6-dimethylamino-9-[3-(p-azido-L-beta-phenylalanylamino)-3-deoxy-beta-ribofuranosyl]purine | 67607-41-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 6-dimethylamino-9-[3-(p-azido-L-beta-phenylalanylamino)-3-deoxy-beta-ribofuranosyl]purine
• 英文别名: 4-Azidopuromycin；(2S)-2-amino-3-(4-azidophenyl)-N-[(2S,3S,4R,5R)-5-[6-(dimethylamino)purin-9-yl]-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]propanamide
• CAS: 67607-41-4
• 化学式: C₂₁H₂₆N₁₀O₄
• 分子量: 482.502
• InChiKey: CJEWMVCPQUAUKL-YXDKPKCJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  166
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  Boc-4-叠氮-Phe-OH 在 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 6-dimethylamino-9-[3-(p-azido-L-beta-phenylalanylamino)-3-deoxy-beta-ribofuranosyl]purine
  参考文献：
  名称：

  嘌呤霉素类似物能够在活细胞和神经元中进行多重成像和蛋白质合成及动力学分析

  摘要：

  新合成的蛋白质构成了每个细胞过程中所涉及的蛋白质组的重要子集，但是用于研究它们的现有化学工具却存在重大缺陷。在此，我们报告了一套能够渗透细胞的嘌呤霉素类似物，它们能够通过代谢整合到不同哺乳动物细胞（包括神经元细胞）中的新合成蛋白质中。随后在固定细胞和活细胞中均用合适的生物正交报道分子进行标记，可以对这些蛋白质进行直接成像和富集。通过利用这些类似物的相互正交的反应性，我们显示了在活细胞环境中可以实现不同蛋白质群体的多重标记，以及通过荧光相关光谱法对蛋白质动力学的定量测量。

  DOI：

  10.1002/anie.201511030

文献信息

• Use of lambda-gam protein in ribosomal display technology
  申请人：SUTRO BIOPHARMA, INC.

  公开号：US10731148B2

  公开（公告）日：2020-08-04

  Methods and systems for increasing the stability of a nucleic acid template that encodes a protein of interest in a cell free translation system or a ribosomal display reaction system are described. In some embodiments, the nucleic acid template is an RNA or mRNA. The stability of the RNA template is increased by adding the bacteriophage lambda protein Gam to the cell free extract used in the translation system. The addition of Gam protein increases the longevity of the reaction system, thereby increasing the efficiency of the ribosomal display reaction system.

  本文描述了在细胞自由翻译系统或核糖体显示反应系统中提高编码相关蛋白质的核酸模板稳定性的方法和系统。在某些实施方案中，核酸模板是 RNA 或 mRNA。在翻译系统中使用的无细胞提取物中加入噬菌体λ蛋白 Gam，可增加 RNA 模板的稳定性。Gam 蛋白的加入增加了反应系统的寿命，从而提高了核糖体显示反应系统的效率。
• THE USE OF LAMBDA-GAM PROTEIN IN RIBOSOMAL DISPLAY TECHNOLOGY
  申请人：Sutro Biopharma, Inc.

  公开号：EP2989202B1

  公开（公告）日：2019-04-10
• SELECTION OF FAB FRAGMENTS USING RIBOSOMAL DISPLAY TECHNOLOGY
  申请人：Sutro Biopharma, Inc.

  公开号：EP2989239A2

  公开（公告）日：2016-03-02
• USE OF LAMBDA-GAM PROTEIN IN RIBOSOMAL DISPLAY TECHNOLOGY
  申请人：SUTRO BIOPHARMA, INC.

  公开号：US20180142232A1

  公开（公告）日：2018-05-24

  Methods and systems for increasing the stability of a nucleic acid template that encodes a protein of interest in a cell free translation system or a ribosomal display reaction system are described. In some embodiments, the nucleic acid template is an RNA or mRNA. The stability of the RNA template is increased by adding the bacteriophage lambda protein Gam to the cell free extract used in the translation system. The addition of Gam protein increases the longevity of the reaction system, thereby increasing the efficiency of the ribosomal display reaction system.
• TARGET BINDING MOIETY COMPOSITIONS AND METHODS OF USE
  申请人：Rootpath Genomics, Inc.

  公开号：US20210071169A1

  公开（公告）日：2021-03-11

  Provided herein are compositions and methods to identify a binding element (e.g., peptide, peptoid, or protein) that can be bound by an immunoreceptor (e.g., antibody). The binding element can be provided in a target binding unit comprising two binding elements separated by a spacer such that the two binding elements simultaneously bind to a single molecule comprising an antigen binding domain of an antibody. The present disclosure provides various methods to construct the spacer. The identified binding elements can be further used to manufacture an array which can be used to profile antibodies obtained from a blood sample.