新型抗菌剂的有希望的目标。5'- O-（N-氨基酰基）-氨磺酰基腺苷（aaSA）是aaRS反应中间体的不可水解类似物，已显示是该酶家族的有效抑制剂，但易于化学不稳定和酶促修饰。为了改善该支架的分子性质，我们合成了一系列碱基取代的aaSA类似物，其包括靶向胞嘧啶，酪氨酰基和异亮氨酰-tRNA合成酶的胞嘧啶，尿嘧啶和N 3-甲基尿嘧啶。在体外九种抑制剂中的七种检测结果表明K i app值在低纳摩尔范围内。为了补充生物化学研究，淋病奈瑟氏球菌亮氨酰tRNA合成酶和大肠杆菌的X射线晶体学结构测定了与新合成的化合物复合的酪氨酰-tRNA合成酶。这些突显了在限定相对抑制活性中碱基部分和靶酶之间的微妙相互作用。受此数据的鼓励，我们研究了嘧啶同源物是否可以逃避天然抗性机制，涉及通

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.04.003

文献信息

• Base substituted 5′-O-(N-isoleucyl)sulfamoyl nucleoside analogues as potential antibacterial agents
  作者：Bharat Gadakh、Gaston Vondenhoff、Eveline Lescrinier、Jef Rozenski、Mathy Froeyen、Arthur Van Aerschot

  DOI：10.1016/j.bmc.2014.03.040

  日期：2014.5

  and evaluated several isoleucyl-sulfamoyl nucleoside analogues with either uracil, cytosine, hypoxanthine, guanine, 1,3-dideaza-adenine (benzimidazole) or 4-nitro-benzimidazole as the heterocyclic base. Based on the structure and antibacterial activity of microcin C, we also prepared their hexapeptidyl conjugates in an effort to improve their uptake potential. We further compared their antibacterial

  氨基酰基氨磺酰基腺苷是体外相应的原核和真核tRNA合成酶的众所周知的纳摩尔抑制剂。受Cubist Pharmaceuticals含芳基四唑的化合物和天然抗生素albomycin中发现的修饰碱基的启发，氨磺酰化腺苷的选择性问题促使我们研究腺嘌呤碱基在药理上的重要性。因此，我们合成并评估了几种异亮氨酰氨磺酰基核苷类似物，它们具有尿嘧啶，胞嘧啶，次黄嘌呤，鸟嘌呤，1，3-二氮杂腺嘌呤（苯并咪唑）或4-硝基苯并咪唑作为杂环碱基。基于微霉素C的结构和抗菌活性，我们还制备了它们的六肽基缀合物，以提高它们的吸收潜力。我们进一步在体外和细胞分析中将它们的抗菌活性与母体异亮氨酰氨磺酰基腺苷（Ile-SA）进行了比较。令人惊讶地，发现含有尿嘧啶类似物的最强的体外抑制作用16楼。不幸的是，由于低吸收，仅发现非常弱的生长抑制特性。根据先前的文献发现对结果进行讨论。
• Ceric Ammonium Nitrate on Silica Gel for Efficient and Selective Removal of Trityl and Silyl Groups
  作者：Jih Ru Hwu、Moti L. Jain、Fu-Yuan Tsai、Shwu-Chen Tsay、Arumugham Balakumar、Gholam H. Hakimelahi

  DOI：10.1021/jo000024o

  日期：2000.8.1

  triisopropylsilyl group from a primary hydroxyl functionality in di- or trisilyl ethers of ribonucleosides. A comparative study of deprotection reactions by utilization of CAN alone or CAN-SiO2 indicates a remarkable increase in the rate of the reactions involving a solid support. The mechanism of electron-transfer processes is proposed for the use of CAN-SiO2 in the removal of these protective groups from organic

  发现硅胶负载的硝酸铈铵（CAN-SiO2）在温和条件下可从受保护的核苷和核苷酸中快速选择性地裂解三苯甲基（Tr），单甲氧基三苯甲基（MMTr）和二甲氧基三苯甲基（DMTr）基团。脱保护的效率取决于所得碳阳离子物质的稳定性：DMTr +> MMTr +> Tr +。使用催化量的这种固体负载的试剂还可以有效地和选择性地从核糖核苷的二或三甲硅烷基醚中的伯羟基官能团中除去叔丁基二甲基甲硅烷基或三异丙基甲硅烷基。通过单独使用CAN或CAN-SiO2进行脱保护反应的比较研究表明，涉及固相支持物的反应速率显着提高。
• Facile and highly selective 5′-desilylation of multisilylated nucleosides
  作者：Xue-Feng Zhu、Howard J. Williams、A. Ian Scott

  DOI：10.1039/b003562i

  日期：——

  Efficient methods for selective 5'-desilylation of multisilylated nucleosides are described.

  介绍了选择性地对多硅烷基化核苷进行 5'-去硅烷基化的高效方法。
• Dess–Martin periodinane-mediated oxidation of the primary alcohol of cytidine into a carboxylic acid
  作者：Alexandra R. E. Serre、Vibhu Jha、Adèle Rivault、Leif A. Eriksson、Goreti Ribeiro Morais、Robert A. Falconer

  DOI：10.1039/d4ob00240g

  日期：——

  alcohols into carboxylic acids by use of the Dess–Martin Periodinane (DMP), which is otherwise routinely employed for the conversion to aldehydes, is reported. This methodology will have significant potential utility in the synthesis of cytidine analogues and other related biologically important molecules.

  本文报道了使用戴斯-马丁高碘烷 (DMP) 将醇转化为羧酸的第一个例子，该方法通常用于转化为醛。该方法将在胞苷类似物和其他相关的生物学重要分子的合成中具有显着的潜在用途。
• Noyori, Ryoji; Uchiyama, Mamoru; Nobori, Tadahito, Australian Journal of Chemistry, 1992, vol. 45, # 1, p. 205 - 225
  作者：Noyori, Ryoji、Uchiyama, Mamoru、Nobori, Tadahito、Hirose, Masaaki、Hayakawa, Yoshihiro

  DOI：——

  日期：——