Synthesis of new 13-diphenylalkyl analogues of berberine and elucidation of their base pair specificity and energetics of DNA binding
摘要:
设计并合成了一系列 13-二苯基烷基小檗碱衍生物,并使用一种天然 DNA 多核苷酸和两种合成 DNA 多核苷酸评估了它们的碱基特异性和 DNA 结合能。生物物理评估结果表明,在小檗碱的 13 位添加二苯基烷基链可显著提高与 DNA 的结合能力。结合结果清楚地表明,与交替的 GC 序列相比,类似物更倾向于交替的 AT 序列。在所有情况下,结合亲和力随着链长的增加而增强,直到临界长度(CH2)3,之后结合亲和力下降。结果还表明,这些小檗碱类似物具有腺嘌呤-胸腺嘧啶(AT)碱基特异性,异喹啉发色团 13 位侧链的长度是调节结合亲和力的关键。